RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424216.1

GZF1-203, Transcript of GDNF inducible zinc finger protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene GZF1, Length 795 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GZF1-203ENST00000424216 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.54■■■■■ 6.8
GZF1-203ENST00000424216 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.65■■■■■ 5.86
GZF1-203ENST00000424216 ABCC9O60706 1549 aa51.6■■■■■ 5.85
GZF1-203ENST00000424216 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.16■■■■■ 5.46
GZF1-203ENST00000424216 NACADO15069 1562 aa48.85■■■■■ 5.41
GZF1-203ENST00000424216 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.51■■■■■ 5.36
GZF1-203ENST00000424216 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.45■■■■■ 5.35
GZF1-203ENST00000424216 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.22■■■■■ 5.31
GZF1-203ENST00000424216 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.05■■■■■ 5.28
GZF1-203ENST00000424216 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.04■■■■■ 5.28
GZF1-203ENST00000424216 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.73■■■■■ 5.23
GZF1-203ENST00000424216 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.67■■■■■ 5.22
GZF1-203ENST00000424216 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.58■■■■■ 5.21
GZF1-203ENST00000424216 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.14■■■■■ 5.14
GZF1-203ENST00000424216 SCRIBQ14160 1630 aa46.99■■■■■ 5.11
GZF1-203ENST00000424216 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.65■■■■■ 5.06
GZF1-203ENST00000424216 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.56■■■■■ 5.04
GZF1-203ENST00000424216 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.51■■■■■ 5.04
GZF1-203ENST00000424216 NCAPD3P42695 1498 aa45.1■■■■■ 4.81
GZF1-203ENST00000424216 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.94■■■■■ 4.78
GZF1-203ENST00000424216 SMARCA4P51532 1647 aa44.87■■■■■ 4.77
GZF1-203ENST00000424216 SMARCA2P51531 1590 aa44.82■■■■■ 4.77
GZF1-203ENST00000424216 HMGXB3Q12766 1538 aa44.75■■■■■ 4.75
GZF1-203ENST00000424216 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.67■■■■■ 4.74
GZF1-203ENST00000424216 ERCC6Q03468 1493 aa44.56■■■■■ 4.72
GZF1-203ENST00000424216 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.55■■■■■ 4.72
GZF1-203ENST00000424216 CUX2O14529 1486 aa44.54■■■■■ 4.72
GZF1-203ENST00000424216 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.48■■■■■ 4.71
GZF1-203ENST00000424216 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.48■■■■■ 4.71
GZF1-203ENST00000424216 NESP48681 1621 aa44.32■■■■■ 4.69
GZF1-203ENST00000424216 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.31■■■■■ 4.68
GZF1-203ENST00000424216 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.08■■■■■ 4.65
GZF1-203ENST00000424216 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.91■■■■■ 4.62
GZF1-203ENST00000424216 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.83■■■■■ 4.61
GZF1-203ENST00000424216 WIZO95785 1651 aa43.77■■■■■ 4.6
GZF1-203ENST00000424216 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.77■■■■■ 4.6
GZF1-203ENST00000424216 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.72■■■■■ 4.59
GZF1-203ENST00000424216 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.42■■■■■ 4.54
GZF1-203ENST00000424216 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.4■■■■■ 4.54
GZF1-203ENST00000424216 WDR62O43379 1518 aa43.32■■■■■ 4.53
GZF1-203ENST00000424216 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.24■■■■■ 4.51
GZF1-203ENST00000424216 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.22■■■■■ 4.51
GZF1-203ENST00000424216 CFTRP13569 1480 aa43.22■■■■■ 4.51
GZF1-203ENST00000424216 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.19■■■■■ 4.5
GZF1-203ENST00000424216 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.82■■■■■ 4.45
GZF1-203ENST00000424216 PRDM2Q13029 1718 aa42.79■■■■■ 4.44
GZF1-203ENST00000424216 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.74■■■■■ 4.43
GZF1-203ENST00000424216 OSCARQ8IYS5 282 aa42.52■■■■■ 4.4
GZF1-203ENST00000424216 TRIM41Q8WV44 630 aa42.5■■■■■ 4.39
GZF1-203ENST00000424216 IFT140Q96RY7 1462 aa42.4■■■■■ 4.38
GZF1-203ENST00000424216 TOPBP1Q92547 1522 aa42.38■■■■■ 4.37
GZF1-203ENST00000424216 ABCC8Q09428 1581 aa42.35■■■■■ 4.37
GZF1-203ENST00000424216 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.3■■■■■ 4.36
GZF1-203ENST00000424216 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.22■■■■■ 4.35
GZF1-203ENST00000424216 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.05■■■■■ 4.32
GZF1-203ENST00000424216 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.01■■■■■ 4.32
GZF1-203ENST00000424216 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.94■■■■■ 4.3
GZF1-203ENST00000424216 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.92■■■■■ 4.3
GZF1-203ENST00000424216 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.91■■■■■ 4.3
GZF1-203ENST00000424216 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.91■■■■■ 4.3
GZF1-203ENST00000424216 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.91■■■■■ 4.3
GZF1-203ENST00000424216 ARHGEF11O15085 1522 aa41.79■■■■■ 4.28
GZF1-203ENST00000424216 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.77■■■■■ 4.28
GZF1-203ENST00000424216 SOGA1O94964 1423 aa41.76■■■■■ 4.28
GZF1-203ENST00000424216 CHD1O14646 1710 aa41.75■■■■■ 4.27
GZF1-203ENST00000424216 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.66■■■■■ 4.26
GZF1-203ENST00000424216 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.65■■■■■ 4.26
GZF1-203ENST00000424216 WDR97A6NE52 1622 aa41.63■■■■■ 4.26
GZF1-203ENST00000424216 CUX1P39880 1505 aa41.63■■■■■ 4.25
GZF1-203ENST00000424216 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.62■■■■■ 4.25
GZF1-203ENST00000424216 FBLN2P98095 1184 aa41.62■■■■■ 4.25
GZF1-203ENST00000424216 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.49■■■■■ 4.23
GZF1-203ENST00000424216 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.48■■■■■ 4.23
GZF1-203ENST00000424216 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.41■■■■■ 4.22
GZF1-203ENST00000424216 GRIN2BQ13224 1484 aa41.4■■■■■ 4.22
GZF1-203ENST00000424216 ARAP1Q96P48 1450 aa41.37■■■■■ 4.21
GZF1-203ENST00000424216 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.36■■■■■ 4.21
GZF1-203ENST00000424216 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.3■■■■■ 4.2
GZF1-203ENST00000424216 SYNJ1O43426 1573 aa41.28■■■■■ 4.2
GZF1-203ENST00000424216 SYNJ2O15056 1496 aa41.27■■■■■ 4.2
GZF1-203ENST00000424216 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.26■■■■■ 4.2
GZF1-203ENST00000424216 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.23■■■■■ 4.19
GZF1-203ENST00000424216 PBRM1Q86U86 1689 aa41.22■■■■■ 4.19
GZF1-203ENST00000424216 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.15■■■■■ 4.18
GZF1-203ENST00000424216 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.04■■■■■ 4.16
GZF1-203ENST00000424216 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.01■■■■■ 4.16
GZF1-203ENST00000424216 TOP2BQ02880 1626 aa40.98■■■■■ 4.15
GZF1-203ENST00000424216 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.98■■■■■ 4.15
GZF1-203ENST00000424216 GRIN2AQ12879 1464 aa40.86■■■■■ 4.13
GZF1-203ENST00000424216 ADAMTS12P58397 1594 aa40.82■■■■■ 4.13
GZF1-203ENST00000424216 NUP160Q12769 1436 aa40.75■■■■■ 4.11
GZF1-203ENST00000424216 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.74■■■■■ 4.11
GZF1-203ENST00000424216 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.72■■■■■ 4.11
GZF1-203ENST00000424216 CEP170Q5SW79 1584 aa40.69■■■■■ 4.11
GZF1-203ENST00000424216 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.61■■■■■ 4.09
GZF1-203ENST00000424216 SHROOM2Q13796 1616 aa40.56■■■■■ 4.08
GZF1-203ENST00000424216 JPH4Q96JJ6 628 aa40.34■■■■■ 4.05
GZF1-203ENST00000424216 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.33■■■■■ 4.05
GZF1-203ENST00000424216 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.24■■■■■ 4.03
GZF1-203ENST00000424216 KIF27Q86VH2 1401 aa40.19■■■■■ 4.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.9 ms