RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429755.8

HOXB-AS3-201, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 2

Gene HOXB-AS3, Length 435 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-201ENST00000429755 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.43■■■■□ 3.74
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HOXB-AS3-201ENST00000429755 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.74■■■□□ 2.83
HOXB-AS3-201ENST00000429755 NACADO15069 1562 aa32.59■■■□□ 2.81
HOXB-AS3-201ENST00000429755 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.33■■■□□ 2.77
HOXB-AS3-201ENST00000429755 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.29■■■□□ 2.76
HOXB-AS3-201ENST00000429755 DNAJC5BQ9UF47 199 aa32.03■■■□□ 2.72
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.89■■■□□ 2.7
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HOXB-AS3-201ENST00000429755 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.84■■■□□ 2.69
HOXB-AS3-201ENST00000429755 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.82■■■□□ 2.68
HOXB-AS3-201ENST00000429755 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.69■■■□□ 2.66
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.5■■■□□ 2.63
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SCRIBQ14160 1630 aa31.21■■■□□ 2.59
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.94■■■□□ 2.54
HOXB-AS3-201ENST00000429755 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.93■■■□□ 2.54
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.89■■■□□ 2.53
HOXB-AS3-201ENST00000429755 NCAPD3P42695 1498 aa30.12■■■□□ 2.41
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.96■■■□□ 2.39
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SMARCA2P51531 1590 aa29.91■■■□□ 2.38
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SMARCA4P51532 1647 aa29.89■■■□□ 2.38
HOXB-AS3-201ENST00000429755 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.85■■■□□ 2.37
HOXB-AS3-201ENST00000429755 HMGXB3Q12766 1538 aa29.83■■■□□ 2.37
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.71■■■□□ 2.35
HOXB-AS3-201ENST00000429755 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CUX2O14529 1486 aa29.59■■■□□ 2.33
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ERCC6Q03468 1493 aa29.58■■■□□ 2.33
HOXB-AS3-201ENST00000429755 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.53■■■□□ 2.32
HOXB-AS3-201ENST00000429755 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.47■■■□□ 2.31
HOXB-AS3-201ENST00000429755 NESP48681 1621 aa29.39■■■□□ 2.3
HOXB-AS3-201ENST00000429755 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.36■■■□□ 2.29
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.24■■■□□ 2.27
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.19■■■□□ 2.26
HOXB-AS3-201ENST00000429755 WIZO95785 1651 aa29.13■■■□□ 2.25
HOXB-AS3-201ENST00000429755 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
HOXB-AS3-201ENST00000429755 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
HOXB-AS3-201ENST00000429755 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.99■■■□□ 2.23
HOXB-AS3-201ENST00000429755 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.9■■■□□ 2.22
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CFTRP13569 1480 aa28.86■■■□□ 2.21
HOXB-AS3-201ENST00000429755 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
HOXB-AS3-201ENST00000429755 WDR62O43379 1518 aa28.81■■■□□ 2.2
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.79■■■□□ 2.2
HOXB-AS3-201ENST00000429755 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.77■■■□□ 2.2
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.54■■■□□ 2.16
HOXB-AS3-201ENST00000429755 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PRDM2Q13029 1718 aa28.45■■■□□ 2.14
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ABCC8Q09428 1581 aa28.34■■■□□ 2.13
HOXB-AS3-201ENST00000429755 OSCARQ8IYS5 282 aa28.32■■■□□ 2.12
HOXB-AS3-201ENST00000429755 IFT140Q96RY7 1462 aa28.27■■■□□ 2.12
HOXB-AS3-201ENST00000429755 TOPBP1Q92547 1522 aa28.23■■■□□ 2.11
HOXB-AS3-201ENST00000429755 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.14■■■□□ 2.1
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
HOXB-AS3-201ENST00000429755 TRIM41Q8WV44 630 aa28.05■■■□□ 2.08
HOXB-AS3-201ENST00000429755 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.95■■■□□ 2.06
HOXB-AS3-201ENST00000429755 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.95■■■□□ 2.06
HOXB-AS3-201ENST00000429755 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
HOXB-AS3-201ENST00000429755 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.89■■■□□ 2.05
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SOGA1O94964 1423 aa27.88■■■□□ 2.05
HOXB-AS3-201ENST00000429755 WDR97A6NE52 1622 aa27.81■■■□□ 2.04
HOXB-AS3-201ENST00000429755 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.78■■■□□ 2.04
HOXB-AS3-201ENST00000429755 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.76■■■□□ 2.04
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.03
HOXB-AS3-201ENST00000429755 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.75■■■□□ 2.03
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CUX1P39880 1505 aa27.73■■■□□ 2.03
HOXB-AS3-201ENST00000429755 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.72■■■□□ 2.03
HOXB-AS3-201ENST00000429755 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.72■■■□□ 2.03
HOXB-AS3-201ENST00000429755 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.72■■■□□ 2.03
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ARHGEF11O15085 1522 aa27.71■■■□□ 2.03
HOXB-AS3-201ENST00000429755 FBLN2P98095 1184 aa27.69■■■□□ 2.02
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CHD1O14646 1710 aa27.65■■■□□ 2.02
HOXB-AS3-201ENST00000429755 GRIN2BQ13224 1484 aa27.63■■■□□ 2.01
HOXB-AS3-201ENST00000429755 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.63■■■□□ 2.01
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HOXB-AS3-201ENST00000429755 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.57■■■□□ 2
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27.54■■■□□ 2
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.53■■■□□ 2
HOXB-AS3-201ENST00000429755 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.52■■■□□ 2
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SYNJ2O15056 1496 aa27.51■■■□□ 2
HOXB-AS3-201ENST00000429755 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.48■■□□□ 1.99
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SYNJ1O43426 1573 aa27.47■■□□□ 1.99
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.44■■□□□ 1.98
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ARAP1Q96P48 1450 aa27.41■■□□□ 1.98
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.39■■□□□ 1.98
HOXB-AS3-201ENST00000429755 TOP2BQ02880 1626 aa27.38■■□□□ 1.97
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PBRM1Q86U86 1689 aa27.36■■□□□ 1.97
HOXB-AS3-201ENST00000429755 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.35■■□□□ 1.97
HOXB-AS3-201ENST00000429755 GRIN2AQ12879 1464 aa27.23■■□□□ 1.95
HOXB-AS3-201ENST00000429755 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.22■■□□□ 1.95
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.21■■□□□ 1.95
HOXB-AS3-201ENST00000429755 TRHP20396 242 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
HOXB-AS3-201ENST00000429755 NUP160Q12769 1436 aa27.17■■□□□ 1.94
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ADAMTS12P58397 1594 aa27.16■■□□□ 1.94
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CEP170Q5SW79 1584 aa27.05■■□□□ 1.92
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SHROOM2Q13796 1616 aa26.99■■□□□ 1.91
HOXB-AS3-201ENST00000429755 JPH4Q96JJ6 628 aa26.95■■□□□ 1.9
HOXB-AS3-201ENST00000429755 KIF27Q86VH2 1401 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.91■■□□□ 1.9
HOXB-AS3-201ENST00000429755 IGF1RP08069 1367 aa26.9■■□□□ 1.9
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
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