RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427770.1

SOX10-203, Transcript of SRY-box 10, humanhuman

TSL 3

Gene SOX10, Length 873 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX10-203ENST00000427770 NISCHQ9Y2I1 1504 aa61.53■■■■■ 7.44
SOX10-203ENST00000427770 ABCC9O60706 1549 aa55.36■■■■■ 6.45
SOX10-203ENST00000427770 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa55.31■■■■■ 6.44
SOX10-203ENST00000427770 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa52.67■■■■■ 6.02
SOX10-203ENST00000427770 NACADO15069 1562 aa52.29■■■■■ 5.96
SOX10-203ENST00000427770 DNAJC5BQ9UF47 199 aa52.06■■■■■ 5.92
SOX10-203ENST00000427770 DCAF8L2P0C7V8 631 aa51.85■■■■■ 5.89
SOX10-203ENST00000427770 MYO15BQ96JP2 1530 aa51.56■■■■■ 5.84
SOX10-203ENST00000427770 UNC13AQ9UPW8 1703 aa51.55■■■■■ 5.84
SOX10-203ENST00000427770 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP51.48■■■■■ 5.83
SOX10-203ENST00000427770 BICRAQ9NZM4 1560 aa51.19■■■■■ 5.79
SOX10-203ENST00000427770 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.98■■■■■ 5.75
SOX10-203ENST00000427770 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.85■■■■■ 5.73
SOX10-203ENST00000427770 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa50.47■■■■■ 5.67
SOX10-203ENST00000427770 SCRIBQ14160 1630 aa50.34■■■■■ 5.65
SOX10-203ENST00000427770 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa50.04■■■■■ 5.6
SOX10-203ENST00000427770 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP49.91■■■■■ 5.58
SOX10-203ENST00000427770 CECR2Q9BXF3 1484 aa49.89■■■■■ 5.58
SOX10-203ENST00000427770 NCAPD3P42695 1498 aa48.27■■■■■ 5.32
SOX10-203ENST00000427770 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa48.1■■■■■ 5.29
SOX10-203ENST00000427770 SMARCA4P51532 1647 aa48.04■■■■■ 5.28
SOX10-203ENST00000427770 SMARCA2P51531 1590 aa47.96■■■■■ 5.27
SOX10-203ENST00000427770 HMGXB3Q12766 1538 aa47.92■■■■■ 5.26
SOX10-203ENST00000427770 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa47.89■■■■■ 5.26
SOX10-203ENST00000427770 CUX2O14529 1486 aa47.79■■■■■ 5.24
SOX10-203ENST00000427770 ERCC6Q03468 1493 aa47.78■■■■■ 5.24
SOX10-203ENST00000427770 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.76■■■■■ 5.24
SOX10-203ENST00000427770 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP47.61■■■■■ 5.21
SOX10-203ENST00000427770 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.61■■■■■ 5.21
SOX10-203ENST00000427770 NESP48681 1621 aa47.55■■■■■ 5.2
SOX10-203ENST00000427770 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.41■■■■■ 5.18
SOX10-203ENST00000427770 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa47.21■■■■■ 5.15
SOX10-203ENST00000427770 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP47.13■■■■■ 5.14
SOX10-203ENST00000427770 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa46.97■■■■■ 5.11
SOX10-203ENST00000427770 PDS5BQ9NTI5 1447 aa46.9■■■■■ 5.1
SOX10-203ENST00000427770 WIZO95785 1651 aa46.84■■■■■ 5.09
SOX10-203ENST00000427770 CADPSQ9ULU8 1353 aa46.77■■■■■ 5.08
SOX10-203ENST00000427770 MRC2Q9UBG0 1479 aa46.52■■■■■ 5.04
SOX10-203ENST00000427770 WDR62O43379 1518 aa46.44■■■■■ 5.03
SOX10-203ENST00000427770 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.37■■■■■ 5.01
SOX10-203ENST00000427770 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.31■■■■■ 5
SOX10-203ENST00000427770 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46.25■■■■■ 4.99
SOX10-203ENST00000427770 CFTRP13569 1480 aa46.24■■■■■ 4.99
SOX10-203ENST00000427770 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP46.23■■■■■ 4.99
SOX10-203ENST00000427770 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.9■■■■■ 4.94
SOX10-203ENST00000427770 PRDM2Q13029 1718 aa45.83■■■■■ 4.93
SOX10-203ENST00000427770 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.7■■■■■ 4.91
SOX10-203ENST00000427770 TRIM41Q8WV44 630 aa45.67■■■■■ 4.9
SOX10-203ENST00000427770 OSCARQ8IYS5 282 aa45.53■■■■■ 4.88
SOX10-203ENST00000427770 IFT140Q96RY7 1462 aa45.39■■■■■ 4.86
SOX10-203ENST00000427770 TOPBP1Q92547 1522 aa45.37■■■■■ 4.85
SOX10-203ENST00000427770 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.34■■■■■ 4.85
SOX10-203ENST00000427770 ABCC8Q09428 1581 aa45.24■■■■■ 4.83
SOX10-203ENST00000427770 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.2■■■■■ 4.83
SOX10-203ENST00000427770 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP45.11■■■■■ 4.81
SOX10-203ENST00000427770 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa45.03■■■■■ 4.8
SOX10-203ENST00000427770 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa45.03■■■■■ 4.8
SOX10-203ENST00000427770 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa45.03■■■■■ 4.8
SOX10-203ENST00000427770 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP45.01■■■■■ 4.8
SOX10-203ENST00000427770 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.91■■■■■ 4.78
SOX10-203ENST00000427770 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP44.9■■■■■ 4.78
SOX10-203ENST00000427770 ARHGEF11O15085 1522 aa44.86■■■■■ 4.77
SOX10-203ENST00000427770 CHD1O14646 1710 aa44.81■■■■■ 4.76
SOX10-203ENST00000427770 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.72■■■■■ 4.75
SOX10-203ENST00000427770 SOGA1O94964 1423 aa44.66■■■■■ 4.74
SOX10-203ENST00000427770 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.59■■■■■ 4.73
SOX10-203ENST00000427770 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.58■■■■■ 4.73
SOX10-203ENST00000427770 CUX1P39880 1505 aa44.55■■■■■ 4.72
SOX10-203ENST00000427770 FBLN2P98095 1184 aa44.55■■■■■ 4.72
SOX10-203ENST00000427770 WDR97A6NE52 1622 aa44.54■■■■■ 4.72
SOX10-203ENST00000427770 CYB5RLQ6IPT4 315 aa44.47■■■■■ 4.71
SOX10-203ENST00000427770 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.44■■■■■ 4.7
SOX10-203ENST00000427770 ARAP1Q96P48 1450 aa44.41■■■■■ 4.7
SOX10-203ENST00000427770 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP44.34■■■■■ 4.69
SOX10-203ENST00000427770 GRIN2BQ13224 1484 aa44.3■■■■■ 4.68
SOX10-203ENST00000427770 CLASP1Q7Z460 1538 aa44.29■■■■■ 4.68
SOX10-203ENST00000427770 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP44.23■■■■■ 4.67
SOX10-203ENST00000427770 SYNJ1O43426 1573 aa44.22■■■■■ 4.67
SOX10-203ENST00000427770 SYNJ2O15056 1496 aa44.18■■■■■ 4.66
SOX10-203ENST00000427770 PBRM1Q86U86 1689 aa44.17■■■■■ 4.66
SOX10-203ENST00000427770 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.14■■■■■ 4.66
SOX10-203ENST00000427770 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.13■■■■■ 4.66
SOX10-203ENST00000427770 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.1■■■■■ 4.65
SOX10-203ENST00000427770 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.07■■■■■ 4.65
SOX10-203ENST00000427770 TRHP20396 242 aaPredicted RBP43.98■■■■■ 4.63
SOX10-203ENST00000427770 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.85■■■■■ 4.61
SOX10-203ENST00000427770 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.84■■■■■ 4.61
SOX10-203ENST00000427770 TOP2BQ02880 1626 aa43.81■■■■■ 4.6
SOX10-203ENST00000427770 GRIN2AQ12879 1464 aa43.75■■■■■ 4.59
SOX10-203ENST00000427770 ADAMTS12P58397 1594 aa43.73■■■■■ 4.59
SOX10-203ENST00000427770 NUP160Q12769 1436 aa43.63■■■■■ 4.57
SOX10-203ENST00000427770 CEP170Q5SW79 1584 aa43.62■■■■■ 4.57
SOX10-203ENST00000427770 ERCC6L2Q5T890 1561 aa43.58■■■■■ 4.57
SOX10-203ENST00000427770 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.56■■■■■ 4.56
SOX10-203ENST00000427770 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.54■■■■■ 4.56
SOX10-203ENST00000427770 SHROOM2Q13796 1616 aa43.47■■■■■ 4.55
SOX10-203ENST00000427770 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP43.17■■■■■ 4.5
SOX10-203ENST00000427770 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.12■■■■■ 4.49
SOX10-203ENST00000427770 JPH4Q96JJ6 628 aa43.12■■■■■ 4.49
SOX10-203ENST00000427770 KIF13AQ9H1H9 1805 aa42.96■■■■■ 4.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 146.4 ms