RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426694.5

PHYHD1-209, Transcript of phytanoyl-CoA dioxygenase domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene PHYHD1, Length 872 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1-209ENST00000426694 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.24■■■□□ 2.59
PHYHD1-209ENST00000426694 ABCC9O60706 1549 aa28.34■■■□□ 2.13
PHYHD1-209ENST00000426694 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.13■■■□□ 2.09
PHYHD1-209ENST00000426694 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.9■■□□□ 1.9
PHYHD1-209ENST00000426694 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.67■■□□□ 1.86
PHYHD1-209ENST00000426694 NACADO15069 1562 aa26.65■■□□□ 1.86
PHYHD1-209ENST00000426694 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.56■■□□□ 1.84
PHYHD1-209ENST00000426694 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.35■■□□□ 1.81
PHYHD1-209ENST00000426694 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.23■■□□□ 1.79
PHYHD1-209ENST00000426694 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.18■■□□□ 1.78
PHYHD1-209ENST00000426694 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.04■■□□□ 1.76
PHYHD1-209ENST00000426694 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
PHYHD1-209ENST00000426694 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.78■■□□□ 1.72
PHYHD1-209ENST00000426694 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.72■■□□□ 1.71
PHYHD1-209ENST00000426694 SCRIBQ14160 1630 aa25.65■■□□□ 1.7
PHYHD1-209ENST00000426694 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.57■■□□□ 1.68
PHYHD1-209ENST00000426694 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.55■■□□□ 1.68
PHYHD1-209ENST00000426694 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
PHYHD1-209ENST00000426694 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.68■■□□□ 1.54
PHYHD1-209ENST00000426694 NCAPD3P42695 1498 aa24.58■■□□□ 1.52
PHYHD1-209ENST00000426694 ERCC6Q03468 1493 aa24.54■■□□□ 1.52
PHYHD1-209ENST00000426694 CUX2O14529 1486 aa24.51■■□□□ 1.51
PHYHD1-209ENST00000426694 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.48■■□□□ 1.51
PHYHD1-209ENST00000426694 SMARCA2P51531 1590 aa24.44■■□□□ 1.5
PHYHD1-209ENST00000426694 SMARCA4P51532 1647 aa24.42■■□□□ 1.5
PHYHD1-209ENST00000426694 HMGXB3Q12766 1538 aa24.4■■□□□ 1.5
PHYHD1-209ENST00000426694 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
PHYHD1-209ENST00000426694 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
PHYHD1-209ENST00000426694 NESP48681 1621 aa24.25■■□□□ 1.47
PHYHD1-209ENST00000426694 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.16■■□□□ 1.46
PHYHD1-209ENST00000426694 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.09■■□□□ 1.45
PHYHD1-209ENST00000426694 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.06■■□□□ 1.44
PHYHD1-209ENST00000426694 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
PHYHD1-209ENST00000426694 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.98■■□□□ 1.43
PHYHD1-209ENST00000426694 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.96■■□□□ 1.43
PHYHD1-209ENST00000426694 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.84■■□□□ 1.41
PHYHD1-209ENST00000426694 WIZO95785 1651 aa23.77■■□□□ 1.4
PHYHD1-209ENST00000426694 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.76■■□□□ 1.39
PHYHD1-209ENST00000426694 WDR62O43379 1518 aa23.69■■□□□ 1.38
PHYHD1-209ENST00000426694 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.65■■□□□ 1.38
PHYHD1-209ENST00000426694 TRIM41Q8WV44 630 aa23.61■■□□□ 1.37
PHYHD1-209ENST00000426694 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.59■■□□□ 1.37
PHYHD1-209ENST00000426694 CFTRP13569 1480 aa23.51■■□□□ 1.35
PHYHD1-209ENST00000426694 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
PHYHD1-209ENST00000426694 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
PHYHD1-209ENST00000426694 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
PHYHD1-209ENST00000426694 OSCARQ8IYS5 282 aa23.37■■□□□ 1.33
PHYHD1-209ENST00000426694 PRDM2Q13029 1718 aa23.29■■□□□ 1.32
PHYHD1-209ENST00000426694 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.19■■□□□ 1.3
PHYHD1-209ENST00000426694 IFT140Q96RY7 1462 aa23.17■■□□□ 1.3
PHYHD1-209ENST00000426694 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
PHYHD1-209ENST00000426694 TOPBP1Q92547 1522 aa23.1■■□□□ 1.29
PHYHD1-209ENST00000426694 ABCC8Q09428 1581 aa23.07■■□□□ 1.28
PHYHD1-209ENST00000426694 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.07■■□□□ 1.28
PHYHD1-209ENST00000426694 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.07■■□□□ 1.28
PHYHD1-209ENST00000426694 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.07■■□□□ 1.28
PHYHD1-209ENST00000426694 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
PHYHD1-209ENST00000426694 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.01■■□□□ 1.27
PHYHD1-209ENST00000426694 ARHGEF11O15085 1522 aa22.98■■□□□ 1.27
PHYHD1-209ENST00000426694 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.91■■□□□ 1.26
PHYHD1-209ENST00000426694 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
PHYHD1-209ENST00000426694 FBLN2P98095 1184 aa22.88■■□□□ 1.25
PHYHD1-209ENST00000426694 CHD1O14646 1710 aa22.88■■□□□ 1.25
PHYHD1-209ENST00000426694 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
PHYHD1-209ENST00000426694 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.85■■□□□ 1.25
PHYHD1-209ENST00000426694 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.78■■□□□ 1.24
PHYHD1-209ENST00000426694 SOGA1O94964 1423 aa22.77■■□□□ 1.24
PHYHD1-209ENST00000426694 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
PHYHD1-209ENST00000426694 ARAP1Q96P48 1450 aa22.72■■□□□ 1.23
PHYHD1-209ENST00000426694 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
PHYHD1-209ENST00000426694 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.7■■□□□ 1.22
PHYHD1-209ENST00000426694 WDR97A6NE52 1622 aa22.68■■□□□ 1.22
PHYHD1-209ENST00000426694 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.68■■□□□ 1.22
PHYHD1-209ENST00000426694 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
PHYHD1-209ENST00000426694 CUX1P39880 1505 aa22.62■■□□□ 1.21
PHYHD1-209ENST00000426694 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
PHYHD1-209ENST00000426694 SYNJ1O43426 1573 aa22.61■■□□□ 1.21
PHYHD1-209ENST00000426694 GRIN2BQ13224 1484 aa22.6■■□□□ 1.21
PHYHD1-209ENST00000426694 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.58■■□□□ 1.21
PHYHD1-209ENST00000426694 SYNJ2O15056 1496 aa22.54■■□□□ 1.2
PHYHD1-209ENST00000426694 PBRM1Q86U86 1689 aa22.49■■□□□ 1.19
PHYHD1-209ENST00000426694 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.48■■□□□ 1.19
PHYHD1-209ENST00000426694 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.41■■□□□ 1.18
PHYHD1-209ENST00000426694 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.39■■□□□ 1.18
PHYHD1-209ENST00000426694 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
PHYHD1-209ENST00000426694 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.32■■□□□ 1.16
PHYHD1-209ENST00000426694 GRIN2AQ12879 1464 aa22.3■■□□□ 1.16
PHYHD1-209ENST00000426694 ADAMTS12P58397 1594 aa22.25■■□□□ 1.15
PHYHD1-209ENST00000426694 TOP2BQ02880 1626 aa22.22■■□□□ 1.15
PHYHD1-209ENST00000426694 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.22■■□□□ 1.15
PHYHD1-209ENST00000426694 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
PHYHD1-209ENST00000426694 CEP170Q5SW79 1584 aa22.21■■□□□ 1.15
PHYHD1-209ENST00000426694 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.21■■□□□ 1.15
PHYHD1-209ENST00000426694 NUP160Q12769 1436 aa22.2■■□□□ 1.14
PHYHD1-209ENST00000426694 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.19■■□□□ 1.14
PHYHD1-209ENST00000426694 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.15■■□□□ 1.14
PHYHD1-209ENST00000426694 SHROOM2Q13796 1616 aa22.12■■□□□ 1.13
PHYHD1-209ENST00000426694 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
PHYHD1-209ENST00000426694 JPH4Q96JJ6 628 aa22■■□□□ 1.11
PHYHD1-209ENST00000426694 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.2 ms