RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000433927.1

ELL3-202, Transcript of elongation factor for RNA polymerase II 3, humanhuman

TSL 5

Gene ELL3, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3-202ENST00000433927 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.67■■■■■ 5.7
ELL3-202ENST00000433927 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45.46■■■■■ 4.87
ELL3-202ENST00000433927 ABCC9O60706 1549 aa45.37■■■■■ 4.85
ELL3-202ENST00000433927 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.26■■■■■ 4.52
ELL3-202ENST00000433927 NACADO15069 1562 aa42.99■■■■■ 4.47
ELL3-202ENST00000433927 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.8■■■■■ 4.44
ELL3-202ENST00000433927 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.47■■■■■ 4.39
ELL3-202ENST00000433927 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.41■■■■■ 4.38
ELL3-202ENST00000433927 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.26■■■■■ 4.36
ELL3-202ENST00000433927 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.23■■■■■ 4.35
ELL3-202ENST00000433927 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.99■■■■■ 4.31
ELL3-202ENST00000433927 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.93■■■■■ 4.3
ELL3-202ENST00000433927 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.88■■■■■ 4.29
ELL3-202ENST00000433927 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.45■■■■■ 4.23
ELL3-202ENST00000433927 SCRIBQ14160 1630 aa41.4■■■■■ 4.22
ELL3-202ENST00000433927 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41■■■■■ 4.15
ELL3-202ENST00000433927 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.93■■■■■ 4.14
ELL3-202ENST00000433927 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.89■■■■■ 4.14
ELL3-202ENST00000433927 NCAPD3P42695 1498 aa39.67■■■■□ 3.94
ELL3-202ENST00000433927 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.54■■■■□ 3.92
ELL3-202ENST00000433927 SMARCA4P51532 1647 aa39.51■■■■□ 3.91
ELL3-202ENST00000433927 SMARCA2P51531 1590 aa39.46■■■■□ 3.91
ELL3-202ENST00000433927 HMGXB3Q12766 1538 aa39.37■■■■□ 3.89
ELL3-202ENST00000433927 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.35■■■■□ 3.89
ELL3-202ENST00000433927 ERCC6Q03468 1493 aa39.22■■■■□ 3.87
ELL3-202ENST00000433927 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.17■■■■□ 3.86
ELL3-202ENST00000433927 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.12■■■■□ 3.85
ELL3-202ENST00000433927 CUX2O14529 1486 aa39.12■■■■□ 3.85
ELL3-202ENST00000433927 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.03■■■■□ 3.84
ELL3-202ENST00000433927 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.01■■■■□ 3.84
ELL3-202ENST00000433927 NESP48681 1621 aa38.97■■■■□ 3.83
ELL3-202ENST00000433927 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.77■■■■□ 3.8
ELL3-202ENST00000433927 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.57■■■■□ 3.77
ELL3-202ENST00000433927 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.57■■■■□ 3.76
ELL3-202ENST00000433927 WIZO95785 1651 aa38.56■■■■□ 3.76
ELL3-202ENST00000433927 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.49■■■■□ 3.75
ELL3-202ENST00000433927 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.47■■■■□ 3.75
ELL3-202ENST00000433927 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.24■■■■□ 3.71
ELL3-202ENST00000433927 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.2■■■■□ 3.71
ELL3-202ENST00000433927 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.1■■■■□ 3.69
ELL3-202ENST00000433927 WDR62O43379 1518 aa38.08■■■■□ 3.69
ELL3-202ENST00000433927 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.07■■■■□ 3.68
ELL3-202ENST00000433927 CFTRP13569 1480 aa38.03■■■■□ 3.68
ELL3-202ENST00000433927 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.02■■■■□ 3.68
ELL3-202ENST00000433927 PRDM2Q13029 1718 aa37.67■■■■□ 3.62
ELL3-202ENST00000433927 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.66■■■■□ 3.62
ELL3-202ENST00000433927 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.66■■■■□ 3.62
ELL3-202ENST00000433927 OSCARQ8IYS5 282 aa37.38■■■■□ 3.57
ELL3-202ENST00000433927 TRIM41Q8WV44 630 aa37.35■■■■□ 3.57
ELL3-202ENST00000433927 IFT140Q96RY7 1462 aa37.31■■■■□ 3.56
ELL3-202ENST00000433927 TOPBP1Q92547 1522 aa37.3■■■■□ 3.56
ELL3-202ENST00000433927 ABCC8Q09428 1581 aa37.29■■■■□ 3.56
ELL3-202ENST00000433927 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.2■■■■□ 3.55
ELL3-202ENST00000433927 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.17■■■■□ 3.54
ELL3-202ENST00000433927 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37■■■■□ 3.51
ELL3-202ENST00000433927 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.95■■■■□ 3.51
ELL3-202ENST00000433927 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.92■■■■□ 3.5
ELL3-202ENST00000433927 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.89■■■■□ 3.5
ELL3-202ENST00000433927 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.82■■■■□ 3.49
ELL3-202ENST00000433927 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.82■■■■□ 3.49
ELL3-202ENST00000433927 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.82■■■■□ 3.49
ELL3-202ENST00000433927 SOGA1O94964 1423 aa36.78■■■■□ 3.48
ELL3-202ENST00000433927 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.77■■■■□ 3.48
ELL3-202ENST00000433927 CHD1O14646 1710 aa36.73■■■■□ 3.47
ELL3-202ENST00000433927 ARHGEF11O15085 1522 aa36.71■■■■□ 3.47
ELL3-202ENST00000433927 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.69■■■■□ 3.46
ELL3-202ENST00000433927 FBLN2P98095 1184 aa36.69■■■■□ 3.46
ELL3-202ENST00000433927 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.67■■■■□ 3.46
ELL3-202ENST00000433927 CUX1P39880 1505 aa36.66■■■■□ 3.46
ELL3-202ENST00000433927 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.64■■■■□ 3.46
ELL3-202ENST00000433927 WDR97A6NE52 1622 aa36.63■■■■□ 3.45
ELL3-202ENST00000433927 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.52■■■■□ 3.44
ELL3-202ENST00000433927 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.49■■■■□ 3.43
ELL3-202ENST00000433927 GRIN2BQ13224 1484 aa36.45■■■■□ 3.43
ELL3-202ENST00000433927 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.45■■■■□ 3.43
ELL3-202ENST00000433927 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.44■■■■□ 3.42
ELL3-202ENST00000433927 ARAP1Q96P48 1450 aa36.34■■■■□ 3.41
ELL3-202ENST00000433927 SYNJ1O43426 1573 aa36.34■■■■□ 3.41
ELL3-202ENST00000433927 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.33■■■■□ 3.41
ELL3-202ENST00000433927 SYNJ2O15056 1496 aa36.32■■■■□ 3.41
ELL3-202ENST00000433927 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.3■■■■□ 3.4
ELL3-202ENST00000433927 PBRM1Q86U86 1689 aa36.29■■■■□ 3.4
ELL3-202ENST00000433927 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.29■■■■□ 3.4
ELL3-202ENST00000433927 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.22■■■■□ 3.39
ELL3-202ENST00000433927 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.19■■■■□ 3.38
ELL3-202ENST00000433927 TOP2BQ02880 1626 aa36.12■■■■□ 3.37
ELL3-202ENST00000433927 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.11■■■■□ 3.37
ELL3-202ENST00000433927 TRHP20396 242 aaPredicted RBP36.09■■■■□ 3.37
ELL3-202ENST00000433927 GRIN2AQ12879 1464 aa35.97■■■■□ 3.35
ELL3-202ENST00000433927 ADAMTS12P58397 1594 aa35.94■■■■□ 3.34
ELL3-202ENST00000433927 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.88■■■■□ 3.33
ELL3-202ENST00000433927 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.86■■■■□ 3.33
ELL3-202ENST00000433927 NUP160Q12769 1436 aa35.84■■■■□ 3.33
ELL3-202ENST00000433927 CEP170Q5SW79 1584 aa35.81■■■■□ 3.32
ELL3-202ENST00000433927 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.71■■■■□ 3.31
ELL3-202ENST00000433927 SHROOM2Q13796 1616 aa35.67■■■■□ 3.3
ELL3-202ENST00000433927 JPH4Q96JJ6 628 aa35.52■■■■□ 3.28
ELL3-202ENST00000433927 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP35.5■■■■□ 3.27
ELL3-202ENST00000433927 KIF27Q86VH2 1401 aa35.45■■■■□ 3.27
ELL3-202ENST00000433927 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.42■■■■□ 3.26
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