RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428610.5

PHYHD1-210, Transcript of phytanoyl-CoA dioxygenase domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene PHYHD1, Length 790 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1-210ENST00000428610 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.84■■■□□ 2.85
PHYHD1-210ENST00000428610 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.46■■■□□ 2.31
PHYHD1-210ENST00000428610 ABCC9O60706 1549 aa29.18■■■□□ 2.26
PHYHD1-210ENST00000428610 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.86■■■□□ 2.05
PHYHD1-210ENST00000428610 NACADO15069 1562 aa27.69■■■□□ 2.02
PHYHD1-210ENST00000428610 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.5■■□□□ 1.99
PHYHD1-210ENST00000428610 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.36■■□□□ 1.97
PHYHD1-210ENST00000428610 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.35■■□□□ 1.97
PHYHD1-210ENST00000428610 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
PHYHD1-210ENST00000428610 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.11■■□□□ 1.93
PHYHD1-210ENST00000428610 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.1■■□□□ 1.93
PHYHD1-210ENST00000428610 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.07■■□□□ 1.92
PHYHD1-210ENST00000428610 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.01■■□□□ 1.91
PHYHD1-210ENST00000428610 SCRIBQ14160 1630 aa26.91■■□□□ 1.9
PHYHD1-210ENST00000428610 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.68■■□□□ 1.86
PHYHD1-210ENST00000428610 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.39■■□□□ 1.81
PHYHD1-210ENST00000428610 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
PHYHD1-210ENST00000428610 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.22■■□□□ 1.79
PHYHD1-210ENST00000428610 SMARCA4P51532 1647 aa25.64■■□□□ 1.7
PHYHD1-210ENST00000428610 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.52■■□□□ 1.68
PHYHD1-210ENST00000428610 NCAPD3P42695 1498 aa25.5■■□□□ 1.67
PHYHD1-210ENST00000428610 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
PHYHD1-210ENST00000428610 SMARCA2P51531 1590 aa25.48■■□□□ 1.67
PHYHD1-210ENST00000428610 HMGXB3Q12766 1538 aa25.45■■□□□ 1.66
PHYHD1-210ENST00000428610 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.35■■□□□ 1.65
PHYHD1-210ENST00000428610 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.33■■□□□ 1.65
PHYHD1-210ENST00000428610 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
PHYHD1-210ENST00000428610 ERCC6Q03468 1493 aa25.16■■□□□ 1.62
PHYHD1-210ENST00000428610 NESP48681 1621 aa25.15■■□□□ 1.62
PHYHD1-210ENST00000428610 WIZO95785 1651 aa25.1■■□□□ 1.61
PHYHD1-210ENST00000428610 CUX2O14529 1486 aa25■■□□□ 1.59
PHYHD1-210ENST00000428610 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.98■■□□□ 1.59
PHYHD1-210ENST00000428610 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.91■■□□□ 1.58
PHYHD1-210ENST00000428610 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
PHYHD1-210ENST00000428610 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
PHYHD1-210ENST00000428610 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
PHYHD1-210ENST00000428610 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.74■■□□□ 1.55
PHYHD1-210ENST00000428610 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.73■■□□□ 1.55
PHYHD1-210ENST00000428610 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.61■■□□□ 1.53
PHYHD1-210ENST00000428610 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.58■■□□□ 1.52
PHYHD1-210ENST00000428610 WDR62O43379 1518 aa24.56■■□□□ 1.52
PHYHD1-210ENST00000428610 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.56■■□□□ 1.52
PHYHD1-210ENST00000428610 CFTRP13569 1480 aa24.55■■□□□ 1.52
PHYHD1-210ENST00000428610 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.54■■□□□ 1.52
PHYHD1-210ENST00000428610 PRDM2Q13029 1718 aa24.5■■□□□ 1.51
PHYHD1-210ENST00000428610 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.42■■□□□ 1.5
PHYHD1-210ENST00000428610 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
PHYHD1-210ENST00000428610 TOPBP1Q92547 1522 aa24.12■■□□□ 1.45
PHYHD1-210ENST00000428610 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.08■■□□□ 1.45
PHYHD1-210ENST00000428610 IFT140Q96RY7 1462 aa24.02■■□□□ 1.44
PHYHD1-210ENST00000428610 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
PHYHD1-210ENST00000428610 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
PHYHD1-210ENST00000428610 ABCC8Q09428 1581 aa23.98■■□□□ 1.43
PHYHD1-210ENST00000428610 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
PHYHD1-210ENST00000428610 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
PHYHD1-210ENST00000428610 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.42
PHYHD1-210ENST00000428610 CUX1P39880 1505 aa23.81■■□□□ 1.4
PHYHD1-210ENST00000428610 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.8■■□□□ 1.4
PHYHD1-210ENST00000428610 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.79■■□□□ 1.4
PHYHD1-210ENST00000428610 CHD1O14646 1710 aa23.76■■□□□ 1.39
PHYHD1-210ENST00000428610 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.76■■□□□ 1.39
PHYHD1-210ENST00000428610 OSCARQ8IYS5 282 aa23.75■■□□□ 1.39
PHYHD1-210ENST00000428610 WDR97A6NE52 1622 aa23.71■■□□□ 1.39
PHYHD1-210ENST00000428610 SOGA1O94964 1423 aa23.7■■□□□ 1.38
PHYHD1-210ENST00000428610 TRIM41Q8WV44 630 aa23.7■■□□□ 1.38
PHYHD1-210ENST00000428610 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.65■■□□□ 1.38
PHYHD1-210ENST00000428610 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.65■■□□□ 1.38
PHYHD1-210ENST00000428610 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.65■■□□□ 1.38
PHYHD1-210ENST00000428610 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
PHYHD1-210ENST00000428610 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.62■■□□□ 1.37
PHYHD1-210ENST00000428610 PBRM1Q86U86 1689 aa23.59■■□□□ 1.37
PHYHD1-210ENST00000428610 ARHGEF11O15085 1522 aa23.57■■□□□ 1.36
PHYHD1-210ENST00000428610 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.54■■□□□ 1.36
PHYHD1-210ENST00000428610 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.53■■□□□ 1.36
PHYHD1-210ENST00000428610 SYNJ1O43426 1573 aa23.52■■□□□ 1.36
PHYHD1-210ENST00000428610 GRIN2BQ13224 1484 aa23.51■■□□□ 1.35
PHYHD1-210ENST00000428610 FBLN2P98095 1184 aa23.51■■□□□ 1.35
PHYHD1-210ENST00000428610 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
PHYHD1-210ENST00000428610 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.49■■□□□ 1.35
PHYHD1-210ENST00000428610 TOP2BQ02880 1626 aa23.49■■□□□ 1.35
PHYHD1-210ENST00000428610 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.46■■□□□ 1.35
PHYHD1-210ENST00000428610 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.46■■□□□ 1.35
PHYHD1-210ENST00000428610 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.43■■□□□ 1.34
PHYHD1-210ENST00000428610 SYNJ2O15056 1496 aa23.42■■□□□ 1.34
PHYHD1-210ENST00000428610 ARAP1Q96P48 1450 aa23.36■■□□□ 1.33
PHYHD1-210ENST00000428610 ADAMTS12P58397 1594 aa23.35■■□□□ 1.33
PHYHD1-210ENST00000428610 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
PHYHD1-210ENST00000428610 GRIN2AQ12879 1464 aa23.24■■□□□ 1.31
PHYHD1-210ENST00000428610 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.23■■□□□ 1.31
PHYHD1-210ENST00000428610 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.21■■□□□ 1.31
PHYHD1-210ENST00000428610 CEP170Q5SW79 1584 aa23.21■■□□□ 1.31
PHYHD1-210ENST00000428610 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.16■■□□□ 1.3
PHYHD1-210ENST00000428610 NUP160Q12769 1436 aa23.13■■□□□ 1.29
PHYHD1-210ENST00000428610 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.11■■□□□ 1.29
PHYHD1-210ENST00000428610 SHROOM2Q13796 1616 aa23.07■■□□□ 1.28
PHYHD1-210ENST00000428610 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.03■■□□□ 1.28
PHYHD1-210ENST00000428610 CUL7Q14999 1698 aa22.99■■□□□ 1.27
PHYHD1-210ENST00000428610 KIF27Q86VH2 1401 aa22.96■■□□□ 1.27
PHYHD1-210ENST00000428610 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
PHYHD1-210ENST00000428610 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.4 ms