RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428606.1

Z98749.2-202, humanhuman

TSL 2

Gene Z98749.2, Length 624 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Z98749.2-202ENST00000428606 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.57■■■■■ 6.97
Z98749.2-202ENST00000428606 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.32■■■■■ 5.97
Z98749.2-202ENST00000428606 ABCC9O60706 1549 aa51.61■■■■■ 5.85
Z98749.2-202ENST00000428606 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.38■■■■■ 5.5
Z98749.2-202ENST00000428606 NACADO15069 1562 aa49.24■■■■■ 5.47
Z98749.2-202ENST00000428606 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.85■■■■■ 5.41
Z98749.2-202ENST00000428606 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.77■■■■■ 5.4
Z98749.2-202ENST00000428606 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.74■■■■■ 5.39
Z98749.2-202ENST00000428606 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.51■■■■■ 5.36
Z98749.2-202ENST00000428606 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.46■■■■■ 5.35
Z98749.2-202ENST00000428606 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.16■■■■■ 5.3
Z98749.2-202ENST00000428606 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.08■■■■■ 5.29
Z98749.2-202ENST00000428606 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48■■■■■ 5.27
Z98749.2-202ENST00000428606 SCRIBQ14160 1630 aa47.65■■■■■ 5.22
Z98749.2-202ENST00000428606 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.4■■■■■ 5.18
Z98749.2-202ENST00000428606 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.79■■■■■ 5.08
Z98749.2-202ENST00000428606 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.73■■■■■ 5.07
Z98749.2-202ENST00000428606 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.41■■■■■ 5.02
Z98749.2-202ENST00000428606 SMARCA4P51532 1647 aa45.58■■■■■ 4.89
Z98749.2-202ENST00000428606 NCAPD3P42695 1498 aa45.49■■■■■ 4.87
Z98749.2-202ENST00000428606 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.44■■■■■ 4.87
Z98749.2-202ENST00000428606 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.36■■■■■ 4.85
Z98749.2-202ENST00000428606 SMARCA2P51531 1590 aa45.27■■■■■ 4.84
Z98749.2-202ENST00000428606 HMGXB3Q12766 1538 aa45.22■■■■■ 4.83
Z98749.2-202ENST00000428606 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.2■■■■■ 4.83
Z98749.2-202ENST00000428606 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.19■■■■■ 4.82
Z98749.2-202ENST00000428606 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.93■■■■■ 4.78
Z98749.2-202ENST00000428606 WIZO95785 1651 aa44.66■■■■■ 4.74
Z98749.2-202ENST00000428606 NESP48681 1621 aa44.61■■■■■ 4.73
Z98749.2-202ENST00000428606 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.43■■■■■ 4.7
Z98749.2-202ENST00000428606 ERCC6Q03468 1493 aa44.37■■■■■ 4.69
Z98749.2-202ENST00000428606 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.33■■■■■ 4.69
Z98749.2-202ENST00000428606 CUX2O14529 1486 aa44.21■■■■■ 4.67
Z98749.2-202ENST00000428606 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.1■■■■■ 4.65
Z98749.2-202ENST00000428606 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.1■■■■■ 4.65
Z98749.2-202ENST00000428606 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.07■■■■■ 4.65
Z98749.2-202ENST00000428606 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.05■■■■■ 4.64
Z98749.2-202ENST00000428606 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.92■■■■■ 4.62
Z98749.2-202ENST00000428606 CFTRP13569 1480 aa43.76■■■■■ 4.6
Z98749.2-202ENST00000428606 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.61■■■■■ 4.57
Z98749.2-202ENST00000428606 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.58■■■■■ 4.57
Z98749.2-202ENST00000428606 WDR62O43379 1518 aa43.58■■■■■ 4.57
Z98749.2-202ENST00000428606 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.57■■■■■ 4.57
Z98749.2-202ENST00000428606 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.52■■■■■ 4.56
Z98749.2-202ENST00000428606 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.46■■■■■ 4.55
Z98749.2-202ENST00000428606 PRDM2Q13029 1718 aa43.43■■■■■ 4.54
Z98749.2-202ENST00000428606 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.28■■■■■ 4.52
Z98749.2-202ENST00000428606 TOPBP1Q92547 1522 aa42.87■■■■■ 4.45
Z98749.2-202ENST00000428606 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.76■■■■■ 4.44
Z98749.2-202ENST00000428606 ABCC8Q09428 1581 aa42.67■■■■■ 4.42
Z98749.2-202ENST00000428606 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.65■■■■■ 4.42
Z98749.2-202ENST00000428606 IFT140Q96RY7 1462 aa42.64■■■■■ 4.42
Z98749.2-202ENST00000428606 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.63■■■■■ 4.42
Z98749.2-202ENST00000428606 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.53■■■■■ 4.4
Z98749.2-202ENST00000428606 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.48■■■■■ 4.39
Z98749.2-202ENST00000428606 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.42■■■■■ 4.38
Z98749.2-202ENST00000428606 CUX1P39880 1505 aa42.41■■■■■ 4.38
Z98749.2-202ENST00000428606 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.3■■■■■ 4.36
Z98749.2-202ENST00000428606 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.27■■■■■ 4.36
Z98749.2-202ENST00000428606 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.23■■■■■ 4.35
Z98749.2-202ENST00000428606 SOGA1O94964 1423 aa42.18■■■■■ 4.34
Z98749.2-202ENST00000428606 OSCARQ8IYS5 282 aa42.14■■■■■ 4.34
Z98749.2-202ENST00000428606 WDR97A6NE52 1622 aa42.09■■■■■ 4.33
Z98749.2-202ENST00000428606 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.04■■■■■ 4.32
Z98749.2-202ENST00000428606 CHD1O14646 1710 aa42■■■■■ 4.31
Z98749.2-202ENST00000428606 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.9■■■■■ 4.3
Z98749.2-202ENST00000428606 SYNJ1O43426 1573 aa41.88■■■■■ 4.3
Z98749.2-202ENST00000428606 TOP2BQ02880 1626 aa41.86■■■■■ 4.29
Z98749.2-202ENST00000428606 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.85■■■■■ 4.29
Z98749.2-202ENST00000428606 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.84■■■■■ 4.29
Z98749.2-202ENST00000428606 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.8■■■■■ 4.28
Z98749.2-202ENST00000428606 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.8■■■■■ 4.28
Z98749.2-202ENST00000428606 GRIN2BQ13224 1484 aa41.77■■■■■ 4.28
Z98749.2-202ENST00000428606 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.77■■■■■ 4.28
Z98749.2-202ENST00000428606 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.77■■■■■ 4.28
Z98749.2-202ENST00000428606 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.77■■■■■ 4.28
Z98749.2-202ENST00000428606 PBRM1Q86U86 1689 aa41.75■■■■■ 4.27
Z98749.2-202ENST00000428606 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.73■■■■■ 4.27
Z98749.2-202ENST00000428606 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.71■■■■■ 4.27
Z98749.2-202ENST00000428606 ARHGEF11O15085 1522 aa41.67■■■■■ 4.26
Z98749.2-202ENST00000428606 TRIM41Q8WV44 630 aa41.64■■■■■ 4.26
Z98749.2-202ENST00000428606 SYNJ2O15056 1496 aa41.59■■■■■ 4.25
Z98749.2-202ENST00000428606 FBLN2P98095 1184 aa41.58■■■■■ 4.25
Z98749.2-202ENST00000428606 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.58■■■■■ 4.25
Z98749.2-202ENST00000428606 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.42■■■■■ 4.22
Z98749.2-202ENST00000428606 ADAMTS12P58397 1594 aa41.41■■■■■ 4.22
Z98749.2-202ENST00000428606 ARAP1Q96P48 1450 aa41.35■■■■■ 4.21
Z98749.2-202ENST00000428606 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.31■■■■■ 4.2
Z98749.2-202ENST00000428606 GRIN2AQ12879 1464 aa41.28■■■■■ 4.2
Z98749.2-202ENST00000428606 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.2■■■■■ 4.19
Z98749.2-202ENST00000428606 CEP170Q5SW79 1584 aa41.2■■■■■ 4.19
Z98749.2-202ENST00000428606 NUP160Q12769 1436 aa41.18■■■■■ 4.18
Z98749.2-202ENST00000428606 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.13■■■■■ 4.17
Z98749.2-202ENST00000428606 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41■■■■■ 4.15
Z98749.2-202ENST00000428606 SHROOM2Q13796 1616 aa41■■■■■ 4.15
Z98749.2-202ENST00000428606 IGF1RP08069 1367 aa40.92■■■■■ 4.14
Z98749.2-202ENST00000428606 KIF27Q86VH2 1401 aa40.9■■■■■ 4.14
Z98749.2-202ENST00000428606 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.83■■■■■ 4.13
Z98749.2-202ENST00000428606 CUL7Q14999 1698 aa40.82■■■■■ 4.12
Z98749.2-202ENST00000428606 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.6■■■■■ 4.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 123.5 ms