RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428978.1

TULP1-204, Transcript of tubby like protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene TULP1, Length 492 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP1-204ENST00000428978 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.52■■■■□ 3.12
TULP1-204ENST00000428978 ABCC9O60706 1549 aa31.81■■■□□ 2.68
TULP1-204ENST00000428978 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa31.23■■■□□ 2.59
TULP1-204ENST00000428978 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.42■■■□□ 2.46
TULP1-204ENST00000428978 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.02■■■□□ 2.4
TULP1-204ENST00000428978 NACADO15069 1562 aa29.68■■■□□ 2.34
TULP1-204ENST00000428978 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.54■■■□□ 2.32
TULP1-204ENST00000428978 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.39■■■□□ 2.3
TULP1-204ENST00000428978 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.39■■■□□ 2.3
TULP1-204ENST00000428978 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.19■■■□□ 2.26
TULP1-204ENST00000428978 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.07■■■□□ 2.24
TULP1-204ENST00000428978 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.72■■■□□ 2.19
TULP1-204ENST00000428978 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.72■■■□□ 2.19
TULP1-204ENST00000428978 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.71■■■□□ 2.19
TULP1-204ENST00000428978 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
TULP1-204ENST00000428978 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.48■■■□□ 2.15
TULP1-204ENST00000428978 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
TULP1-204ENST00000428978 SCRIBQ14160 1630 aa28.4■■■□□ 2.14
TULP1-204ENST00000428978 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.37■■■□□ 2.13
TULP1-204ENST00000428978 CUX2O14529 1486 aa27.67■■■□□ 2.02
TULP1-204ENST00000428978 ERCC6Q03468 1493 aa27.5■■□□□ 1.99
TULP1-204ENST00000428978 NCAPD3P42695 1498 aa27.41■■□□□ 1.98
TULP1-204ENST00000428978 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.24■■□□□ 1.95
TULP1-204ENST00000428978 NESP48681 1621 aa27.17■■□□□ 1.94
TULP1-204ENST00000428978 HMGXB3Q12766 1538 aa27.13■■□□□ 1.93
TULP1-204ENST00000428978 SMARCA2P51531 1590 aa27.12■■□□□ 1.93
TULP1-204ENST00000428978 SMARCA4P51532 1647 aa27.05■■□□□ 1.92
TULP1-204ENST00000428978 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
TULP1-204ENST00000428978 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
TULP1-204ENST00000428978 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.88■■□□□ 1.89
TULP1-204ENST00000428978 TRIM41Q8WV44 630 aa26.84■■□□□ 1.89
TULP1-204ENST00000428978 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
TULP1-204ENST00000428978 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.8■■□□□ 1.88
TULP1-204ENST00000428978 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.8■■□□□ 1.88
TULP1-204ENST00000428978 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.74■■□□□ 1.87
TULP1-204ENST00000428978 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.59■■□□□ 1.85
TULP1-204ENST00000428978 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.55■■□□□ 1.84
TULP1-204ENST00000428978 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.54■■□□□ 1.84
TULP1-204ENST00000428978 WDR62O43379 1518 aa26.5■■□□□ 1.83
TULP1-204ENST00000428978 OSCARQ8IYS5 282 aa26.32■■□□□ 1.8
TULP1-204ENST00000428978 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.31■■□□□ 1.8
TULP1-204ENST00000428978 WIZO95785 1651 aa26.25■■□□□ 1.79
TULP1-204ENST00000428978 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.23■■□□□ 1.79
TULP1-204ENST00000428978 CFTRP13569 1480 aa26.11■■□□□ 1.77
TULP1-204ENST00000428978 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
TULP1-204ENST00000428978 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.04■■□□□ 1.76
TULP1-204ENST00000428978 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.04■■□□□ 1.76
TULP1-204ENST00000428978 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.04■■□□□ 1.76
TULP1-204ENST00000428978 ARHGEF11O15085 1522 aa25.89■■□□□ 1.74
TULP1-204ENST00000428978 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
TULP1-204ENST00000428978 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
TULP1-204ENST00000428978 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
TULP1-204ENST00000428978 IFT140Q96RY7 1462 aa25.82■■□□□ 1.72
TULP1-204ENST00000428978 PRDM2Q13029 1718 aa25.82■■□□□ 1.72
TULP1-204ENST00000428978 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.75■■□□□ 1.71
TULP1-204ENST00000428978 TOPBP1Q92547 1522 aa25.68■■□□□ 1.7
TULP1-204ENST00000428978 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
TULP1-204ENST00000428978 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.7
TULP1-204ENST00000428978 CHD1O14646 1710 aa25.6■■□□□ 1.69
TULP1-204ENST00000428978 ARAP1Q96P48 1450 aa25.6■■□□□ 1.69
TULP1-204ENST00000428978 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.59■■□□□ 1.69
TULP1-204ENST00000428978 ABCC8Q09428 1581 aa25.58■■□□□ 1.69
TULP1-204ENST00000428978 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.53■■□□□ 1.68
TULP1-204ENST00000428978 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.52■■□□□ 1.68
TULP1-204ENST00000428978 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
TULP1-204ENST00000428978 FBLN2P98095 1184 aa25.48■■□□□ 1.67
TULP1-204ENST00000428978 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
TULP1-204ENST00000428978 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
TULP1-204ENST00000428978 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.3■■□□□ 1.64
TULP1-204ENST00000428978 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
TULP1-204ENST00000428978 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.28■■□□□ 1.64
TULP1-204ENST00000428978 SOGA1O94964 1423 aa25.25■■□□□ 1.63
TULP1-204ENST00000428978 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.24■■□□□ 1.63
TULP1-204ENST00000428978 SYNJ1O43426 1573 aa25.21■■□□□ 1.63
TULP1-204ENST00000428978 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
TULP1-204ENST00000428978 WDR97A6NE52 1622 aa25.19■■□□□ 1.62
TULP1-204ENST00000428978 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
TULP1-204ENST00000428978 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.12■■□□□ 1.61
TULP1-204ENST00000428978 GRIN2BQ13224 1484 aa25.09■■□□□ 1.61
TULP1-204ENST00000428978 SYNJ2O15056 1496 aa25.09■■□□□ 1.61
TULP1-204ENST00000428978 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.05■■□□□ 1.6
TULP1-204ENST00000428978 CUX1P39880 1505 aa25.02■■□□□ 1.6
TULP1-204ENST00000428978 PBRM1Q86U86 1689 aa24.96■■□□□ 1.59
TULP1-204ENST00000428978 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.85■■□□□ 1.57
TULP1-204ENST00000428978 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.83■■□□□ 1.56
TULP1-204ENST00000428978 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.81■■□□□ 1.56
TULP1-204ENST00000428978 GRIN2AQ12879 1464 aa24.77■■□□□ 1.56
TULP1-204ENST00000428978 CEP170Q5SW79 1584 aa24.76■■□□□ 1.55
TULP1-204ENST00000428978 KIF13AQ9H1H9 1805 aa24.72■■□□□ 1.55
TULP1-204ENST00000428978 NUP160Q12769 1436 aa24.72■■□□□ 1.55
TULP1-204ENST00000428978 SHROOM2Q13796 1616 aa24.68■■□□□ 1.54
TULP1-204ENST00000428978 ADAMTS12P58397 1594 aa24.67■■□□□ 1.54
TULP1-204ENST00000428978 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.59■■□□□ 1.53
TULP1-204ENST00000428978 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.59■■□□□ 1.53
TULP1-204ENST00000428978 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
TULP1-204ENST00000428978 FAM69CQ0P6D2 419 aa24.49■■□□□ 1.51
TULP1-204ENST00000428978 ABCC10Q5T3U5 1492 aa24.49■■□□□ 1.51
TULP1-204ENST00000428978 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.49■■□□□ 1.51
TULP1-204ENST00000428978 JPH4Q96JJ6 628 aa24.48■■□□□ 1.51
TULP1-204ENST00000428978 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.2 ms