RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423585.2

APCDD1-202, Transcript of APC down-regulated 1, humanhuman

TSL 3

Gene APCDD1, Length 833 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCDD1-202ENST00000423585 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.41■■■■■ 5.66
APCDD1-202ENST00000423585 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45■■■■■ 4.79
APCDD1-202ENST00000423585 ABCC9O60706 1549 aa44.65■■■■■ 4.74
APCDD1-202ENST00000423585 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.63■■■■■ 4.41
APCDD1-202ENST00000423585 NACADO15069 1562 aa42.45■■■■■ 4.39
APCDD1-202ENST00000423585 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.27■■■■■ 4.36
APCDD1-202ENST00000423585 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.04■■■■■ 4.32
APCDD1-202ENST00000423585 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.89■■■■■ 4.3
APCDD1-202ENST00000423585 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.69■■■■■ 4.26
APCDD1-202ENST00000423585 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.65■■■■■ 4.26
APCDD1-202ENST00000423585 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.64■■■■■ 4.26
APCDD1-202ENST00000423585 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.59■■■■■ 4.25
APCDD1-202ENST00000423585 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.47■■■■■ 4.23
APCDD1-202ENST00000423585 SCRIBQ14160 1630 aa41.07■■■■■ 4.16
APCDD1-202ENST00000423585 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.88■■■■■ 4.13
APCDD1-202ENST00000423585 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.37■■■■■ 4.05
APCDD1-202ENST00000423585 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.34■■■■■ 4.05
APCDD1-202ENST00000423585 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.16■■■■■ 4.02
APCDD1-202ENST00000423585 NCAPD3P42695 1498 aa39.23■■■■□ 3.87
APCDD1-202ENST00000423585 SMARCA4P51532 1647 aa39.22■■■■□ 3.87
APCDD1-202ENST00000423585 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.18■■■■□ 3.86
APCDD1-202ENST00000423585 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.07■■■■□ 3.84
APCDD1-202ENST00000423585 SMARCA2P51531 1590 aa39.04■■■■□ 3.84
APCDD1-202ENST00000423585 HMGXB3Q12766 1538 aa38.96■■■■□ 3.83
APCDD1-202ENST00000423585 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.88■■■■□ 3.81
APCDD1-202ENST00000423585 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.86■■■■□ 3.81
APCDD1-202ENST00000423585 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.78■■■■□ 3.8
APCDD1-202ENST00000423585 NESP48681 1621 aa38.51■■■■□ 3.76
APCDD1-202ENST00000423585 ERCC6Q03468 1493 aa38.45■■■■□ 3.75
APCDD1-202ENST00000423585 WIZO95785 1651 aa38.39■■■■□ 3.74
APCDD1-202ENST00000423585 CUX2O14529 1486 aa38.28■■■■□ 3.72
APCDD1-202ENST00000423585 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.23■■■■□ 3.71
APCDD1-202ENST00000423585 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.21■■■■□ 3.71
APCDD1-202ENST00000423585 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.05■■■■□ 3.68
APCDD1-202ENST00000423585 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.02■■■■□ 3.68
APCDD1-202ENST00000423585 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.98■■■■□ 3.67
APCDD1-202ENST00000423585 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.96■■■■□ 3.67
APCDD1-202ENST00000423585 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.94■■■■□ 3.66
APCDD1-202ENST00000423585 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.8■■■■□ 3.64
APCDD1-202ENST00000423585 CFTRP13569 1480 aa37.72■■■■□ 3.63
APCDD1-202ENST00000423585 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.67■■■■□ 3.62
APCDD1-202ENST00000423585 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.61■■■■□ 3.61
APCDD1-202ENST00000423585 WDR62O43379 1518 aa37.59■■■■□ 3.61
APCDD1-202ENST00000423585 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.58■■■■□ 3.61
APCDD1-202ENST00000423585 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.52■■■■□ 3.6
APCDD1-202ENST00000423585 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.31■■■■□ 3.56
APCDD1-202ENST00000423585 PRDM2Q13029 1718 aa37.27■■■■□ 3.56
APCDD1-202ENST00000423585 TOPBP1Q92547 1522 aa36.95■■■■□ 3.51
APCDD1-202ENST00000423585 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.83■■■■□ 3.49
APCDD1-202ENST00000423585 IFT140Q96RY7 1462 aa36.83■■■■□ 3.49
APCDD1-202ENST00000423585 ABCC8Q09428 1581 aa36.83■■■■□ 3.49
APCDD1-202ENST00000423585 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.79■■■■□ 3.48
APCDD1-202ENST00000423585 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.77■■■■□ 3.48
APCDD1-202ENST00000423585 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.62■■■■□ 3.45
APCDD1-202ENST00000423585 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.61■■■■□ 3.45
APCDD1-202ENST00000423585 OSCARQ8IYS5 282 aa36.57■■■■□ 3.44
APCDD1-202ENST00000423585 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.57■■■■□ 3.44
APCDD1-202ENST00000423585 CUX1P39880 1505 aa36.49■■■■□ 3.43
APCDD1-202ENST00000423585 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.49■■■■□ 3.43
APCDD1-202ENST00000423585 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.48■■■■□ 3.43
APCDD1-202ENST00000423585 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.43■■■■□ 3.42
APCDD1-202ENST00000423585 SOGA1O94964 1423 aa36.42■■■■□ 3.42
APCDD1-202ENST00000423585 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.32■■■■□ 3.4
APCDD1-202ENST00000423585 TRIM41Q8WV44 630 aa36.27■■■■□ 3.4
APCDD1-202ENST00000423585 WDR97A6NE52 1622 aa36.19■■■■□ 3.38
APCDD1-202ENST00000423585 CHD1O14646 1710 aa36.18■■■■□ 3.38
APCDD1-202ENST00000423585 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.11■■■■□ 3.37
APCDD1-202ENST00000423585 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.09■■■■□ 3.37
APCDD1-202ENST00000423585 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.09■■■■□ 3.37
APCDD1-202ENST00000423585 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.09■■■■□ 3.37
APCDD1-202ENST00000423585 FBLN2P98095 1184 aa36.08■■■■□ 3.37
APCDD1-202ENST00000423585 GRIN2BQ13224 1484 aa36.05■■■■□ 3.36
APCDD1-202ENST00000423585 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.05■■■■□ 3.36
APCDD1-202ENST00000423585 ARHGEF11O15085 1522 aa36.04■■■■□ 3.36
APCDD1-202ENST00000423585 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.01■■■■□ 3.36
APCDD1-202ENST00000423585 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36■■■■□ 3.35
APCDD1-202ENST00000423585 SYNJ1O43426 1573 aa35.99■■■■□ 3.35
APCDD1-202ENST00000423585 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.99■■■■□ 3.35
APCDD1-202ENST00000423585 TOP2BQ02880 1626 aa35.98■■■■□ 3.35
APCDD1-202ENST00000423585 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.98■■■■□ 3.35
APCDD1-202ENST00000423585 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.97■■■■□ 3.35
APCDD1-202ENST00000423585 PBRM1Q86U86 1689 aa35.92■■■■□ 3.34
APCDD1-202ENST00000423585 SYNJ2O15056 1496 aa35.89■■■■□ 3.34
APCDD1-202ENST00000423585 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.89■■■■□ 3.34
APCDD1-202ENST00000423585 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.84■■■■□ 3.33
APCDD1-202ENST00000423585 ARAP1Q96P48 1450 aa35.74■■■■□ 3.31
APCDD1-202ENST00000423585 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.71■■■■□ 3.31
APCDD1-202ENST00000423585 ADAMTS12P58397 1594 aa35.65■■■■□ 3.3
APCDD1-202ENST00000423585 GRIN2AQ12879 1464 aa35.61■■■■□ 3.29
APCDD1-202ENST00000423585 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.57■■■■□ 3.29
APCDD1-202ENST00000423585 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.55■■■■□ 3.28
APCDD1-202ENST00000423585 NUP160Q12769 1436 aa35.5■■■■□ 3.27
APCDD1-202ENST00000423585 CEP170Q5SW79 1584 aa35.49■■■■□ 3.27
APCDD1-202ENST00000423585 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.34■■■■□ 3.25
APCDD1-202ENST00000423585 SHROOM2Q13796 1616 aa35.28■■■■□ 3.24
APCDD1-202ENST00000423585 KIF27Q86VH2 1401 aa35.26■■■■□ 3.24
APCDD1-202ENST00000423585 IGF1RP08069 1367 aa35.25■■■■□ 3.23
APCDD1-202ENST00000423585 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.15■■■■□ 3.22
APCDD1-202ENST00000423585 TRHP20396 242 aaPredicted RBP35.12■■■■□ 3.21
APCDD1-202ENST00000423585 CUL7Q14999 1698 aa35.11■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.5 ms