RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421510.5

EHD1-204, Transcript of EH domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene EHD1, Length 1,015 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD1-204ENST00000421510 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.78■■■■■ 5.72
EHD1-204ENST00000421510 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45.46■■■■■ 4.87
EHD1-204ENST00000421510 ABCC9O60706 1549 aa45.18■■■■■ 4.82
EHD1-204ENST00000421510 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.12■■■■■ 4.49
EHD1-204ENST00000421510 NACADO15069 1562 aa42.9■■■■■ 4.46
EHD1-204ENST00000421510 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.68■■■■■ 4.42
EHD1-204ENST00000421510 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.4■■■■■ 4.38
EHD1-204ENST00000421510 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.17■■■■■ 4.34
EHD1-204ENST00000421510 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.13■■■■■ 4.33
EHD1-204ENST00000421510 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.09■■■■■ 4.33
EHD1-204ENST00000421510 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.07■■■■■ 4.33
EHD1-204ENST00000421510 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.96■■■■■ 4.31
EHD1-204ENST00000421510 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.87■■■■■ 4.29
EHD1-204ENST00000421510 SCRIBQ14160 1630 aa41.45■■■■■ 4.23
EHD1-204ENST00000421510 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.34■■■■■ 4.21
EHD1-204ENST00000421510 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.82■■■■■ 4.13
EHD1-204ENST00000421510 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.82■■■■■ 4.12
EHD1-204ENST00000421510 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.66■■■■■ 4.1
EHD1-204ENST00000421510 NCAPD3P42695 1498 aa39.59■■■■□ 3.93
EHD1-204ENST00000421510 SMARCA4P51532 1647 aa39.57■■■■□ 3.92
EHD1-204ENST00000421510 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.52■■■■□ 3.92
EHD1-204ENST00000421510 SMARCA2P51531 1590 aa39.43■■■■□ 3.9
EHD1-204ENST00000421510 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.41■■■■□ 3.9
EHD1-204ENST00000421510 HMGXB3Q12766 1538 aa39.35■■■■□ 3.89
EHD1-204ENST00000421510 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.17■■■■□ 3.86
EHD1-204ENST00000421510 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.17■■■■□ 3.86
EHD1-204ENST00000421510 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.14■■■■□ 3.86
EHD1-204ENST00000421510 ERCC6Q03468 1493 aa38.98■■■■□ 3.83
EHD1-204ENST00000421510 NESP48681 1621 aa38.89■■■■□ 3.82
EHD1-204ENST00000421510 CUX2O14529 1486 aa38.81■■■■□ 3.8
EHD1-204ENST00000421510 WIZO95785 1651 aa38.68■■■■□ 3.78
EHD1-204ENST00000421510 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.66■■■■□ 3.78
EHD1-204ENST00000421510 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.46■■■■□ 3.75
EHD1-204ENST00000421510 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.43■■■■□ 3.74
EHD1-204ENST00000421510 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.43■■■■□ 3.74
EHD1-204ENST00000421510 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.41■■■■□ 3.74
EHD1-204ENST00000421510 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.4■■■■□ 3.74
EHD1-204ENST00000421510 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.4■■■■□ 3.74
EHD1-204ENST00000421510 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.23■■■■□ 3.71
EHD1-204ENST00000421510 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.09■■■■□ 3.69
EHD1-204ENST00000421510 CFTRP13569 1480 aa38.03■■■■□ 3.68
EHD1-204ENST00000421510 CEP164Q9UPV0 1460 aa38■■■■□ 3.67
EHD1-204ENST00000421510 WDR62O43379 1518 aa38■■■■□ 3.67
EHD1-204ENST00000421510 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.98■■■■□ 3.67
EHD1-204ENST00000421510 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.77■■■■□ 3.64
EHD1-204ENST00000421510 PRDM2Q13029 1718 aa37.67■■■■□ 3.62
EHD1-204ENST00000421510 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.66■■■■□ 3.62
EHD1-204ENST00000421510 TOPBP1Q92547 1522 aa37.3■■■■□ 3.56
EHD1-204ENST00000421510 IFT140Q96RY7 1462 aa37.22■■■■□ 3.55
EHD1-204ENST00000421510 ABCC8Q09428 1581 aa37.21■■■■□ 3.55
EHD1-204ENST00000421510 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.19■■■■□ 3.54
EHD1-204ENST00000421510 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.15■■■■□ 3.54
EHD1-204ENST00000421510 OSCARQ8IYS5 282 aa37.04■■■■□ 3.52
EHD1-204ENST00000421510 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.97■■■■□ 3.51
EHD1-204ENST00000421510 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.94■■■■□ 3.5
EHD1-204ENST00000421510 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.94■■■■□ 3.5
EHD1-204ENST00000421510 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.91■■■■□ 3.5
EHD1-204ENST00000421510 TRIM41Q8WV44 630 aa36.88■■■■□ 3.49
EHD1-204ENST00000421510 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.82■■■■□ 3.48
EHD1-204ENST00000421510 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.79■■■■□ 3.48
EHD1-204ENST00000421510 CUX1P39880 1505 aa36.76■■■■□ 3.48
EHD1-204ENST00000421510 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.75■■■■□ 3.47
EHD1-204ENST00000421510 SOGA1O94964 1423 aa36.75■■■■□ 3.47
EHD1-204ENST00000421510 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.65■■■■□ 3.46
EHD1-204ENST00000421510 CHD1O14646 1710 aa36.62■■■■□ 3.45
EHD1-204ENST00000421510 WDR97A6NE52 1622 aa36.59■■■■□ 3.45
EHD1-204ENST00000421510 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.58■■■■□ 3.45
EHD1-204ENST00000421510 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.58■■■■□ 3.45
EHD1-204ENST00000421510 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.58■■■■□ 3.45
EHD1-204ENST00000421510 ARHGEF11O15085 1522 aa36.5■■■■□ 3.43
EHD1-204ENST00000421510 FBLN2P98095 1184 aa36.5■■■■□ 3.43
EHD1-204ENST00000421510 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.49■■■■□ 3.43
EHD1-204ENST00000421510 GRIN2BQ13224 1484 aa36.42■■■■□ 3.42
EHD1-204ENST00000421510 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.39■■■■□ 3.42
EHD1-204ENST00000421510 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.34■■■■□ 3.41
EHD1-204ENST00000421510 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.31■■■■□ 3.4
EHD1-204ENST00000421510 PBRM1Q86U86 1689 aa36.3■■■■□ 3.4
EHD1-204ENST00000421510 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.28■■■■□ 3.4
EHD1-204ENST00000421510 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.28■■■■□ 3.4
EHD1-204ENST00000421510 SYNJ2O15056 1496 aa36.26■■■■□ 3.4
EHD1-204ENST00000421510 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.25■■■■□ 3.39
EHD1-204ENST00000421510 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.25■■■■□ 3.39
EHD1-204ENST00000421510 TOP2BQ02880 1626 aa36.24■■■■□ 3.39
EHD1-204ENST00000421510 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.23■■■■□ 3.39
EHD1-204ENST00000421510 SYNJ1O43426 1573 aa36.23■■■■□ 3.39
EHD1-204ENST00000421510 ARAP1Q96P48 1450 aa36.18■■■■□ 3.38
EHD1-204ENST00000421510 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.17■■■■□ 3.38
EHD1-204ENST00000421510 ADAMTS12P58397 1594 aa35.99■■■■□ 3.35
EHD1-204ENST00000421510 GRIN2AQ12879 1464 aa35.95■■■■□ 3.35
EHD1-204ENST00000421510 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.89■■■■□ 3.34
EHD1-204ENST00000421510 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.88■■■■□ 3.33
EHD1-204ENST00000421510 NUP160Q12769 1436 aa35.83■■■■□ 3.33
EHD1-204ENST00000421510 CEP170Q5SW79 1584 aa35.82■■■■□ 3.32
EHD1-204ENST00000421510 TRHP20396 242 aaPredicted RBP35.68■■■■□ 3.3
EHD1-204ENST00000421510 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.68■■■■□ 3.3
EHD1-204ENST00000421510 SHROOM2Q13796 1616 aa35.64■■■■□ 3.3
EHD1-204ENST00000421510 KIF27Q86VH2 1401 aa35.54■■■■□ 3.28
EHD1-204ENST00000421510 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.48■■■■□ 3.27
EHD1-204ENST00000421510 IGF1RP08069 1367 aa35.48■■■■□ 3.27
EHD1-204ENST00000421510 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP35.44■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.6 ms