RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428534.1

GLI3-202, Transcript of GLI family zinc finger 3, humanhuman

TSL 4

Gene GLI3, Length 583 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3-202ENST00000428534 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.23■■■■■ 6.59
GLI3-202ENST00000428534 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.89■■■■■ 5.58
GLI3-202ENST00000428534 ABCC9O60706 1549 aa49.43■■■■■ 5.5
GLI3-202ENST00000428534 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.98■■■■■ 5.11
GLI3-202ENST00000428534 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.92■■■■■ 5.1
GLI3-202ENST00000428534 NACADO15069 1562 aa46.91■■■■■ 5.1
GLI3-202ENST00000428534 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.88■■■■■ 5.09
GLI3-202ENST00000428534 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.76■■■■■ 5.08
GLI3-202ENST00000428534 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.63■■■■■ 5.05
GLI3-202ENST00000428534 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.43■■■■■ 5.02
GLI3-202ENST00000428534 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.1■■■■■ 4.97
GLI3-202ENST00000428534 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.97■■■■■ 4.95
GLI3-202ENST00000428534 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.7■■■■■ 4.91
GLI3-202ENST00000428534 SCRIBQ14160 1630 aa45.44■■■■■ 4.86
GLI3-202ENST00000428534 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.1■■■■■ 4.81
GLI3-202ENST00000428534 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.68■■■■■ 4.74
GLI3-202ENST00000428534 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.55■■■■■ 4.72
GLI3-202ENST00000428534 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.51■■■■■ 4.72
GLI3-202ENST00000428534 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.62■■■■■ 4.57
GLI3-202ENST00000428534 SMARCA4P51532 1647 aa43.54■■■■■ 4.56
GLI3-202ENST00000428534 SMARCA2P51531 1590 aa43.31■■■■■ 4.52
GLI3-202ENST00000428534 NCAPD3P42695 1498 aa43.27■■■■■ 4.52
GLI3-202ENST00000428534 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.27■■■■■ 4.52
GLI3-202ENST00000428534 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.26■■■■■ 4.52
GLI3-202ENST00000428534 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.17■■■■■ 4.5
GLI3-202ENST00000428534 HMGXB3Q12766 1538 aa43.06■■■■■ 4.48
GLI3-202ENST00000428534 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.96■■■■■ 4.47
GLI3-202ENST00000428534 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.92■■■■■ 4.46
GLI3-202ENST00000428534 WIZO95785 1651 aa42.78■■■■■ 4.44
GLI3-202ENST00000428534 ERCC6Q03468 1493 aa42.64■■■■■ 4.42
GLI3-202ENST00000428534 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.61■■■■■ 4.41
GLI3-202ENST00000428534 CUX2O14529 1486 aa42.59■■■■■ 4.41
GLI3-202ENST00000428534 NESP48681 1621 aa42.47■■■■■ 4.39
GLI3-202ENST00000428534 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.45■■■■■ 4.39
GLI3-202ENST00000428534 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.11■■■■■ 4.33
GLI3-202ENST00000428534 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.09■■■■■ 4.33
GLI3-202ENST00000428534 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.05■■■■■ 4.32
GLI3-202ENST00000428534 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.03■■■■■ 4.32
GLI3-202ENST00000428534 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.98■■■■■ 4.31
GLI3-202ENST00000428534 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.92■■■■■ 4.3
GLI3-202ENST00000428534 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.86■■■■■ 4.29
GLI3-202ENST00000428534 CFTRP13569 1480 aa41.81■■■■■ 4.28
GLI3-202ENST00000428534 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.52■■■■■ 4.24
GLI3-202ENST00000428534 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.5■■■■■ 4.23
GLI3-202ENST00000428534 WDR62O43379 1518 aa41.45■■■■■ 4.23
GLI3-202ENST00000428534 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.45■■■■■ 4.23
GLI3-202ENST00000428534 PRDM2Q13029 1718 aa41.43■■■■■ 4.22
GLI3-202ENST00000428534 ABCC8Q09428 1581 aa41.03■■■■■ 4.16
GLI3-202ENST00000428534 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.99■■■■■ 4.15
GLI3-202ENST00000428534 TOPBP1Q92547 1522 aa40.84■■■■■ 4.13
GLI3-202ENST00000428534 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.83■■■■■ 4.13
GLI3-202ENST00000428534 TRIM41Q8WV44 630 aa40.74■■■■■ 4.11
GLI3-202ENST00000428534 IFT140Q96RY7 1462 aa40.6■■■■■ 4.09
GLI3-202ENST00000428534 CUX1P39880 1505 aa40.57■■■■■ 4.09
GLI3-202ENST00000428534 OSCARQ8IYS5 282 aa40.56■■■■■ 4.08
GLI3-202ENST00000428534 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.51■■■■■ 4.08
GLI3-202ENST00000428534 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.51■■■■■ 4.07
GLI3-202ENST00000428534 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.5■■■■■ 4.07
GLI3-202ENST00000428534 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.45■■■■■ 4.07
GLI3-202ENST00000428534 SOGA1O94964 1423 aa40.42■■■■■ 4.06
GLI3-202ENST00000428534 TOP2BQ02880 1626 aa40.35■■■■■ 4.05
GLI3-202ENST00000428534 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.33■■■■■ 4.05
GLI3-202ENST00000428534 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.33■■■■■ 4.05
GLI3-202ENST00000428534 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.3■■■■■ 4.04
GLI3-202ENST00000428534 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.28■■■■■ 4.04
GLI3-202ENST00000428534 SYNJ1O43426 1573 aa40.27■■■■■ 4.04
GLI3-202ENST00000428534 WDR97A6NE52 1622 aa40.2■■■■■ 4.03
GLI3-202ENST00000428534 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.2■■■■■ 4.03
GLI3-202ENST00000428534 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.2■■■■■ 4.03
GLI3-202ENST00000428534 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.2■■■■■ 4.03
GLI3-202ENST00000428534 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.11■■■■■ 4.01
GLI3-202ENST00000428534 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.09■■■■■ 4.01
GLI3-202ENST00000428534 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.09■■■■■ 4.01
GLI3-202ENST00000428534 CHD1O14646 1710 aa40.05■■■■■ 4
GLI3-202ENST00000428534 ARHGEF11O15085 1522 aa40.02■■■■■ 4
GLI3-202ENST00000428534 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.94■■■■□ 3.98
GLI3-202ENST00000428534 GRIN2BQ13224 1484 aa39.92■■■■□ 3.98
GLI3-202ENST00000428534 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.86■■■■□ 3.97
GLI3-202ENST00000428534 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.8■■■■□ 3.96
GLI3-202ENST00000428534 FBLN2P98095 1184 aa39.77■■■■□ 3.96
GLI3-202ENST00000428534 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.75■■■■□ 3.95
GLI3-202ENST00000428534 PBRM1Q86U86 1689 aa39.73■■■■□ 3.95
GLI3-202ENST00000428534 KIF27Q86VH2 1401 aa39.71■■■■□ 3.95
GLI3-202ENST00000428534 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.67■■■■□ 3.94
GLI3-202ENST00000428534 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.66■■■■□ 3.94
GLI3-202ENST00000428534 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.65■■■■□ 3.94
GLI3-202ENST00000428534 ARAP1Q96P48 1450 aa39.64■■■■□ 3.94
GLI3-202ENST00000428534 SYNJ2O15056 1496 aa39.62■■■■□ 3.93
GLI3-202ENST00000428534 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.54■■■■□ 3.92
GLI3-202ENST00000428534 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.52■■■■□ 3.92
GLI3-202ENST00000428534 ADAMTS12P58397 1594 aa39.46■■■■□ 3.91
GLI3-202ENST00000428534 IGF1RP08069 1367 aa39.45■■■■□ 3.91
GLI3-202ENST00000428534 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.39■■■■□ 3.9
GLI3-202ENST00000428534 GRIN2AQ12879 1464 aa39.37■■■■□ 3.89
GLI3-202ENST00000428534 CUL7Q14999 1698 aa39.34■■■■□ 3.89
GLI3-202ENST00000428534 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.26■■■■□ 3.88
GLI3-202ENST00000428534 TRHP20396 242 aaPredicted RBP39.22■■■■□ 3.87
GLI3-202ENST00000428534 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.21■■■■□ 3.87
GLI3-202ENST00000428534 NUP160Q12769 1436 aa39.18■■■■□ 3.86
GLI3-202ENST00000428534 EEA1Q15075 1411 aa39.18■■■■□ 3.86
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