RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421185.1

RTCA-AS1-201, RTCA antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RTCA-AS1, Length 423 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTCA-AS1-201ENST00000421185 NISCHQ9Y2I1 1504 aa22.29■■□□□ 1.16
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ABCC9O60706 1549 aa21.14■□□□□ 0.97
RTCA-AS1-201ENST00000421185 DNAJC5BQ9UF47 199 aa20.6■□□□□ 0.89
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa20.27■□□□□ 0.84
RTCA-AS1-201ENST00000421185 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa19.77■□□□□ 0.76
RTCA-AS1-201ENST00000421185 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP19.62■□□□□ 0.73
RTCA-AS1-201ENST00000421185 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa19.61■□□□□ 0.73
RTCA-AS1-201ENST00000421185 NACADO15069 1562 aa19.46■□□□□ 0.71
RTCA-AS1-201ENST00000421185 DCAF8L2P0C7V8 631 aa19.3■□□□□ 0.68
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CECR2Q9BXF3 1484 aa19.16■□□□□ 0.66
RTCA-AS1-201ENST00000421185 BICRAQ9NZM4 1560 aa19.15■□□□□ 0.66
RTCA-AS1-201ENST00000421185 UNC13AQ9UPW8 1703 aa19.13■□□□□ 0.65
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa19.01■□□□□ 0.63
RTCA-AS1-201ENST00000421185 MYO15BQ96JP2 1530 aa18.95■□□□□ 0.62
RTCA-AS1-201ENST00000421185 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa18.92■□□□□ 0.62
RTCA-AS1-201ENST00000421185 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CUX2O14529 1486 aa18.61■□□□□ 0.57
RTCA-AS1-201ENST00000421185 SCRIBQ14160 1630 aa18.44■□□□□ 0.54
RTCA-AS1-201ENST00000421185 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa18.39■□□□□ 0.53
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TRIM41Q8WV44 630 aa18.37■□□□□ 0.53
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ERCC6Q03468 1493 aa18.36■□□□□ 0.53
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
RTCA-AS1-201ENST00000421185 NCAPD3P42695 1498 aa18.01■□□□□ 0.47
RTCA-AS1-201ENST00000421185 NESP48681 1621 aa17.88■□□□□ 0.45
RTCA-AS1-201ENST00000421185 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa17.8■□□□□ 0.44
RTCA-AS1-201ENST00000421185 OSCARQ8IYS5 282 aa17.73■□□□□ 0.43
RTCA-AS1-201ENST00000421185 HMGXB3Q12766 1538 aa17.72■□□□□ 0.43
RTCA-AS1-201ENST00000421185 SMARCA2P51531 1590 aa17.71■□□□□ 0.43
RTCA-AS1-201ENST00000421185 PDS5BQ9NTI5 1447 aa17.71■□□□□ 0.43
RTCA-AS1-201ENST00000421185 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa17.68■□□□□ 0.42
RTCA-AS1-201ENST00000421185 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.41
RTCA-AS1-201ENST00000421185 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP17.57■□□□□ 0.4
RTCA-AS1-201ENST00000421185 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP17.55■□□□□ 0.4
RTCA-AS1-201ENST00000421185 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa17.55■□□□□ 0.4
RTCA-AS1-201ENST00000421185 MRC2Q9UBG0 1479 aa17.51■□□□□ 0.39
RTCA-AS1-201ENST00000421185 SMARCA4P51532 1647 aa17.5■□□□□ 0.39
RTCA-AS1-201ENST00000421185 WDR62O43379 1518 aa17.46■□□□□ 0.39
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CADPSQ9ULU8 1353 aa17.44■□□□□ 0.38
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TRHP20396 242 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
RTCA-AS1-201ENST00000421185 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa17.38■□□□□ 0.37
RTCA-AS1-201ENST00000421185 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa17.38■□□□□ 0.37
RTCA-AS1-201ENST00000421185 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa17.38■□□□□ 0.37
RTCA-AS1-201ENST00000421185 PEG3Q9GZU2 1588 aa17.37■□□□□ 0.37
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CYB5RLQ6IPT4 315 aa17.34■□□□□ 0.37
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ARHGEF11O15085 1522 aa17.28■□□□□ 0.36
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CEP164Q9UPV0 1460 aa17.28■□□□□ 0.36
RTCA-AS1-201ENST00000421185 FANCD2Q9BXW9 1451 aa17.19■□□□□ 0.34
RTCA-AS1-201ENST00000421185 MROH2BQ7Z745 1585 aa17.11■□□□□ 0.33
RTCA-AS1-201ENST00000421185 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ARAP1Q96P48 1450 aa17.05■□□□□ 0.32
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CFTRP13569 1480 aa17.03■□□□□ 0.32
RTCA-AS1-201ENST00000421185 IFT140Q96RY7 1462 aa17■□□□□ 0.31
RTCA-AS1-201ENST00000421185 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
RTCA-AS1-201ENST00000421185 FBLN2P98095 1184 aa16.92■□□□□ 0.3
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
RTCA-AS1-201ENST00000421185 WIZO95785 1651 aa16.82■□□□□ 0.28
RTCA-AS1-201ENST00000421185 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CHD1O14646 1710 aa16.78■□□□□ 0.28
RTCA-AS1-201ENST00000421185 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP16.78■□□□□ 0.28
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ABCC8Q09428 1581 aa16.77■□□□□ 0.27
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TOPBP1Q92547 1522 aa16.75■□□□□ 0.27
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CLASP1Q7Z460 1538 aa16.64■□□□□ 0.25
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
RTCA-AS1-201ENST00000421185 SYNJ1O43426 1573 aa16.61■□□□□ 0.25
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
RTCA-AS1-201ENST00000421185 PRDM2Q13029 1718 aa16.61■□□□□ 0.25
RTCA-AS1-201ENST00000421185 GAPVD1Q14C86 1478 aa16.61■□□□□ 0.25
RTCA-AS1-201ENST00000421185 DNMBPQ6XZF7 1577 aa16.6■□□□□ 0.25
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
RTCA-AS1-201ENST00000421185 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa16.54■□□□□ 0.24
RTCA-AS1-201ENST00000421185 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
RTCA-AS1-201ENST00000421185 SOGA1O94964 1423 aa16.52■□□□□ 0.23
RTCA-AS1-201ENST00000421185 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
RTCA-AS1-201ENST00000421185 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa16.51■□□□□ 0.23
RTCA-AS1-201ENST00000421185 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa16.48■□□□□ 0.23
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CCDC88BA6NC98 1476 aa16.48■□□□□ 0.23
RTCA-AS1-201ENST00000421185 SYNJ2O15056 1496 aa16.47■□□□□ 0.23
RTCA-AS1-201ENST00000421185 WDR97A6NE52 1622 aa16.45■□□□□ 0.22
RTCA-AS1-201ENST00000421185 GRIN2BQ13224 1484 aa16.44■□□□□ 0.22
RTCA-AS1-201ENST00000421185 FAM69CQ0P6D2 419 aa16.38■□□□□ 0.21
RTCA-AS1-201ENST00000421185 KIF13AQ9H1H9 1805 aa16.31■□□□□ 0.2
RTCA-AS1-201ENST00000421185 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP16.31■□□□□ 0.2
RTCA-AS1-201ENST00000421185 FGD5Q6ZNL6 1462 aa16.29■□□□□ 0.2
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ERCC6L2Q5T890 1561 aa16.28■□□□□ 0.2
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ABCC10Q5T3U5 1492 aa16.28■□□□□ 0.2
RTCA-AS1-201ENST00000421185 FBXO41Q8TF61 875 aa16.25■□□□□ 0.19
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CEP170Q5SW79 1584 aa16.23■□□□□ 0.19
RTCA-AS1-201ENST00000421185 KDM6BO15054 1643 aa16.22■□□□□ 0.19
RTCA-AS1-201ENST00000421185 GRIN2AQ12879 1464 aa16.19■□□□□ 0.18
RTCA-AS1-201ENST00000421185 NUP160Q12769 1436 aa16.18■□□□□ 0.18
RTCA-AS1-201ENST00000421185 PBRM1Q86U86 1689 aa16.15■□□□□ 0.18
RTCA-AS1-201ENST00000421185 MAPKBP1O60336 1514 aa16.14■□□□□ 0.17
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CUX1P39880 1505 aa16.13■□□□□ 0.17
RTCA-AS1-201ENST00000421185 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
RTCA-AS1-201ENST00000421185 JPH4Q96JJ6 628 aa16.12■□□□□ 0.17
RTCA-AS1-201ENST00000421185 HECW2Q9P2P5 1572 aa16.12■□□□□ 0.17
RTCA-AS1-201ENST00000421185 SHROOM2Q13796 1616 aa16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12 ms