RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426156.1

FAM3C-203, Transcript of family with sequence similarity 3 member C, humanhuman

TSL 5

Gene FAM3C, Length 662 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3C-203ENST00000426156 NISCHQ9Y2I1 1504 aa66.88■■■■■ 8.3
FAM3C-203ENST00000426156 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa59.79■■■■■ 7.16
FAM3C-203ENST00000426156 ABCC9O60706 1549 aa59.12■■■■■ 7.05
FAM3C-203ENST00000426156 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa56.63■■■■■ 6.66
FAM3C-203ENST00000426156 NACADO15069 1562 aa56.42■■■■■ 6.62
FAM3C-203ENST00000426156 DCAF8L2P0C7V8 631 aa56.22■■■■■ 6.59
FAM3C-203ENST00000426156 MYO15BQ96JP2 1530 aa55.87■■■■■ 6.53
FAM3C-203ENST00000426156 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP55.54■■■■■ 6.48
FAM3C-203ENST00000426156 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa55.34■■■■■ 6.45
FAM3C-203ENST00000426156 UNC13AQ9UPW8 1703 aa55.25■■■■■ 6.44
FAM3C-203ENST00000426156 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP55.14■■■■■ 6.42
FAM3C-203ENST00000426156 DNAJC5BQ9UF47 199 aa54.88■■■■■ 6.38
FAM3C-203ENST00000426156 BICRAQ9NZM4 1560 aa54.85■■■■■ 6.37
FAM3C-203ENST00000426156 SCRIBQ14160 1630 aa54.42■■■■■ 6.3
FAM3C-203ENST00000426156 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa54.35■■■■■ 6.29
FAM3C-203ENST00000426156 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP53.5■■■■■ 6.16
FAM3C-203ENST00000426156 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa53.46■■■■■ 6.15
FAM3C-203ENST00000426156 CECR2Q9BXF3 1484 aa53.24■■■■■ 6.11
FAM3C-203ENST00000426156 NCAPD3P42695 1498 aa52.05■■■■■ 5.92
FAM3C-203ENST00000426156 SMARCA4P51532 1647 aa52.02■■■■■ 5.92
FAM3C-203ENST00000426156 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa51.94■■■■■ 5.91
FAM3C-203ENST00000426156 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP51.91■■■■■ 5.9
FAM3C-203ENST00000426156 SMARCA2P51531 1590 aa51.89■■■■■ 5.9
FAM3C-203ENST00000426156 HMGXB3Q12766 1538 aa51.71■■■■■ 5.87
FAM3C-203ENST00000426156 PEG3Q9GZU2 1588 aa51.55■■■■■ 5.84
FAM3C-203ENST00000426156 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP51.49■■■■■ 5.83
FAM3C-203ENST00000426156 MROH2BQ7Z745 1585 aa51.48■■■■■ 5.83
FAM3C-203ENST00000426156 ERCC6Q03468 1493 aa51.08■■■■■ 5.77
FAM3C-203ENST00000426156 NESP48681 1621 aa50.92■■■■■ 5.74
FAM3C-203ENST00000426156 WIZO95785 1651 aa50.89■■■■■ 5.74
FAM3C-203ENST00000426156 CUX2O14529 1486 aa50.81■■■■■ 5.72
FAM3C-203ENST00000426156 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa50.79■■■■■ 5.72
FAM3C-203ENST00000426156 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP50.67■■■■■ 5.7
FAM3C-203ENST00000426156 PDS5BQ9NTI5 1447 aa50.52■■■■■ 5.68
FAM3C-203ENST00000426156 CADPSQ9ULU8 1353 aa50.51■■■■■ 5.68
FAM3C-203ENST00000426156 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP50.35■■■■■ 5.65
FAM3C-203ENST00000426156 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa50.31■■■■■ 5.65
FAM3C-203ENST00000426156 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP50.31■■■■■ 5.64
FAM3C-203ENST00000426156 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa50.09■■■■■ 5.61
FAM3C-203ENST00000426156 CFTRP13569 1480 aa50.03■■■■■ 5.6
FAM3C-203ENST00000426156 MRC2Q9UBG0 1479 aa49.98■■■■■ 5.59
FAM3C-203ENST00000426156 CEP164Q9UPV0 1460 aa49.91■■■■■ 5.58
FAM3C-203ENST00000426156 FANCD2Q9BXW9 1451 aa49.89■■■■■ 5.58
FAM3C-203ENST00000426156 WDR62O43379 1518 aa49.82■■■■■ 5.57
FAM3C-203ENST00000426156 CCDC88BA6NC98 1476 aa49.76■■■■■ 5.56
FAM3C-203ENST00000426156 PRDM2Q13029 1718 aa49.59■■■■■ 5.53
FAM3C-203ENST00000426156 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP49.39■■■■■ 5.5
FAM3C-203ENST00000426156 ABCC8Q09428 1581 aa49.07■■■■■ 5.45
FAM3C-203ENST00000426156 TOPBP1Q92547 1522 aa49.01■■■■■ 5.44
FAM3C-203ENST00000426156 IFT140Q96RY7 1462 aa48.92■■■■■ 5.42
FAM3C-203ENST00000426156 DNMBPQ6XZF7 1577 aa48.9■■■■■ 5.42
FAM3C-203ENST00000426156 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP48.89■■■■■ 5.42
FAM3C-203ENST00000426156 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP48.67■■■■■ 5.38
FAM3C-203ENST00000426156 OSCARQ8IYS5 282 aa48.63■■■■■ 5.38
FAM3C-203ENST00000426156 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP48.54■■■■■ 5.36
FAM3C-203ENST00000426156 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP48.5■■■■■ 5.36
FAM3C-203ENST00000426156 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP48.45■■■■■ 5.35
FAM3C-203ENST00000426156 SOGA1O94964 1423 aa48.38■■■■■ 5.34
FAM3C-203ENST00000426156 CUX1P39880 1505 aa48.34■■■■■ 5.33
FAM3C-203ENST00000426156 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP48.34■■■■■ 5.335e-7■■■■□ 19.7
FAM3C-203ENST00000426156 FGD5Q6ZNL6 1462 aa48.31■■■■■ 5.32
FAM3C-203ENST00000426156 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa48.31■■■■■ 5.32
FAM3C-203ENST00000426156 WDR97A6NE52 1622 aa48.18■■■■■ 5.3
FAM3C-203ENST00000426156 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP48.15■■■■■ 5.3
FAM3C-203ENST00000426156 TRIM41Q8WV44 630 aa48.09■■■■■ 5.29
FAM3C-203ENST00000426156 CHD1O14646 1710 aa47.98■■■■■ 5.27
FAM3C-203ENST00000426156 FBLN2P98095 1184 aa47.97■■■■■ 5.27
FAM3C-203ENST00000426156 GRIN2BQ13224 1484 aa47.9■■■■■ 5.26
FAM3C-203ENST00000426156 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa47.87■■■■■ 5.25
FAM3C-203ENST00000426156 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa47.85■■■■■ 5.25
FAM3C-203ENST00000426156 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP47.84■■■■■ 5.25
FAM3C-203ENST00000426156 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP47.83■■■■■ 5.25
FAM3C-203ENST00000426156 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa47.81■■■■■ 5.24
FAM3C-203ENST00000426156 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa47.81■■■■■ 5.24
FAM3C-203ENST00000426156 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa47.81■■■■■ 5.24
FAM3C-203ENST00000426156 GAPVD1Q14C86 1478 aa47.79■■■■■ 5.24
FAM3C-203ENST00000426156 TOP2BQ02880 1626 aa47.78■■■■■ 5.24
FAM3C-203ENST00000426156 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa47.77■■■■■ 5.24
FAM3C-203ENST00000426156 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP47.76■■■■■ 5.24
FAM3C-203ENST00000426156 ARHGEF11O15085 1522 aa47.74■■■■■ 5.23
FAM3C-203ENST00000426156 PBRM1Q86U86 1689 aa47.68■■■■■ 5.22
FAM3C-203ENST00000426156 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa47.67■■■■■ 5.22
FAM3C-203ENST00000426156 SYNJ1O43426 1573 aa47.66■■■■■ 5.22
FAM3C-203ENST00000426156 SYNJ2O15056 1496 aa47.65■■■■■ 5.22
FAM3C-203ENST00000426156 CLASP1Q7Z460 1538 aa47.46■■■■■ 5.19
FAM3C-203ENST00000426156 CYB5RLQ6IPT4 315 aa47.4■■■■■ 5.18
FAM3C-203ENST00000426156 ARAP1Q96P48 1450 aa47.28■■■■■ 5.16
FAM3C-203ENST00000426156 ERICH3Q5RHP9 1530 aa47.27■■■■■ 5.16
FAM3C-203ENST00000426156 ADAMTS12P58397 1594 aa47.27■■■■■ 5.16
FAM3C-203ENST00000426156 GRIN2AQ12879 1464 aa47.25■■■■■ 5.15
FAM3C-203ENST00000426156 FHAD1B1AJZ9 1412 aa47.23■■■■■ 5.15
FAM3C-203ENST00000426156 NUP160Q12769 1436 aa47.07■■■■■ 5.13
FAM3C-203ENST00000426156 CEP170Q5SW79 1584 aa46.99■■■■■ 5.11
FAM3C-203ENST00000426156 KIF27Q86VH2 1401 aa46.93■■■■■ 5.1
FAM3C-203ENST00000426156 IGF1RP08069 1367 aa46.79■■■■■ 5.08
FAM3C-203ENST00000426156 SHROOM2Q13796 1616 aa46.77■■■■■ 5.08
FAM3C-203ENST00000426156 TRHP20396 242 aaPredicted RBP46.7■■■■■ 5.07
FAM3C-203ENST00000426156 CUL7Q14999 1698 aa46.7■■■■■ 5.07
FAM3C-203ENST00000426156 ERCC6L2Q5T890 1561 aa46.69■■■■■ 5.06
FAM3C-203ENST00000426156 JPH4Q96JJ6 628 aa46.65■■■■■ 5.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.6 ms