RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429055.1

SRGAP2-AS1-201, SRGAP2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene SRGAP2-AS1, Length 408 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2-AS1-201ENST00000429055 NISCHQ9Y2I1 1504 aa21.39■■□□□ 1.01
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SRGAP2-AS1-201ENST00000429055 SMARCA2P51531 1590 aa16.77■□□□□ 0.28
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SRGAP2-AS1-201ENST00000429055 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa16.62■□□□□ 0.25
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SRGAP2-AS1-201ENST00000429055 MRC2Q9UBG0 1479 aa16.37■□□□□ 0.21
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SRGAP2-AS1-201ENST00000429055 CEP164Q9UPV0 1460 aa16.24■□□□□ 0.19
SRGAP2-AS1-201ENST00000429055 FANCD2Q9BXW9 1451 aa16.18■□□□□ 0.18
SRGAP2-AS1-201ENST00000429055 PRDM2Q13029 1718 aa16.15■□□□□ 0.18
SRGAP2-AS1-201ENST00000429055 CFTRP13569 1480 aa16.13■□□□□ 0.17
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SRGAP2-AS1-201ENST00000429055 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa16.04■□□□□ 0.16
SRGAP2-AS1-201ENST00000429055 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa16.04■□□□□ 0.16
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SRGAP2-AS1-201ENST00000429055 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa15.59■□□□□ 0.09
SRGAP2-AS1-201ENST00000429055 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa15.59■□□□□ 0.09
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SRGAP2-AS1-201ENST00000429055 SOGA1O94964 1423 aa15.52■□□□□ 0.08
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SRGAP2-AS1-201ENST00000429055 ERCC6L2Q5T890 1561 aa15.36■□□□□ 0.05
SRGAP2-AS1-201ENST00000429055 ADAMTS12P58397 1594 aa15.35■□□□□ 0.05
SRGAP2-AS1-201ENST00000429055 CEP170Q5SW79 1584 aa15.32■□□□□ 0.04
SRGAP2-AS1-201ENST00000429055 SHROOM2Q13796 1616 aa15.32■□□□□ 0.04
SRGAP2-AS1-201ENST00000429055 GRIN2AQ12879 1464 aa15.31■□□□□ 0.04
SRGAP2-AS1-201ENST00000429055 KIF13AQ9H1H9 1805 aa15.29■□□□□ 0.04
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SRGAP2-AS1-201ENST00000429055 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa15.27■□□□□ 0.03
SRGAP2-AS1-201ENST00000429055 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
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SRGAP2-AS1-201ENST00000429055 DIP2BQ9P265 1576 aa15.09■□□□□ 0.01
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