RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427412.5

CITED1-204, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

TSL 2

Gene CITED1, Length 666 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-204ENST00000427412 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.7■■■■□ 3.63
CITED1-204ENST00000427412 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34.08■■■■□ 3.05
CITED1-204ENST00000427412 ABCC9O60706 1549 aa33.99■■■■□ 3.03
CITED1-204ENST00000427412 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.41■■■□□ 2.78
CITED1-204ENST00000427412 NACADO15069 1562 aa32.15■■■□□ 2.74
CITED1-204ENST00000427412 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.95■■■□□ 2.71
CITED1-204ENST00000427412 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.83■■■□□ 2.69
CITED1-204ENST00000427412 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.7■■■□□ 2.67
CITED1-204ENST00000427412 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.54■■■□□ 2.64
CITED1-204ENST00000427412 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.5■■■□□ 2.63
CITED1-204ENST00000427412 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.47■■■□□ 2.63
CITED1-204ENST00000427412 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.27■■■□□ 2.6
CITED1-204ENST00000427412 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.23■■■□□ 2.59
CITED1-204ENST00000427412 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.12■■■□□ 2.57
CITED1-204ENST00000427412 SCRIBQ14160 1630 aa30.88■■■□□ 2.53
CITED1-204ENST00000427412 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.81■■■□□ 2.52
CITED1-204ENST00000427412 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.71■■■□□ 2.51
CITED1-204ENST00000427412 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.67■■■□□ 2.5
CITED1-204ENST00000427412 NCAPD3P42695 1498 aa29.61■■■□□ 2.33
CITED1-204ENST00000427412 SMARCA4P51532 1647 aa29.51■■■□□ 2.31
CITED1-204ENST00000427412 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.5■■■□□ 2.31
CITED1-204ENST00000427412 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.5■■■□□ 2.31
CITED1-204ENST00000427412 HMGXB3Q12766 1538 aa29.49■■■□□ 2.31
CITED1-204ENST00000427412 CUX2O14529 1486 aa29.48■■■□□ 2.31
CITED1-204ENST00000427412 SMARCA2P51531 1590 aa29.46■■■□□ 2.31
CITED1-204ENST00000427412 ERCC6Q03468 1493 aa29.36■■■□□ 2.29
CITED1-204ENST00000427412 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.31■■■□□ 2.28
CITED1-204ENST00000427412 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.28■■■□□ 2.28
CITED1-204ENST00000427412 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
CITED1-204ENST00000427412 NESP48681 1621 aa29.17■■■□□ 2.26
CITED1-204ENST00000427412 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
CITED1-204ENST00000427412 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.06■■■□□ 2.24
CITED1-204ENST00000427412 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.02■■■□□ 2.24
CITED1-204ENST00000427412 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.95■■■□□ 2.22
CITED1-204ENST00000427412 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.77■■■□□ 2.2
CITED1-204ENST00000427412 WIZO95785 1651 aa28.71■■■□□ 2.19
CITED1-204ENST00000427412 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.65■■■□□ 2.18
CITED1-204ENST00000427412 WDR62O43379 1518 aa28.6■■■□□ 2.17
CITED1-204ENST00000427412 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.59■■■□□ 2.17
CITED1-204ENST00000427412 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.44■■■□□ 2.14
CITED1-204ENST00000427412 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.36■■■□□ 2.13
CITED1-204ENST00000427412 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
CITED1-204ENST00000427412 CFTRP13569 1480 aa28.35■■■□□ 2.13
CITED1-204ENST00000427412 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
CITED1-204ENST00000427412 PRDM2Q13029 1718 aa28.3■■■□□ 2.12
CITED1-204ENST00000427412 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
CITED1-204ENST00000427412 TRIM41Q8WV44 630 aa28.03■■■□□ 2.08
CITED1-204ENST00000427412 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.93■■■□□ 2.06
CITED1-204ENST00000427412 OSCARQ8IYS5 282 aa27.9■■■□□ 2.06
CITED1-204ENST00000427412 IFT140Q96RY7 1462 aa27.86■■■□□ 2.05
CITED1-204ENST00000427412 TOPBP1Q92547 1522 aa27.84■■■□□ 2.05
CITED1-204ENST00000427412 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
CITED1-204ENST00000427412 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
CITED1-204ENST00000427412 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.78■■■□□ 2.04
CITED1-204ENST00000427412 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.78■■■□□ 2.04
CITED1-204ENST00000427412 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.78■■■□□ 2.04
CITED1-204ENST00000427412 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.77■■■□□ 2.04
CITED1-204ENST00000427412 ABCC8Q09428 1581 aa27.76■■■□□ 2.03
CITED1-204ENST00000427412 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
CITED1-204ENST00000427412 ARHGEF11O15085 1522 aa27.64■■■□□ 2.02
CITED1-204ENST00000427412 CHD1O14646 1710 aa27.63■■■□□ 2.01
CITED1-204ENST00000427412 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.54■■■□□ 2
CITED1-204ENST00000427412 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.48■■□□□ 1.99
CITED1-204ENST00000427412 WDR97A6NE52 1622 aa27.45■■□□□ 1.99
CITED1-204ENST00000427412 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.37■■□□□ 1.97
CITED1-204ENST00000427412 ARAP1Q96P48 1450 aa27.34■■□□□ 1.97
CITED1-204ENST00000427412 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.32■■□□□ 1.96
CITED1-204ENST00000427412 SOGA1O94964 1423 aa27.31■■□□□ 1.96
CITED1-204ENST00000427412 CUX1P39880 1505 aa27.3■■□□□ 1.96
CITED1-204ENST00000427412 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.27■■□□□ 1.96
CITED1-204ENST00000427412 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.27■■□□□ 1.96
CITED1-204ENST00000427412 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
CITED1-204ENST00000427412 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.24■■□□□ 1.95
CITED1-204ENST00000427412 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27.22■■□□□ 1.95
CITED1-204ENST00000427412 PBRM1Q86U86 1689 aa27.21■■□□□ 1.95
CITED1-204ENST00000427412 SYNJ1O43426 1573 aa27.21■■□□□ 1.95
CITED1-204ENST00000427412 FBLN2P98095 1184 aa27.19■■□□□ 1.94
CITED1-204ENST00000427412 GRIN2BQ13224 1484 aa27.17■■□□□ 1.94
CITED1-204ENST00000427412 SYNJ2O15056 1496 aa27.13■■□□□ 1.93
CITED1-204ENST00000427412 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.1■■□□□ 1.93
CITED1-204ENST00000427412 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.04■■□□□ 1.92
CITED1-204ENST00000427412 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.03■■□□□ 1.92
CITED1-204ENST00000427412 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
CITED1-204ENST00000427412 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
CITED1-204ENST00000427412 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.92■■□□□ 1.9
CITED1-204ENST00000427412 ADAMTS12P58397 1594 aa26.89■■□□□ 1.9
CITED1-204ENST00000427412 TOP2BQ02880 1626 aa26.87■■□□□ 1.89
CITED1-204ENST00000427412 GRIN2AQ12879 1464 aa26.85■■□□□ 1.89
CITED1-204ENST00000427412 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.81■■□□□ 1.88
CITED1-204ENST00000427412 CEP170Q5SW79 1584 aa26.8■■□□□ 1.88
CITED1-204ENST00000427412 SHROOM2Q13796 1616 aa26.78■■□□□ 1.88
CITED1-204ENST00000427412 NUP160Q12769 1436 aa26.77■■□□□ 1.88
CITED1-204ENST00000427412 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.76■■□□□ 1.87
CITED1-204ENST00000427412 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.72■■□□□ 1.87
CITED1-204ENST00000427412 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
CITED1-204ENST00000427412 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.68■■□□□ 1.86
CITED1-204ENST00000427412 KIF13AQ9H1H9 1805 aa26.54■■□□□ 1.84
CITED1-204ENST00000427412 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.54■■□□□ 1.84
CITED1-204ENST00000427412 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
CITED1-204ENST00000427412 CUL7Q14999 1698 aa26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 81.9 ms