RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000433650.5

SEMA4D-210, Transcript of semaphorin 4D, humanhuman

TSL 3

Gene SEMA4D, Length 602 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4D-210ENST00000433650 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.2■■■■□ 3.07
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SEMA4D-210ENST00000433650 SMARCA2P51531 1590 aa26.71■■□□□ 1.87
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SEMA4D-210ENST00000433650 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.32■■□□□ 1.8
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SEMA4D-210ENST00000433650 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.95■■□□□ 1.75
SEMA4D-210ENST00000433650 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.9■■□□□ 1.74
SEMA4D-210ENST00000433650 WDR62O43379 1518 aa25.89■■□□□ 1.74
SEMA4D-210ENST00000433650 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.78■■□□□ 1.72
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SEMA4D-210ENST00000433650 PRDM2Q13029 1718 aa25.72■■□□□ 1.71
SEMA4D-210ENST00000433650 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.71■■□□□ 1.71
SEMA4D-210ENST00000433650 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
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SEMA4D-210ENST00000433650 TOPBP1Q92547 1522 aa25.24■■□□□ 1.63
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SEMA4D-210ENST00000433650 OSCARQ8IYS5 282 aa25.23■■□□□ 1.63
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SEMA4D-210ENST00000433650 ARHGEF11O15085 1522 aa25■■□□□ 1.59
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SEMA4D-210ENST00000433650 WDR97A6NE52 1622 aa24.86■■□□□ 1.57
SEMA4D-210ENST00000433650 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.83■■□□□ 1.57
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SEMA4D-210ENST00000433650 CUX1P39880 1505 aa24.78■■□□□ 1.56
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SEMA4D-210ENST00000433650 ARAP1Q96P48 1450 aa24.74■■□□□ 1.55
SEMA4D-210ENST00000433650 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.73■■□□□ 1.55
SEMA4D-210ENST00000433650 PBRM1Q86U86 1689 aa24.72■■□□□ 1.55
SEMA4D-210ENST00000433650 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
SEMA4D-210ENST00000433650 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.69■■□□□ 1.54
SEMA4D-210ENST00000433650 FBLN2P98095 1184 aa24.68■■□□□ 1.54
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SEMA4D-210ENST00000433650 SYNJ1O43426 1573 aa24.66■■□□□ 1.54
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SEMA4D-210ENST00000433650 GRIN2BQ13224 1484 aa24.62■■□□□ 1.53
SEMA4D-210ENST00000433650 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.58■■□□□ 1.53
SEMA4D-210ENST00000433650 SYNJ2O15056 1496 aa24.58■■□□□ 1.52
SEMA4D-210ENST00000433650 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.52■■□□□ 1.52
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SEMA4D-210ENST00000433650 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.46■■□□□ 1.51
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SEMA4D-210ENST00000433650 ADAMTS12P58397 1594 aa24.4■■□□□ 1.5
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SEMA4D-210ENST00000433650 GRIN2AQ12879 1464 aa24.34■■□□□ 1.49
SEMA4D-210ENST00000433650 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.34■■□□□ 1.49
SEMA4D-210ENST00000433650 CEP170Q5SW79 1584 aa24.31■■□□□ 1.48
SEMA4D-210ENST00000433650 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.27■■□□□ 1.48
SEMA4D-210ENST00000433650 SHROOM2Q13796 1616 aa24.27■■□□□ 1.48
SEMA4D-210ENST00000433650 NUP160Q12769 1436 aa24.25■■□□□ 1.47
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SEMA4D-210ENST00000433650 CUL7Q14999 1698 aa23.94■■□□□ 1.42
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