RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427455.1

HERPUD2-205, Transcript of HERPUD family member 2, humanhuman

TSL 3

Gene HERPUD2, Length 672 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2-205ENST00000427455 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.88■■■■■ 7.34
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HERPUD2-205ENST00000427455 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.81■■■■■ 5.72
HERPUD2-205ENST00000427455 NACADO15069 1562 aa50.8■■■■■ 5.72
HERPUD2-205ENST00000427455 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.79■■■■■ 5.72
HERPUD2-205ENST00000427455 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.65■■■■■ 5.7
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HERPUD2-205ENST00000427455 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.42■■■■■ 5.66
HERPUD2-205ENST00000427455 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.65■■■■■ 5.54
HERPUD2-205ENST00000427455 SCRIBQ14160 1630 aa49.34■■■■■ 5.49
HERPUD2-205ENST00000427455 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.25■■■■■ 5.47
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HERPUD2-205ENST00000427455 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.69■■■■■ 5.22
HERPUD2-205ENST00000427455 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.36■■■■■ 5.17
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HERPUD2-205ENST00000427455 SMARCA2P51531 1590 aa46.89■■■■■ 5.1
HERPUD2-205ENST00000427455 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.89■■■■■ 5.1
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HERPUD2-205ENST00000427455 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.78■■■■■ 5.08
HERPUD2-205ENST00000427455 HMGXB3Q12766 1538 aa46.69■■■■■ 5.06
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HERPUD2-205ENST00000427455 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.46■■■■■ 4.87
HERPUD2-205ENST00000427455 ERCC6Q03468 1493 aa45.42■■■■■ 4.86
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HERPUD2-205ENST00000427455 CFTRP13569 1480 aa45.26■■■■■ 4.84
HERPUD2-205ENST00000427455 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.15■■■■■ 4.82
HERPUD2-205ENST00000427455 PRDM2Q13029 1718 aa45.01■■■■■ 4.8
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HERPUD2-205ENST00000427455 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.96■■■■■ 4.79
HERPUD2-205ENST00000427455 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.91■■■■■ 4.78
HERPUD2-205ENST00000427455 CUX2O14529 1486 aa44.9■■■■■ 4.78
HERPUD2-205ENST00000427455 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.81■■■■■ 4.76
HERPUD2-205ENST00000427455 WDR62O43379 1518 aa44.68■■■■■ 4.74
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HERPUD2-205ENST00000427455 ABCC8Q09428 1581 aa44.29■■■■■ 4.68
HERPUD2-205ENST00000427455 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.27■■■■■ 4.68
HERPUD2-205ENST00000427455 TOPBP1Q92547 1522 aa44.27■■■■■ 4.68
HERPUD2-205ENST00000427455 CUX1P39880 1505 aa44.01■■■■■ 4.64
HERPUD2-205ENST00000427455 IFT140Q96RY7 1462 aa43.96■■■■■ 4.63
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HERPUD2-205ENST00000427455 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.83■■■■■ 4.61
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HERPUD2-205ENST00000427455 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.68■■■■■ 4.58
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HERPUD2-205ENST00000427455 WDR97A6NE52 1622 aa43.52■■■■■ 4.56
HERPUD2-205ENST00000427455 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.46■■■■■ 4.55
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HERPUD2-205ENST00000427455 FBLN2P98095 1184 aa42.87■■■■■ 4.45
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HERPUD2-205ENST00000427455 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.73■■■■■ 4.43
HERPUD2-205ENST00000427455 GRIN2AQ12879 1464 aa42.66■■■■■ 4.42
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HERPUD2-205ENST00000427455 NUP160Q12769 1436 aa42.46■■■■■ 4.39
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HERPUD2-205ENST00000427455 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.39■■■■■ 4.38
HERPUD2-205ENST00000427455 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.38■■■■■ 4.37
HERPUD2-205ENST00000427455 ARHGEF11O15085 1522 aa42.36■■■■■ 4.37
HERPUD2-205ENST00000427455 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.35■■■■■ 4.37
HERPUD2-205ENST00000427455 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.35■■■■■ 4.37
HERPUD2-205ENST00000427455 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.35■■■■■ 4.37
HERPUD2-205ENST00000427455 EEA1Q15075 1411 aa42.19■■■■■ 4.34
HERPUD2-205ENST00000427455 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.18■■■■■ 4.34
HERPUD2-205ENST00000427455 SHROOM2Q13796 1616 aa42.14■■■■■ 4.34
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