RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000422249.5

NLRX1-205, Transcript of NLR family member X1, humanhuman

TSL 4

Gene NLRX1, Length 544 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRX1-205ENST00000422249 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.3■■■□□ 2.92
NLRX1-205ENST00000422249 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.58■■■□□ 2.33
NLRX1-205ENST00000422249 ABCC9O60706 1549 aa28.77■■■□□ 2.2
NLRX1-205ENST00000422249 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.04
NLRX1-205ENST00000422249 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.69■■■□□ 2.02
NLRX1-205ENST00000422249 NACADO15069 1562 aa27.68■■■□□ 2.02
NLRX1-205ENST00000422249 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.62■■■□□ 2.01
NLRX1-205ENST00000422249 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.51■■■□□ 2
NLRX1-205ENST00000422249 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.51■■□□□ 1.99
NLRX1-205ENST00000422249 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.3■■□□□ 1.96
NLRX1-205ENST00000422249 SCRIBQ14160 1630 aa27.08■■□□□ 1.93
NLRX1-205ENST00000422249 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.97■■□□□ 1.91
NLRX1-205ENST00000422249 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.86■■□□□ 1.89
NLRX1-205ENST00000422249 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.5■■□□□ 1.83
NLRX1-205ENST00000422249 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.23■■□□□ 1.79
NLRX1-205ENST00000422249 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
NLRX1-205ENST00000422249 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.06■■□□□ 1.76
NLRX1-205ENST00000422249 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.99■■□□□ 1.75
NLRX1-205ENST00000422249 SMARCA4P51532 1647 aa25.88■■□□□ 1.73
NLRX1-205ENST00000422249 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
NLRX1-205ENST00000422249 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.73■■□□□ 1.71
NLRX1-205ENST00000422249 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.61■■□□□ 1.69
NLRX1-205ENST00000422249 SMARCA2P51531 1590 aa25.56■■□□□ 1.68
NLRX1-205ENST00000422249 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.56■■□□□ 1.68
NLRX1-205ENST00000422249 WIZO95785 1651 aa25.52■■□□□ 1.68
NLRX1-205ENST00000422249 NCAPD3P42695 1498 aa25.51■■□□□ 1.67
NLRX1-205ENST00000422249 HMGXB3Q12766 1538 aa25.47■■□□□ 1.67
NLRX1-205ENST00000422249 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
NLRX1-205ENST00000422249 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
NLRX1-205ENST00000422249 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
NLRX1-205ENST00000422249 NESP48681 1621 aa25■■□□□ 1.59
NLRX1-205ENST00000422249 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
NLRX1-205ENST00000422249 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.85■■□□□ 1.57
NLRX1-205ENST00000422249 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.85■■□□□ 1.57
NLRX1-205ENST00000422249 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.77■■□□□ 1.56
NLRX1-205ENST00000422249 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.76■■□□□ 1.55
NLRX1-205ENST00000422249 ERCC6Q03468 1493 aa24.7■■□□□ 1.55
NLRX1-205ENST00000422249 CFTRP13569 1480 aa24.7■■□□□ 1.54
NLRX1-205ENST00000422249 PRDM2Q13029 1718 aa24.69■■□□□ 1.54
NLRX1-205ENST00000422249 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
NLRX1-205ENST00000422249 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.59■■□□□ 1.53
NLRX1-205ENST00000422249 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.54■■□□□ 1.52
NLRX1-205ENST00000422249 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.49■■□□□ 1.51
NLRX1-205ENST00000422249 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.43■■□□□ 1.5
NLRX1-205ENST00000422249 WDR62O43379 1518 aa24.39■■□□□ 1.49
NLRX1-205ENST00000422249 CUX2O14529 1486 aa24.36■■□□□ 1.49
NLRX1-205ENST00000422249 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
NLRX1-205ENST00000422249 TOPBP1Q92547 1522 aa24.2■■□□□ 1.47
NLRX1-205ENST00000422249 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.2■■□□□ 1.46
NLRX1-205ENST00000422249 CUX1P39880 1505 aa24.14■■□□□ 1.45
NLRX1-205ENST00000422249 ABCC8Q09428 1581 aa24.11■■□□□ 1.45
NLRX1-205ENST00000422249 SYNJ1O43426 1573 aa24.03■■□□□ 1.44
NLRX1-205ENST00000422249 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
NLRX1-205ENST00000422249 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24■■□□□ 1.43
NLRX1-205ENST00000422249 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.99■■□□□ 1.43
NLRX1-205ENST00000422249 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
NLRX1-205ENST00000422249 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.94■■□□□ 1.42
NLRX1-205ENST00000422249 TOP2BQ02880 1626 aa23.94■■□□□ 1.42
NLRX1-205ENST00000422249 IFT140Q96RY7 1462 aa23.94■■□□□ 1.42
NLRX1-205ENST00000422249 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.94■■□□□ 1.42
NLRX1-205ENST00000422249 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
NLRX1-205ENST00000422249 WDR97A6NE52 1622 aa23.91■■□□□ 1.42
NLRX1-205ENST00000422249 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
NLRX1-205ENST00000422249 SOGA1O94964 1423 aa23.83■■□□□ 1.4
NLRX1-205ENST00000422249 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.75■■□□□ 1.39
NLRX1-205ENST00000422249 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.72■■□□□ 1.39
NLRX1-205ENST00000422249 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.72■■□□□ 1.39
NLRX1-205ENST00000422249 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
NLRX1-205ENST00000422249 PBRM1Q86U86 1689 aa23.7■■□□□ 1.38
NLRX1-205ENST00000422249 CHD1O14646 1710 aa23.59■■□□□ 1.37
NLRX1-205ENST00000422249 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.59■■□□□ 1.37
NLRX1-205ENST00000422249 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.57■■□□□ 1.36
NLRX1-205ENST00000422249 GRIN2BQ13224 1484 aa23.55■■□□□ 1.36
NLRX1-205ENST00000422249 ADAMTS12P58397 1594 aa23.48■■□□□ 1.35
NLRX1-205ENST00000422249 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
NLRX1-205ENST00000422249 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.43■■□□□ 1.34
NLRX1-205ENST00000422249 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.39■■□□□ 1.34
NLRX1-205ENST00000422249 TRIM41Q8WV44 630 aa23.39■■□□□ 1.33
NLRX1-205ENST00000422249 SYNJ2O15056 1496 aa23.38■■□□□ 1.33
NLRX1-205ENST00000422249 KIF27Q86VH2 1401 aa23.38■■□□□ 1.33
NLRX1-205ENST00000422249 FBLN2P98095 1184 aa23.33■■□□□ 1.33
NLRX1-205ENST00000422249 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.33■■□□□ 1.33
NLRX1-205ENST00000422249 CUL7Q14999 1698 aa23.3■■□□□ 1.32
NLRX1-205ENST00000422249 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.3■■□□□ 1.32
NLRX1-205ENST00000422249 GRIN2AQ12879 1464 aa23.3■■□□□ 1.32
NLRX1-205ENST00000422249 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.29■■□□□ 1.32
NLRX1-205ENST00000422249 IGF1RP08069 1367 aa23.27■■□□□ 1.32
NLRX1-205ENST00000422249 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.27■■□□□ 1.32
NLRX1-205ENST00000422249 OSCARQ8IYS5 282 aa23.26■■□□□ 1.31
NLRX1-205ENST00000422249 CEP170Q5SW79 1584 aa23.26■■□□□ 1.31
NLRX1-205ENST00000422249 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
NLRX1-205ENST00000422249 NUP160Q12769 1436 aa23.16■■□□□ 1.3
NLRX1-205ENST00000422249 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.13■■□□□ 1.29
NLRX1-205ENST00000422249 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.13■■□□□ 1.29
NLRX1-205ENST00000422249 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.13■■□□□ 1.29
NLRX1-205ENST00000422249 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.13■■□□□ 1.29
NLRX1-205ENST00000422249 ARHGEF11O15085 1522 aa23.09■■□□□ 1.29
NLRX1-205ENST00000422249 SHROOM2Q13796 1616 aa23.05■■□□□ 1.28
NLRX1-205ENST00000422249 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.04■■□□□ 1.28
NLRX1-205ENST00000422249 PRXQ9BXM0 1461 aa23.04■■□□□ 1.28
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