RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427407.5

DGCR6-203, Transcript of DiGeorge syndrome critical region gene 6, humanhuman

TSL 5

Gene DGCR6, Length 1,199 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DGCR6-203ENST00000427407 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.29■■■■■ 5.96
DGCR6-203ENST00000427407 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa46.76■■■■■ 5.08
DGCR6-203ENST00000427407 ABCC9O60706 1549 aa46.43■■■■■ 5.02
DGCR6-203ENST00000427407 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.37■■■■■ 4.69
DGCR6-203ENST00000427407 NACADO15069 1562 aa44.17■■■■■ 4.66
DGCR6-203ENST00000427407 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.92■■■■■ 4.62
DGCR6-203ENST00000427407 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.73■■■■■ 4.59
DGCR6-203ENST00000427407 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.42■■■■■ 4.54
DGCR6-203ENST00000427407 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.27■■■■■ 4.52
DGCR6-203ENST00000427407 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.27■■■■■ 4.52
DGCR6-203ENST00000427407 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.27■■■■■ 4.52
DGCR6-203ENST00000427407 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.25■■■■■ 4.51
DGCR6-203ENST00000427407 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.05■■■■■ 4.48
DGCR6-203ENST00000427407 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.61■■■■■ 4.41
DGCR6-203ENST00000427407 SCRIBQ14160 1630 aa42.59■■■■■ 4.41
DGCR6-203ENST00000427407 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.97■■■■■ 4.31
DGCR6-203ENST00000427407 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.95■■■■■ 4.31
DGCR6-203ENST00000427407 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.82■■■■■ 4.29
DGCR6-203ENST00000427407 NCAPD3P42695 1498 aa40.79■■■■■ 4.12
DGCR6-203ENST00000427407 SMARCA4P51532 1647 aa40.7■■■■■ 4.11
DGCR6-203ENST00000427407 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.69■■■■■ 4.1
DGCR6-203ENST00000427407 SMARCA2P51531 1590 aa40.6■■■■■ 4.09
DGCR6-203ENST00000427407 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.57■■■■■ 4.09
DGCR6-203ENST00000427407 HMGXB3Q12766 1538 aa40.51■■■■■ 4.08
DGCR6-203ENST00000427407 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.35■■■■■ 4.05
DGCR6-203ENST00000427407 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.3■■■■■ 4.04
DGCR6-203ENST00000427407 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.27■■■■■ 4.04
DGCR6-203ENST00000427407 ERCC6Q03468 1493 aa40.08■■■■■ 4.01
DGCR6-203ENST00000427407 NESP48681 1621 aa39.97■■■■□ 3.99
DGCR6-203ENST00000427407 CUX2O14529 1486 aa39.95■■■■□ 3.99
DGCR6-203ENST00000427407 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.79■■■■□ 3.96
DGCR6-203ENST00000427407 WIZO95785 1651 aa39.75■■■■□ 3.95
DGCR6-203ENST00000427407 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.58■■■■□ 3.93
DGCR6-203ENST00000427407 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.57■■■■□ 3.93
DGCR6-203ENST00000427407 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.56■■■■□ 3.92
DGCR6-203ENST00000427407 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.55■■■■□ 3.92
DGCR6-203ENST00000427407 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.52■■■■□ 3.92
DGCR6-203ENST00000427407 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.42■■■■□ 3.9
DGCR6-203ENST00000427407 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.35■■■■□ 3.89
DGCR6-203ENST00000427407 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.19■■■■□ 3.86
DGCR6-203ENST00000427407 CFTRP13569 1480 aa39.17■■■■□ 3.86
DGCR6-203ENST00000427407 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.1■■■■□ 3.85
DGCR6-203ENST00000427407 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.08■■■■□ 3.85
DGCR6-203ENST00000427407 WDR62O43379 1518 aa39.08■■■■□ 3.85
DGCR6-203ENST00000427407 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.89■■■■□ 3.82
DGCR6-203ENST00000427407 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.73■■■■□ 3.79
DGCR6-203ENST00000427407 PRDM2Q13029 1718 aa38.71■■■■□ 3.79
DGCR6-203ENST00000427407 TOPBP1Q92547 1522 aa38.38■■■■□ 3.73
DGCR6-203ENST00000427407 ABCC8Q09428 1581 aa38.36■■■■□ 3.73
DGCR6-203ENST00000427407 IFT140Q96RY7 1462 aa38.33■■■■□ 3.73
DGCR6-203ENST00000427407 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.27■■■■□ 3.72
DGCR6-203ENST00000427407 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.18■■■■□ 3.7
DGCR6-203ENST00000427407 OSCARQ8IYS5 282 aa38.16■■■■□ 3.7
DGCR6-203ENST00000427407 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.01■■■■□ 3.67
DGCR6-203ENST00000427407 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38■■■■□ 3.67
DGCR6-203ENST00000427407 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38■■■■□ 3.67
DGCR6-203ENST00000427407 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.98■■■■□ 3.67
DGCR6-203ENST00000427407 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.89■■■■□ 3.66
DGCR6-203ENST00000427407 TRIM41Q8WV44 630 aa37.87■■■■□ 3.65
DGCR6-203ENST00000427407 SOGA1O94964 1423 aa37.84■■■■□ 3.65
DGCR6-203ENST00000427407 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.84■■■■□ 3.65
DGCR6-203ENST00000427407 CUX1P39880 1505 aa37.82■■■■□ 3.64
DGCR6-203ENST00000427407 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.81■■■■□ 3.64
DGCR6-203ENST00000427407 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.7■■■■□ 3.63
DGCR6-203ENST00000427407 WDR97A6NE52 1622 aa37.69■■■■□ 3.62
DGCR6-203ENST00000427407 CHD1O14646 1710 aa37.58■■■■□ 3.61
DGCR6-203ENST00000427407 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.58■■■■□ 3.61
DGCR6-203ENST00000427407 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.58■■■■□ 3.61
DGCR6-203ENST00000427407 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.58■■■■□ 3.61
DGCR6-203ENST00000427407 FBLN2P98095 1184 aa37.55■■■■□ 3.6
DGCR6-203ENST00000427407 ARHGEF11O15085 1522 aa37.53■■■■□ 3.6
DGCR6-203ENST00000427407 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.52■■■■□ 3.6
DGCR6-203ENST00000427407 GRIN2BQ13224 1484 aa37.5■■■■□ 3.59
DGCR6-203ENST00000427407 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.47■■■■□ 3.59
DGCR6-203ENST00000427407 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.43■■■■□ 3.58
DGCR6-203ENST00000427407 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.39■■■■□ 3.58
DGCR6-203ENST00000427407 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.37■■■■□ 3.57
DGCR6-203ENST00000427407 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.35■■■■□ 3.57
DGCR6-203ENST00000427407 SYNJ2O15056 1496 aa37.33■■■■□ 3.57
DGCR6-203ENST00000427407 TOP2BQ02880 1626 aa37.31■■■■□ 3.56
DGCR6-203ENST00000427407 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.31■■■■□ 3.56
DGCR6-203ENST00000427407 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.29■■■■□ 3.56
DGCR6-203ENST00000427407 PBRM1Q86U86 1689 aa37.28■■■■□ 3.56
DGCR6-203ENST00000427407 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.26■■■■□ 3.55
DGCR6-203ENST00000427407 SYNJ1O43426 1573 aa37.25■■■■□ 3.55
DGCR6-203ENST00000427407 CYB5RLQ6IPT4 315 aa37.21■■■■□ 3.55
DGCR6-203ENST00000427407 ARAP1Q96P48 1450 aa37.19■■■■□ 3.54
DGCR6-203ENST00000427407 ADAMTS12P58397 1594 aa37■■■■□ 3.51
DGCR6-203ENST00000427407 GRIN2AQ12879 1464 aa37■■■■□ 3.51
DGCR6-203ENST00000427407 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.96■■■■□ 3.51
DGCR6-203ENST00000427407 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.95■■■■□ 3.51
DGCR6-203ENST00000427407 NUP160Q12769 1436 aa36.89■■■■□ 3.5
DGCR6-203ENST00000427407 CEP170Q5SW79 1584 aa36.83■■■■□ 3.49
DGCR6-203ENST00000427407 TRHP20396 242 aaPredicted RBP36.68■■■■□ 3.46
DGCR6-203ENST00000427407 SHROOM2Q13796 1616 aa36.65■■■■□ 3.46
DGCR6-203ENST00000427407 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.65■■■■□ 3.46
DGCR6-203ENST00000427407 KIF27Q86VH2 1401 aa36.61■■■■□ 3.45
DGCR6-203ENST00000427407 IGF1RP08069 1367 aa36.56■■■■□ 3.44
DGCR6-203ENST00000427407 JPH4Q96JJ6 628 aa36.49■■■■□ 3.43
DGCR6-203ENST00000427407 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP36.48■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.8 ms