RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421939.5

CDK9-202, Transcript of cyclin dependent kinase 9, humanhuman

TSL 3

Gene CDK9, Length 702 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK9-202ENST00000421939 NISCHQ9Y2I1 1504 aa64.57■■■■■ 7.93
CDK9-202ENST00000421939 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa57.53■■■■■ 6.8
CDK9-202ENST00000421939 ABCC9O60706 1549 aa56.43■■■■■ 6.62
CDK9-202ENST00000421939 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa54.22■■■■■ 6.27
CDK9-202ENST00000421939 NACADO15069 1562 aa54.11■■■■■ 6.25
CDK9-202ENST00000421939 DCAF8L2P0C7V8 631 aa53.93■■■■■ 6.22
CDK9-202ENST00000421939 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP53.78■■■■■ 6.2
CDK9-202ENST00000421939 MYO15BQ96JP2 1530 aa53.73■■■■■ 6.19
CDK9-202ENST00000421939 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa53.43■■■■■ 6.14
CDK9-202ENST00000421939 UNC13AQ9UPW8 1703 aa52.98■■■■■ 6.07
CDK9-202ENST00000421939 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP52.65■■■■■ 6.02
CDK9-202ENST00000421939 BICRAQ9NZM4 1560 aa52.58■■■■■ 6.01
CDK9-202ENST00000421939 SCRIBQ14160 1630 aa52.48■■■■■ 5.99
CDK9-202ENST00000421939 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa52.05■■■■■ 5.92
CDK9-202ENST00000421939 DNAJC5BQ9UF47 199 aa51.9■■■■■ 5.9
CDK9-202ENST00000421939 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP51.22■■■■■ 5.79
CDK9-202ENST00000421939 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa51.05■■■■■ 5.76
CDK9-202ENST00000421939 CECR2Q9BXF3 1484 aa50.73■■■■■ 5.71
CDK9-202ENST00000421939 SMARCA4P51532 1647 aa50.17■■■■■ 5.62
CDK9-202ENST00000421939 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP50.08■■■■■ 5.61
CDK9-202ENST00000421939 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa49.92■■■■■ 5.58
CDK9-202ENST00000421939 NCAPD3P42695 1498 aa49.9■■■■■ 5.58
CDK9-202ENST00000421939 SMARCA2P51531 1590 aa49.87■■■■■ 5.57
CDK9-202ENST00000421939 MROH2BQ7Z745 1585 aa49.76■■■■■ 5.56
CDK9-202ENST00000421939 HMGXB3Q12766 1538 aa49.7■■■■■ 5.55
CDK9-202ENST00000421939 PEG3Q9GZU2 1588 aa49.68■■■■■ 5.54
CDK9-202ENST00000421939 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP49.51■■■■■ 5.52
CDK9-202ENST00000421939 WIZO95785 1651 aa49.2■■■■■ 5.47
CDK9-202ENST00000421939 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP49.1■■■■■ 5.45
CDK9-202ENST00000421939 NESP48681 1621 aa48.77■■■■■ 5.4
CDK9-202ENST00000421939 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP48.71■■■■■ 5.39
CDK9-202ENST00000421939 ERCC6Q03468 1493 aa48.67■■■■■ 5.38
CDK9-202ENST00000421939 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa48.65■■■■■ 5.38
CDK9-202ENST00000421939 CADPSQ9ULU8 1353 aa48.44■■■■■ 5.35
CDK9-202ENST00000421939 PDS5BQ9NTI5 1447 aa48.31■■■■■ 5.32
CDK9-202ENST00000421939 CUX2O14529 1486 aa48.23■■■■■ 5.31
CDK9-202ENST00000421939 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa48.21■■■■■ 5.31
CDK9-202ENST00000421939 CFTRP13569 1480 aa48.13■■■■■ 5.3
CDK9-202ENST00000421939 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP48.13■■■■■ 5.29
CDK9-202ENST00000421939 CCDC88BA6NC98 1476 aa48.1■■■■■ 5.29
CDK9-202ENST00000421939 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.91■■■■■ 5.26
CDK9-202ENST00000421939 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.89■■■■■ 5.26
CDK9-202ENST00000421939 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.85■■■■■ 5.25
CDK9-202ENST00000421939 PRDM2Q13029 1718 aa47.78■■■■■ 5.24
CDK9-202ENST00000421939 WDR62O43379 1518 aa47.71■■■■■ 5.23
CDK9-202ENST00000421939 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP47.66■■■■■ 5.22
CDK9-202ENST00000421939 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47.45■■■■■ 5.19
CDK9-202ENST00000421939 TOPBP1Q92547 1522 aa47.13■■■■■ 5.14
CDK9-202ENST00000421939 ABCC8Q09428 1581 aa47.09■■■■■ 5.13
CDK9-202ENST00000421939 DNMBPQ6XZF7 1577 aa47.07■■■■■ 5.12
CDK9-202ENST00000421939 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa46.9■■■■■ 5.1
CDK9-202ENST00000421939 IFT140Q96RY7 1462 aa46.88■■■■■ 5.09
CDK9-202ENST00000421939 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP46.72■■■■■ 5.07
CDK9-202ENST00000421939 CUX1P39880 1505 aa46.7■■■■■ 5.07
CDK9-202ENST00000421939 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP46.67■■■■■ 5.06
CDK9-202ENST00000421939 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP46.63■■■■■ 5.06
CDK9-202ENST00000421939 FGD5Q6ZNL6 1462 aa46.57■■■■■ 5.05
CDK9-202ENST00000421939 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP46.52■■■■■ 5.04
CDK9-202ENST00000421939 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa46.49■■■■■ 5.03
CDK9-202ENST00000421939 SOGA1O94964 1423 aa46.48■■■■■ 5.03
CDK9-202ENST00000421939 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP46.36■■■■■ 5.016e-8■■■■■ 33.2
CDK9-202ENST00000421939 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP46.32■■■■■ 5.01
CDK9-202ENST00000421939 WDR97A6NE52 1622 aa46.28■■■■■ 5
CDK9-202ENST00000421939 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa46.26■■■■■ 5
CDK9-202ENST00000421939 TOP2BQ02880 1626 aa46.25■■■■■ 4.99
CDK9-202ENST00000421939 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP46.24■■■■■ 4.99
CDK9-202ENST00000421939 SYNJ1O43426 1573 aa46.24■■■■■ 4.99
CDK9-202ENST00000421939 OSCARQ8IYS5 282 aa46.12■■■■■ 4.97
CDK9-202ENST00000421939 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa46.12■■■■■ 4.97
CDK9-202ENST00000421939 GRIN2BQ13224 1484 aa46■■■■■ 4.95
CDK9-202ENST00000421939 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa45.98■■■■■ 4.95
CDK9-202ENST00000421939 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa45.98■■■■■ 4.95
CDK9-202ENST00000421939 GAPVD1Q14C86 1478 aa45.97■■■■■ 4.95
CDK9-202ENST00000421939 CHD1O14646 1710 aa45.94■■■■■ 4.95
CDK9-202ENST00000421939 PBRM1Q86U86 1689 aa45.92■■■■■ 4.94
CDK9-202ENST00000421939 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP45.91■■■■■ 4.94
CDK9-202ENST00000421939 FBLN2P98095 1184 aa45.82■■■■■ 4.93
CDK9-202ENST00000421939 SYNJ2O15056 1496 aa45.72■■■■■ 4.91
CDK9-202ENST00000421939 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP45.66■■■■■ 4.9
CDK9-202ENST00000421939 ERICH3Q5RHP9 1530 aa45.57■■■■■ 4.88
CDK9-202ENST00000421939 ADAMTS12P58397 1594 aa45.56■■■■■ 4.88
CDK9-202ENST00000421939 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa45.48■■■■■ 4.87
CDK9-202ENST00000421939 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa45.48■■■■■ 4.87
CDK9-202ENST00000421939 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa45.48■■■■■ 4.87
CDK9-202ENST00000421939 CLASP1Q7Z460 1538 aa45.47■■■■■ 4.87
CDK9-202ENST00000421939 ARHGEF11O15085 1522 aa45.46■■■■■ 4.87
CDK9-202ENST00000421939 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45.43■■■■■ 4.86
CDK9-202ENST00000421939 GRIN2AQ12879 1464 aa45.42■■■■■ 4.86
CDK9-202ENST00000421939 KIF27Q86VH2 1401 aa45.37■■■■■ 4.85
CDK9-202ENST00000421939 TRIM41Q8WV44 630 aa45.3■■■■■ 4.84
CDK9-202ENST00000421939 NUP160Q12769 1436 aa45.22■■■■■ 4.83
CDK9-202ENST00000421939 CEP170Q5SW79 1584 aa45.2■■■■■ 4.83
CDK9-202ENST00000421939 IGF1RP08069 1367 aa45.17■■■■■ 4.82
CDK9-202ENST00000421939 CUL7Q14999 1698 aa45.13■■■■■ 4.82
CDK9-202ENST00000421939 ARAP1Q96P48 1450 aa45.09■■■■■ 4.81
CDK9-202ENST00000421939 CYB5RLQ6IPT4 315 aa44.97■■■■■ 4.79
CDK9-202ENST00000421939 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa44.92■■■■■ 4.78
CDK9-202ENST00000421939 SHROOM2Q13796 1616 aa44.9■■■■■ 4.78
CDK9-202ENST00000421939 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.9■■■■■ 4.78
CDK9-202ENST00000421939 ERCC6L2Q5T890 1561 aa44.8■■■■■ 4.76
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