RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430258.2

RPL18AP15-201, Transcript of ribosomal protein L18a pseudogene 15, humanhuman

BASIC

Gene RPL18AP15, Length 517 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL18AP15-201ENST00000430258 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.56■■■□□ 2.64
RPL18AP15-201ENST00000430258 ABCC9O60706 1549 aa28.63■■■□□ 2.17
RPL18AP15-201ENST00000430258 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.5■■■□□ 2.15
RPL18AP15-201ENST00000430258 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.22■■□□□ 1.95
RPL18AP15-201ENST00000430258 NACADO15069 1562 aa26.97■■□□□ 1.91
RPL18AP15-201ENST00000430258 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.91■■□□□ 1.9
RPL18AP15-201ENST00000430258 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.69■■□□□ 1.86
RPL18AP15-201ENST00000430258 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.55■■□□□ 1.84
RPL18AP15-201ENST00000430258 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.54■■□□□ 1.84
RPL18AP15-201ENST00000430258 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.52■■□□□ 1.84
RPL18AP15-201ENST00000430258 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.35■■□□□ 1.81
RPL18AP15-201ENST00000430258 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
RPL18AP15-201ENST00000430258 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.12■■□□□ 1.77
RPL18AP15-201ENST00000430258 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.1■■□□□ 1.77
RPL18AP15-201ENST00000430258 SCRIBQ14160 1630 aa25.89■■□□□ 1.74
RPL18AP15-201ENST00000430258 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.86■■□□□ 1.73
RPL18AP15-201ENST00000430258 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.84■■□□□ 1.73
RPL18AP15-201ENST00000430258 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
RPL18AP15-201ENST00000430258 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.97■■□□□ 1.59
RPL18AP15-201ENST00000430258 NCAPD3P42695 1498 aa24.85■■□□□ 1.57
RPL18AP15-201ENST00000430258 CUX2O14529 1486 aa24.83■■□□□ 1.57
RPL18AP15-201ENST00000430258 ERCC6Q03468 1493 aa24.81■■□□□ 1.56
RPL18AP15-201ENST00000430258 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.74■■□□□ 1.55
RPL18AP15-201ENST00000430258 SMARCA2P51531 1590 aa24.73■■□□□ 1.55
RPL18AP15-201ENST00000430258 HMGXB3Q12766 1538 aa24.71■■□□□ 1.55
RPL18AP15-201ENST00000430258 SMARCA4P51532 1647 aa24.69■■□□□ 1.54
RPL18AP15-201ENST00000430258 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
RPL18AP15-201ENST00000430258 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
RPL18AP15-201ENST00000430258 NESP48681 1621 aa24.49■■□□□ 1.51
RPL18AP15-201ENST00000430258 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.46■■□□□ 1.51
RPL18AP15-201ENST00000430258 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.38■■□□□ 1.49
RPL18AP15-201ENST00000430258 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
RPL18AP15-201ENST00000430258 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.29■■□□□ 1.48
RPL18AP15-201ENST00000430258 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.25■■□□□ 1.47
RPL18AP15-201ENST00000430258 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.22■■□□□ 1.47
RPL18AP15-201ENST00000430258 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.09■■□□□ 1.45
RPL18AP15-201ENST00000430258 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.05■■□□□ 1.44
RPL18AP15-201ENST00000430258 WDR62O43379 1518 aa24■■□□□ 1.43
RPL18AP15-201ENST00000430258 WIZO95785 1651 aa23.99■■□□□ 1.43
RPL18AP15-201ENST00000430258 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.92■■□□□ 1.42
RPL18AP15-201ENST00000430258 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.83■■□□□ 1.41
RPL18AP15-201ENST00000430258 TRIM41Q8WV44 630 aa23.8■■□□□ 1.4
RPL18AP15-201ENST00000430258 CFTRP13569 1480 aa23.78■■□□□ 1.4
RPL18AP15-201ENST00000430258 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
RPL18AP15-201ENST00000430258 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
RPL18AP15-201ENST00000430258 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
RPL18AP15-201ENST00000430258 OSCARQ8IYS5 282 aa23.6■■□□□ 1.37
RPL18AP15-201ENST00000430258 PRDM2Q13029 1718 aa23.57■■□□□ 1.36
RPL18AP15-201ENST00000430258 IFT140Q96RY7 1462 aa23.44■■□□□ 1.34
RPL18AP15-201ENST00000430258 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.4■■□□□ 1.34
RPL18AP15-201ENST00000430258 TOPBP1Q92547 1522 aa23.35■■□□□ 1.33
RPL18AP15-201ENST00000430258 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
RPL18AP15-201ENST00000430258 ABCC8Q09428 1581 aa23.35■■□□□ 1.33
RPL18AP15-201ENST00000430258 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.33■■□□□ 1.33
RPL18AP15-201ENST00000430258 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.33■■□□□ 1.33
RPL18AP15-201ENST00000430258 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.33■■□□□ 1.33
RPL18AP15-201ENST00000430258 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
RPL18AP15-201ENST00000430258 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.28■■□□□ 1.32
RPL18AP15-201ENST00000430258 ARHGEF11O15085 1522 aa23.25■■□□□ 1.31
RPL18AP15-201ENST00000430258 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
RPL18AP15-201ENST00000430258 CHD1O14646 1710 aa23.13■■□□□ 1.29
RPL18AP15-201ENST00000430258 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.11■■□□□ 1.29
RPL18AP15-201ENST00000430258 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
RPL18AP15-201ENST00000430258 FBLN2P98095 1184 aa23.03■■□□□ 1.28
RPL18AP15-201ENST00000430258 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.03■■□□□ 1.28
RPL18AP15-201ENST00000430258 WDR97A6NE52 1622 aa23■■□□□ 1.27
RPL18AP15-201ENST00000430258 ARAP1Q96P48 1450 aa22.98■■□□□ 1.27
RPL18AP15-201ENST00000430258 SOGA1O94964 1423 aa22.98■■□□□ 1.27
RPL18AP15-201ENST00000430258 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.98■■□□□ 1.27
RPL18AP15-201ENST00000430258 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
RPL18AP15-201ENST00000430258 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.92■■□□□ 1.26
RPL18AP15-201ENST00000430258 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.92■■□□□ 1.26
RPL18AP15-201ENST00000430258 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
RPL18AP15-201ENST00000430258 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
RPL18AP15-201ENST00000430258 SYNJ1O43426 1573 aa22.89■■□□□ 1.25
RPL18AP15-201ENST00000430258 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.86■■□□□ 1.25
RPL18AP15-201ENST00000430258 GRIN2BQ13224 1484 aa22.85■■□□□ 1.25
RPL18AP15-201ENST00000430258 CUX1P39880 1505 aa22.84■■□□□ 1.25
RPL18AP15-201ENST00000430258 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
RPL18AP15-201ENST00000430258 SYNJ2O15056 1496 aa22.79■■□□□ 1.24
RPL18AP15-201ENST00000430258 PBRM1Q86U86 1689 aa22.74■■□□□ 1.23
RPL18AP15-201ENST00000430258 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.72■■□□□ 1.23
RPL18AP15-201ENST00000430258 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.67■■□□□ 1.22
RPL18AP15-201ENST00000430258 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.66■■□□□ 1.22
RPL18AP15-201ENST00000430258 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.54■■□□□ 1.2
RPL18AP15-201ENST00000430258 GRIN2AQ12879 1464 aa22.54■■□□□ 1.2
RPL18AP15-201ENST00000430258 ADAMTS12P58397 1594 aa22.52■■□□□ 1.2
RPL18AP15-201ENST00000430258 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.47■■□□□ 1.19
RPL18AP15-201ENST00000430258 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
RPL18AP15-201ENST00000430258 NUP160Q12769 1436 aa22.46■■□□□ 1.19
RPL18AP15-201ENST00000430258 TOP2BQ02880 1626 aa22.46■■□□□ 1.19
RPL18AP15-201ENST00000430258 CEP170Q5SW79 1584 aa22.45■■□□□ 1.18
RPL18AP15-201ENST00000430258 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.43■■□□□ 1.18
RPL18AP15-201ENST00000430258 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
RPL18AP15-201ENST00000430258 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.42■■□□□ 1.18
RPL18AP15-201ENST00000430258 SHROOM2Q13796 1616 aa22.4■■□□□ 1.18
RPL18AP15-201ENST00000430258 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.4■■□□□ 1.18
RPL18AP15-201ENST00000430258 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
RPL18AP15-201ENST00000430258 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.21■■□□□ 1.15
RPL18AP15-201ENST00000430258 KIF13AQ9H1H9 1805 aa22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.6 ms