RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425295.1

PCAT6-202, prostate cancer associated transcript 6, humanhuman

TSL 2

Gene PCAT6, Length 634 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCAT6-202ENST00000425295 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.43■■■■■ 5.82
PCAT6-202ENST00000425295 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45.69■■■■■ 4.9
PCAT6-202ENST00000425295 ABCC9O60706 1549 aa45.05■■■■■ 4.8
PCAT6-202ENST00000425295 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.26■■■■■ 4.52
PCAT6-202ENST00000425295 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.19■■■■■ 4.5
PCAT6-202ENST00000425295 NACADO15069 1562 aa43.1■■■■■ 4.49
PCAT6-202ENST00000425295 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.78■■■■■ 4.44
PCAT6-202ENST00000425295 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.76■■■■■ 4.44
PCAT6-202ENST00000425295 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.51■■■■■ 4.4
PCAT6-202ENST00000425295 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.16■■■■■ 4.34
PCAT6-202ENST00000425295 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.06■■■■■ 4.32
PCAT6-202ENST00000425295 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.85■■■■■ 4.29
PCAT6-202ENST00000425295 SCRIBQ14160 1630 aa41.76■■■■■ 4.28
PCAT6-202ENST00000425295 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.58■■■■■ 4.25
PCAT6-202ENST00000425295 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.41■■■■■ 4.22
PCAT6-202ENST00000425295 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.79■■■■■ 4.12
PCAT6-202ENST00000425295 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.67■■■■■ 4.1
PCAT6-202ENST00000425295 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.5■■■■■ 4.07
PCAT6-202ENST00000425295 SMARCA4P51532 1647 aa39.91■■■■□ 3.98
PCAT6-202ENST00000425295 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.87■■■■□ 3.97
PCAT6-202ENST00000425295 NCAPD3P42695 1498 aa39.81■■■■□ 3.96
PCAT6-202ENST00000425295 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.81■■■■□ 3.96
PCAT6-202ENST00000425295 SMARCA2P51531 1590 aa39.72■■■■□ 3.95
PCAT6-202ENST00000425295 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.64■■■■□ 3.94
PCAT6-202ENST00000425295 HMGXB3Q12766 1538 aa39.53■■■■□ 3.92
PCAT6-202ENST00000425295 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.5■■■■□ 3.91
PCAT6-202ENST00000425295 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.47■■■■□ 3.91
PCAT6-202ENST00000425295 WIZO95785 1651 aa39.16■■■■□ 3.86
PCAT6-202ENST00000425295 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.16■■■■□ 3.86
PCAT6-202ENST00000425295 NESP48681 1621 aa38.9■■■■□ 3.82
PCAT6-202ENST00000425295 ERCC6Q03468 1493 aa38.86■■■■□ 3.81
PCAT6-202ENST00000425295 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.75■■■■□ 3.79
PCAT6-202ENST00000425295 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.74■■■■□ 3.79
PCAT6-202ENST00000425295 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.69■■■■□ 3.78
PCAT6-202ENST00000425295 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.58■■■■□ 3.77
PCAT6-202ENST00000425295 CUX2O14529 1486 aa38.47■■■■□ 3.75
PCAT6-202ENST00000425295 CFTRP13569 1480 aa38.37■■■■□ 3.73
PCAT6-202ENST00000425295 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.35■■■■□ 3.73
PCAT6-202ENST00000425295 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.33■■■■□ 3.73
PCAT6-202ENST00000425295 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.26■■■■□ 3.72
PCAT6-202ENST00000425295 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.21■■■■□ 3.71
PCAT6-202ENST00000425295 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.16■■■■□ 3.7
PCAT6-202ENST00000425295 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.16■■■■□ 3.7
PCAT6-202ENST00000425295 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.15■■■■□ 3.7
PCAT6-202ENST00000425295 WDR62O43379 1518 aa37.97■■■■□ 3.67
PCAT6-202ENST00000425295 PRDM2Q13029 1718 aa37.87■■■■□ 3.65
PCAT6-202ENST00000425295 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.81■■■■□ 3.64
PCAT6-202ENST00000425295 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.6■■■■□ 3.61
PCAT6-202ENST00000425295 ABCC8Q09428 1581 aa37.57■■■■□ 3.6
PCAT6-202ENST00000425295 TOPBP1Q92547 1522 aa37.56■■■■□ 3.6
PCAT6-202ENST00000425295 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.46■■■■□ 3.59
PCAT6-202ENST00000425295 IFT140Q96RY7 1462 aa37.39■■■■□ 3.58
PCAT6-202ENST00000425295 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.22■■■■□ 3.55
PCAT6-202ENST00000425295 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.22■■■■□ 3.55
PCAT6-202ENST00000425295 CUX1P39880 1505 aa37.19■■■■□ 3.54
PCAT6-202ENST00000425295 SOGA1O94964 1423 aa37.14■■■■□ 3.54
PCAT6-202ENST00000425295 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.12■■■■□ 3.53
PCAT6-202ENST00000425295 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.11■■■■□ 3.53
PCAT6-202ENST00000425295 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.1■■■■□ 3.53
PCAT6-202ENST00000425295 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.03■■■■□ 3.52
PCAT6-202ENST00000425295 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.99■■■■□ 3.51
PCAT6-202ENST00000425295 OSCARQ8IYS5 282 aa36.97■■■■□ 3.51
PCAT6-202ENST00000425295 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.96■■■■□ 3.51
PCAT6-202ENST00000425295 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.94■■■■□ 3.5
PCAT6-202ENST00000425295 TOP2BQ02880 1626 aa36.79■■■■□ 3.48
PCAT6-202ENST00000425295 WDR97A6NE52 1622 aa36.78■■■■□ 3.48
PCAT6-202ENST00000425295 SYNJ1O43426 1573 aa36.77■■■■□ 3.48
PCAT6-202ENST00000425295 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.75■■■■□ 3.47
PCAT6-202ENST00000425295 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.74■■■■□ 3.47
PCAT6-202ENST00000425295 FBLN2P98095 1184 aa36.72■■■■□ 3.47
PCAT6-202ENST00000425295 GRIN2BQ13224 1484 aa36.69■■■■□ 3.46
PCAT6-202ENST00000425295 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.68■■■■□ 3.46
PCAT6-202ENST00000425295 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.64■■■■□ 3.46
PCAT6-202ENST00000425295 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.58■■■■□ 3.45
PCAT6-202ENST00000425295 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.57■■■■□ 3.44
PCAT6-202ENST00000425295 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.53■■■■□ 3.44
PCAT6-202ENST00000425295 CHD1O14646 1710 aa36.52■■■■□ 3.44
PCAT6-202ENST00000425295 PBRM1Q86U86 1689 aa36.46■■■■□ 3.43
PCAT6-202ENST00000425295 SYNJ2O15056 1496 aa36.45■■■■□ 3.43
PCAT6-202ENST00000425295 TRIM41Q8WV44 630 aa36.34■■■■□ 3.41
PCAT6-202ENST00000425295 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.29■■■■□ 3.4
PCAT6-202ENST00000425295 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.25■■■■□ 3.39
PCAT6-202ENST00000425295 ARHGEF11O15085 1522 aa36.24■■■■□ 3.39
PCAT6-202ENST00000425295 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.23■■■■□ 3.39
PCAT6-202ENST00000425295 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.23■■■■□ 3.39
PCAT6-202ENST00000425295 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.23■■■■□ 3.39
PCAT6-202ENST00000425295 ADAMTS12P58397 1594 aa36.22■■■■□ 3.39
PCAT6-202ENST00000425295 KIF27Q86VH2 1401 aa36.2■■■■□ 3.39
PCAT6-202ENST00000425295 GRIN2AQ12879 1464 aa36.19■■■■□ 3.38
PCAT6-202ENST00000425295 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.18■■■■□ 3.38
PCAT6-202ENST00000425295 IGF1RP08069 1367 aa36.1■■■■□ 3.37
PCAT6-202ENST00000425295 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.05■■■■□ 3.36
PCAT6-202ENST00000425295 NUP160Q12769 1436 aa36.05■■■■□ 3.36
PCAT6-202ENST00000425295 CEP170Q5SW79 1584 aa35.98■■■■□ 3.35
PCAT6-202ENST00000425295 ARAP1Q96P48 1450 aa35.94■■■■□ 3.34
PCAT6-202ENST00000425295 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.89■■■■□ 3.34
PCAT6-202ENST00000425295 CUL7Q14999 1698 aa35.87■■■■□ 3.33
PCAT6-202ENST00000425295 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.79■■■■□ 3.32
PCAT6-202ENST00000425295 JPH4Q96JJ6 628 aa35.79■■■■□ 3.32
PCAT6-202ENST00000425295 SHROOM2Q13796 1616 aa35.7■■■■□ 3.31
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