RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428075.5

TRIOBP-209, Transcript of TRIO and F-actin binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene TRIOBP, Length 931 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBP-209ENST00000428075 NISCHQ9Y2I1 1504 aa69.57■■■■■ 8.73
TRIOBP-209ENST00000428075 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa62.14■■■■■ 7.54
TRIOBP-209ENST00000428075 ABCC9O60706 1549 aa61.79■■■■■ 7.48
TRIOBP-209ENST00000428075 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa58.93■■■■■ 7.02
TRIOBP-209ENST00000428075 NACADO15069 1562 aa58.67■■■■■ 6.98
TRIOBP-209ENST00000428075 DCAF8L2P0C7V8 631 aa58.45■■■■■ 6.95
TRIOBP-209ENST00000428075 MYO15BQ96JP2 1530 aa58.04■■■■■ 6.88
TRIOBP-209ENST00000428075 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP57.76■■■■■ 6.84
TRIOBP-209ENST00000428075 DNAJC5BQ9UF47 199 aa57.71■■■■■ 6.83
TRIOBP-209ENST00000428075 UNC13AQ9UPW8 1703 aa57.67■■■■■ 6.82
TRIOBP-209ENST00000428075 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP57.64■■■■■ 6.82
TRIOBP-209ENST00000428075 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa57.47■■■■■ 6.79
TRIOBP-209ENST00000428075 BICRAQ9NZM4 1560 aa57.35■■■■■ 6.77
TRIOBP-209ENST00000428075 SCRIBQ14160 1630 aa56.7■■■■■ 6.67
TRIOBP-209ENST00000428075 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa56.48■■■■■ 6.63
TRIOBP-209ENST00000428075 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa55.83■■■■■ 6.53
TRIOBP-209ENST00000428075 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP55.82■■■■■ 6.53
TRIOBP-209ENST00000428075 CECR2Q9BXF3 1484 aa55.6■■■■■ 6.49
TRIOBP-209ENST00000428075 NCAPD3P42695 1498 aa54.22■■■■■ 6.27
TRIOBP-209ENST00000428075 SMARCA4P51532 1647 aa54.15■■■■■ 6.26
TRIOBP-209ENST00000428075 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa54.13■■■■■ 6.26
TRIOBP-209ENST00000428075 SMARCA2P51531 1590 aa53.91■■■■■ 6.22
TRIOBP-209ENST00000428075 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP53.91■■■■■ 6.22
TRIOBP-209ENST00000428075 HMGXB3Q12766 1538 aa53.81■■■■■ 6.2
TRIOBP-209ENST00000428075 MROH2BQ7Z745 1585 aa53.65■■■■■ 6.18
TRIOBP-209ENST00000428075 PEG3Q9GZU2 1588 aa53.64■■■■■ 6.18
TRIOBP-209ENST00000428075 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP53.56■■■■■ 6.16
TRIOBP-209ENST00000428075 NESP48681 1621 aa53.26■■■■■ 6.12
TRIOBP-209ENST00000428075 ERCC6Q03468 1493 aa53.22■■■■■ 6.11
TRIOBP-209ENST00000428075 CUX2O14529 1486 aa53.01■■■■■ 6.08
TRIOBP-209ENST00000428075 WIZO95785 1651 aa52.99■■■■■ 6.07
TRIOBP-209ENST00000428075 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa52.85■■■■■ 6.05
TRIOBP-209ENST00000428075 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP52.71■■■■■ 6.03
TRIOBP-209ENST00000428075 CADPSQ9ULU8 1353 aa52.59■■■■■ 6.01
TRIOBP-209ENST00000428075 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP52.58■■■■■ 6.01
TRIOBP-209ENST00000428075 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa52.56■■■■■ 6
TRIOBP-209ENST00000428075 PDS5BQ9NTI5 1447 aa52.53■■■■■ 6
TRIOBP-209ENST00000428075 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa52.51■■■■■ 6
TRIOBP-209ENST00000428075 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP52.32■■■■■ 5.97
TRIOBP-209ENST00000428075 CFTRP13569 1480 aa52.09■■■■■ 5.93
TRIOBP-209ENST00000428075 MRC2Q9UBG0 1479 aa52.08■■■■■ 5.93
TRIOBP-209ENST00000428075 FANCD2Q9BXW9 1451 aa51.97■■■■■ 5.91
TRIOBP-209ENST00000428075 WDR62O43379 1518 aa51.95■■■■■ 5.91
TRIOBP-209ENST00000428075 CEP164Q9UPV0 1460 aa51.94■■■■■ 5.91
TRIOBP-209ENST00000428075 CCDC88BA6NC98 1476 aa51.79■■■■■ 5.88
TRIOBP-209ENST00000428075 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP51.57■■■■■ 5.85
TRIOBP-209ENST00000428075 PRDM2Q13029 1718 aa51.5■■■■■ 5.83
TRIOBP-209ENST00000428075 TOPBP1Q92547 1522 aa51.05■■■■■ 5.76
TRIOBP-209ENST00000428075 IFT140Q96RY7 1462 aa50.9■■■■■ 5.74
TRIOBP-209ENST00000428075 ABCC8Q09428 1581 aa50.88■■■■■ 5.74
TRIOBP-209ENST00000428075 DNMBPQ6XZF7 1577 aa50.87■■■■■ 5.73
TRIOBP-209ENST00000428075 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP50.87■■■■■ 5.73
TRIOBP-209ENST00000428075 OSCARQ8IYS5 282 aa50.68■■■■■ 5.7
TRIOBP-209ENST00000428075 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP50.65■■■■■ 5.7
TRIOBP-209ENST00000428075 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP50.58■■■■■ 5.69
TRIOBP-209ENST00000428075 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP50.56■■■■■ 5.68
TRIOBP-209ENST00000428075 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP50.52■■■■■ 5.68
TRIOBP-209ENST00000428075 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP50.45■■■■■ 5.67
TRIOBP-209ENST00000428075 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa50.4■■■■■ 5.66
TRIOBP-209ENST00000428075 CUX1P39880 1505 aa50.37■■■■■ 5.65
TRIOBP-209ENST00000428075 TRIM41Q8WV44 630 aa50.37■■■■■ 5.65
TRIOBP-209ENST00000428075 SOGA1O94964 1423 aa50.32■■■■■ 5.65
TRIOBP-209ENST00000428075 FGD5Q6ZNL6 1462 aa50.3■■■■■ 5.64
TRIOBP-209ENST00000428075 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP50.2■■■■■ 5.63
TRIOBP-209ENST00000428075 CHD1O14646 1710 aa50.05■■■■■ 5.6
TRIOBP-209ENST00000428075 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa50■■■■■ 5.59
TRIOBP-209ENST00000428075 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa50■■■■■ 5.59
TRIOBP-209ENST00000428075 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa50■■■■■ 5.59
TRIOBP-209ENST00000428075 WDR97A6NE52 1622 aa49.99■■■■■ 5.59
TRIOBP-209ENST00000428075 FBLN2P98095 1184 aa49.93■■■■■ 5.58
TRIOBP-209ENST00000428075 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa49.9■■■■■ 5.58
TRIOBP-209ENST00000428075 ARHGEF11O15085 1522 aa49.9■■■■■ 5.58
TRIOBP-209ENST00000428075 GRIN2BQ13224 1484 aa49.81■■■■■ 5.56
TRIOBP-209ENST00000428075 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa49.76■■■■■ 5.56
TRIOBP-209ENST00000428075 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP49.76■■■■■ 5.56
TRIOBP-209ENST00000428075 GAPVD1Q14C86 1478 aa49.71■■■■■ 5.55
TRIOBP-209ENST00000428075 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP49.65■■■■■ 5.54
TRIOBP-209ENST00000428075 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa49.64■■■■■ 5.54
TRIOBP-209ENST00000428075 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP49.64■■■■■ 5.54
TRIOBP-209ENST00000428075 TOP2BQ02880 1626 aa49.63■■■■■ 5.53
TRIOBP-209ENST00000428075 SYNJ1O43426 1573 aa49.62■■■■■ 5.53
TRIOBP-209ENST00000428075 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa49.62■■■■■ 5.53
TRIOBP-209ENST00000428075 PBRM1Q86U86 1689 aa49.61■■■■■ 5.53
TRIOBP-209ENST00000428075 SYNJ2O15056 1496 aa49.6■■■■■ 5.53
TRIOBP-209ENST00000428075 CLASP1Q7Z460 1538 aa49.55■■■■■ 5.52
TRIOBP-209ENST00000428075 CYB5RLQ6IPT4 315 aa49.49■■■■■ 5.51
TRIOBP-209ENST00000428075 ARAP1Q96P48 1450 aa49.47■■■■■ 5.51
TRIOBP-209ENST00000428075 ADAMTS12P58397 1594 aa49.22■■■■■ 5.47
TRIOBP-209ENST00000428075 GRIN2AQ12879 1464 aa49.18■■■■■ 5.46
TRIOBP-209ENST00000428075 ERICH3Q5RHP9 1530 aa49.11■■■■■ 5.45
TRIOBP-209ENST00000428075 FHAD1B1AJZ9 1412 aa49.09■■■■■ 5.45
TRIOBP-209ENST00000428075 NUP160Q12769 1436 aa49.04■■■■■ 5.44
TRIOBP-209ENST00000428075 CEP170Q5SW79 1584 aa49.02■■■■■ 5.44
TRIOBP-209ENST00000428075 ERCC6L2Q5T890 1561 aa48.86■■■■■ 5.41
TRIOBP-209ENST00000428075 SHROOM2Q13796 1616 aa48.76■■■■■ 5.4
TRIOBP-209ENST00000428075 TRHP20396 242 aaPredicted RBP48.72■■■■■ 5.39
TRIOBP-209ENST00000428075 IGF1RP08069 1367 aa48.68■■■■■ 5.38
TRIOBP-209ENST00000428075 KIF27Q86VH2 1401 aa48.64■■■■■ 5.38
TRIOBP-209ENST00000428075 JPH4Q96JJ6 628 aa48.53■■■■■ 5.36
TRIOBP-209ENST00000428075 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa48.51■■■■■ 5.36
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