RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425333.5

PCBP1-AS1-222, PCBP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene PCBP1-AS1, Length 546 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 NISCHQ9Y2I1 1504 aa13.05□□□□□ -0.32
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 ABCC9O60706 1549 aa11.99□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 CHIC1Q5VXU3 224 aa11.81□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa11.75□□□□□ -0.53
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 DNAJC5BQ9UF47 199 aa11.46□□□□□ -0.57
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa11.29□□□□□ -0.6
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 DCAF8L2P0C7V8 631 aa11.18□□□□□ -0.62
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP11.17□□□□□ -0.62
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 NACADO15069 1562 aa11.16□□□□□ -0.62
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 UNC13AQ9UPW8 1703 aa11.1□□□□□ -0.63
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 BICRAQ9NZM4 1560 aa11□□□□□ -0.65
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 MYO15BQ96JP2 1530 aa10.92□□□□□ -0.66
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa10.81□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 CECR2Q9BXF3 1484 aa10.79□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 SCRIBQ14160 1630 aa10.74□□□□□ -0.69
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa10.73□□□□□ -0.69
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa10.73□□□□□ -0.69
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa10.61□□□□□ -0.71
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 CUX2O14529 1486 aa10.35□□□□□ -0.75
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 ERCC6Q03468 1493 aa10.33□□□□□ -0.76
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 NCAPD3P42695 1498 aa10.32□□□□□ -0.76
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa10.28□□□□□ -0.76
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 NESP48681 1621 aa10.26□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 SMARCA4P51532 1647 aa10.22□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 SMARCA2P51531 1590 aa10.2□□□□□ -0.78
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 HMGXB3Q12766 1538 aa10.2□□□□□ -0.78
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa10.12□□□□□ -0.79
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa10.1□□□□□ -0.79
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 TRIM41Q8WV44 630 aa10.1□□□□□ -0.79
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 PEG3Q9GZU2 1588 aa10.09□□□□□ -0.79
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 MROH2BQ7Z745 1585 aa10.08□□□□□ -0.8
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 PDS5BQ9NTI5 1447 aa10.06□□□□□ -0.8
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 PLPPR3Q6T4P5 718 aa10.01□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 CADPSQ9ULU8 1353 aa10.01□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 EHMT2Q96KQ7 1210 aa10□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 MRC2Q9UBG0 1479 aa9.98□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 WIZO95785 1651 aa9.97□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 WDR62O43379 1518 aa9.95□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 CEP164Q9UPV0 1460 aa9.91□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 OSCARQ8IYS5 282 aa9.9□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 FANCD2Q9BXW9 1451 aa9.89□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 CFTRP13569 1480 aa9.85□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa9.78□□□□□ -0.84
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa9.78□□□□□ -0.84
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa9.78□□□□□ -0.84
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 PRDM2Q13029 1718 aa9.75□□□□□ -0.85
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 ARHGEF11O15085 1522 aa9.72□□□□□ -0.85
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 CYB5RLQ6IPT4 315 aa9.71□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 CCDC88BA6NC98 1476 aa9.71□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 IFT140Q96RY7 1462 aa9.71□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 TOPBP1Q92547 1522 aa9.69□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 SLC24A1O60721 1099 aa9.67□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 CHD1O14646 1710 aa9.66□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 TRHP20396 242 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP9.66□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 FBLN2P98095 1184 aa9.65□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 ABCC8Q09428 1581 aa9.63□□□□□ -0.87
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 DNMBPQ6XZF7 1577 aa9.63□□□□□ -0.87
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 ARAP1Q96P48 1450 aa9.61□□□□□ -0.87
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 KCNA4P22459 653 aa9.59□□□□□ -0.87
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa9.58□□□□□ -0.88
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 SOGA1O94964 1423 aa9.55□□□□□ -0.88
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa9.52□□□□□ -0.89
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 CLASP1Q7Z460 1538 aa9.51□□□□□ -0.89
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 FGD5Q6ZNL6 1462 aa9.49□□□□□ -0.89
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 CUX1P39880 1505 aa9.47□□□□□ -0.89
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 SYNJ1O43426 1573 aa9.47□□□□□ -0.89
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 GRIN2BQ13224 1484 aa9.46□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 WDR97A6NE52 1622 aa9.45□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 CSRNP3Q8WYN3 585 aa9.44□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 SYNJ2O15056 1496 aa9.44□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 PBRM1Q86U86 1689 aa9.43□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 GAPVD1Q14C86 1478 aa9.42□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 ERCC6L2Q5T890 1561 aa9.39□□□□□ -0.91
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa9.37□□□□□ -0.91
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa9.36□□□□□ -0.91
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 GRIN2AQ12879 1464 aa9.34□□□□□ -0.91
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 CEP170Q5SW79 1584 aa9.33□□□□□ -0.92
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 KIF13AQ9H1H9 1805 aa9.31□□□□□ -0.92
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 NUP160Q12769 1436 aa9.31□□□□□ -0.92
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 ADAMTS12P58397 1594 aa9.3□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 92.3 ms