RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426156.1

FAM3C-203, Transcript of family with sequence similarity 3 member C, humanhuman

TSL 5

Gene FAM3C, Length 662 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3C-203ENST00000426156 NISCHQ9Y2I1 1504 aa66.88■■■■■ 8.3
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FAM3C-203ENST00000426156 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa50.79■■■■■ 5.72
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FAM3C-203ENST00000426156 FANCD2Q9BXW9 1451 aa49.89■■■■■ 5.58
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FAM3C-203ENST00000426156 TOPBP1Q92547 1522 aa49.01■■■■■ 5.44
FAM3C-203ENST00000426156 IFT140Q96RY7 1462 aa48.92■■■■■ 5.42
FAM3C-203ENST00000426156 DNMBPQ6XZF7 1577 aa48.9■■■■■ 5.42
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FAM3C-203ENST00000426156 SOGA1O94964 1423 aa48.38■■■■■ 5.34
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FAM3C-203ENST00000426156 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa48.31■■■■■ 5.32
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FAM3C-203ENST00000426156 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP48.15■■■■■ 5.3
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FAM3C-203ENST00000426156 CHD1O14646 1710 aa47.98■■■■■ 5.27
FAM3C-203ENST00000426156 FBLN2P98095 1184 aa47.97■■■■■ 5.27
FAM3C-203ENST00000426156 GRIN2BQ13224 1484 aa47.9■■■■■ 5.26
FAM3C-203ENST00000426156 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa47.87■■■■■ 5.25
FAM3C-203ENST00000426156 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa47.85■■■■■ 5.25
FAM3C-203ENST00000426156 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP47.84■■■■■ 5.25
FAM3C-203ENST00000426156 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP47.83■■■■■ 5.25
FAM3C-203ENST00000426156 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa47.81■■■■■ 5.24
FAM3C-203ENST00000426156 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa47.81■■■■■ 5.24
FAM3C-203ENST00000426156 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa47.81■■■■■ 5.24
FAM3C-203ENST00000426156 GAPVD1Q14C86 1478 aa47.79■■■■■ 5.24
FAM3C-203ENST00000426156 TOP2BQ02880 1626 aa47.78■■■■■ 5.24
FAM3C-203ENST00000426156 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa47.77■■■■■ 5.24
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FAM3C-203ENST00000426156 ARHGEF11O15085 1522 aa47.74■■■■■ 5.23
FAM3C-203ENST00000426156 PBRM1Q86U86 1689 aa47.68■■■■■ 5.22
FAM3C-203ENST00000426156 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa47.67■■■■■ 5.22
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FAM3C-203ENST00000426156 SYNJ2O15056 1496 aa47.65■■■■■ 5.22
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FAM3C-203ENST00000426156 CYB5RLQ6IPT4 315 aa47.4■■■■■ 5.18
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FAM3C-203ENST00000426156 ERICH3Q5RHP9 1530 aa47.27■■■■■ 5.16
FAM3C-203ENST00000426156 ADAMTS12P58397 1594 aa47.27■■■■■ 5.16
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FAM3C-203ENST00000426156 FHAD1B1AJZ9 1412 aa47.23■■■■■ 5.15
FAM3C-203ENST00000426156 NUP160Q12769 1436 aa47.07■■■■■ 5.13
FAM3C-203ENST00000426156 CEP170Q5SW79 1584 aa46.99■■■■■ 5.11
FAM3C-203ENST00000426156 KIF27Q86VH2 1401 aa46.93■■■■■ 5.1
FAM3C-203ENST00000426156 IGF1RP08069 1367 aa46.79■■■■■ 5.08
FAM3C-203ENST00000426156 SHROOM2Q13796 1616 aa46.77■■■■■ 5.08
FAM3C-203ENST00000426156 TRHP20396 242 aaPredicted RBP46.7■■■■■ 5.07
FAM3C-203ENST00000426156 CUL7Q14999 1698 aa46.7■■■■■ 5.07
FAM3C-203ENST00000426156 ERCC6L2Q5T890 1561 aa46.69■■■■■ 5.06
FAM3C-203ENST00000426156 JPH4Q96JJ6 628 aa46.65■■■■■ 5.06
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