RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421053.5

SEMA5B-204, Transcript of semaphorin 5B, humanhuman

TSL 3

Gene SEMA5B, Length 716 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA5B-204ENST00000421053 NISCHQ9Y2I1 1504 aa47.1■■■■■ 5.13
SEMA5B-204ENST00000421053 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa42.02■■■■■ 4.32
SEMA5B-204ENST00000421053 ABCC9O60706 1549 aa41.78■■■■■ 4.28
SEMA5B-204ENST00000421053 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa39.78■■■■□ 3.96
SEMA5B-204ENST00000421053 DCAF8L2P0C7V8 631 aa39.59■■■■□ 3.93
SEMA5B-204ENST00000421053 NACADO15069 1562 aa39.59■■■■□ 3.93
SEMA5B-204ENST00000421053 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP39.14■■■■□ 3.86
SEMA5B-204ENST00000421053 UNC13AQ9UPW8 1703 aa39.13■■■■□ 3.85
SEMA5B-204ENST00000421053 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.09■■■■□ 3.85
SEMA5B-204ENST00000421053 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.98■■■■□ 3.83
SEMA5B-204ENST00000421053 DNAJC5BQ9UF47 199 aa38.91■■■■□ 3.82
SEMA5B-204ENST00000421053 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.8■■■■□ 3.8
SEMA5B-204ENST00000421053 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.8■■■■□ 3.8
SEMA5B-204ENST00000421053 SCRIBQ14160 1630 aa38.5■■■■□ 3.75
SEMA5B-204ENST00000421053 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.98■■■■□ 3.67
SEMA5B-204ENST00000421053 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa37.73■■■■□ 3.63
SEMA5B-204ENST00000421053 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.72■■■■□ 3.63
SEMA5B-204ENST00000421053 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.51■■■■□ 3.59
SEMA5B-204ENST00000421053 SMARCA4P51532 1647 aa36.69■■■■□ 3.46
SEMA5B-204ENST00000421053 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.59■■■■□ 3.45
SEMA5B-204ENST00000421053 NCAPD3P42695 1498 aa36.56■■■■□ 3.44
SEMA5B-204ENST00000421053 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP36.46■■■■□ 3.43
SEMA5B-204ENST00000421053 SMARCA2P51531 1590 aa36.41■■■■□ 3.42
SEMA5B-204ENST00000421053 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.4■■■■□ 3.42
SEMA5B-204ENST00000421053 HMGXB3Q12766 1538 aa36.34■■■■□ 3.41
SEMA5B-204ENST00000421053 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.24■■■■□ 3.39
SEMA5B-204ENST00000421053 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.22■■■■□ 3.39
SEMA5B-204ENST00000421053 NESP48681 1621 aa36.08■■■■□ 3.37
SEMA5B-204ENST00000421053 WIZO95785 1651 aa36.02■■■■□ 3.36
SEMA5B-204ENST00000421053 ERCC6Q03468 1493 aa35.91■■■■□ 3.34
SEMA5B-204ENST00000421053 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.73■■■■□ 3.31
SEMA5B-204ENST00000421053 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.67■■■■□ 3.3
SEMA5B-204ENST00000421053 CUX2O14529 1486 aa35.64■■■■□ 3.3
SEMA5B-204ENST00000421053 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.6■■■■□ 3.29
SEMA5B-204ENST00000421053 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.56■■■■□ 3.28
SEMA5B-204ENST00000421053 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.48■■■■□ 3.27
SEMA5B-204ENST00000421053 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.47■■■■□ 3.27
SEMA5B-204ENST00000421053 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.39■■■■□ 3.26
SEMA5B-204ENST00000421053 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa35.2■■■■□ 3.23
SEMA5B-204ENST00000421053 CFTRP13569 1480 aa35.18■■■■□ 3.22
SEMA5B-204ENST00000421053 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.16■■■■□ 3.22
SEMA5B-204ENST00000421053 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.13■■■■□ 3.21
SEMA5B-204ENST00000421053 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.1■■■■□ 3.21
SEMA5B-204ENST00000421053 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.09■■■■□ 3.21
SEMA5B-204ENST00000421053 WDR62O43379 1518 aa35.09■■■■□ 3.21
SEMA5B-204ENST00000421053 PRDM2Q13029 1718 aa34.92■■■■□ 3.18
SEMA5B-204ENST00000421053 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.91■■■■□ 3.18
SEMA5B-204ENST00000421053 TOPBP1Q92547 1522 aa34.55■■■■□ 3.12
SEMA5B-204ENST00000421053 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.5■■■■□ 3.11
SEMA5B-204ENST00000421053 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.44■■■■□ 3.1
SEMA5B-204ENST00000421053 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.42■■■■□ 3.1
SEMA5B-204ENST00000421053 IFT140Q96RY7 1462 aa34.34■■■■□ 3.09
SEMA5B-204ENST00000421053 ABCC8Q09428 1581 aa34.28■■■■□ 3.08
SEMA5B-204ENST00000421053 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.24■■■■□ 3.07
SEMA5B-204ENST00000421053 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.22■■■■□ 3.07
SEMA5B-204ENST00000421053 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.22■■■■□ 3.07
SEMA5B-204ENST00000421053 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.17■■■■□ 3.06
SEMA5B-204ENST00000421053 CUX1P39880 1505 aa34.16■■■■□ 3.06
SEMA5B-204ENST00000421053 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.13■■■■□ 3.05
SEMA5B-204ENST00000421053 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.07■■■■□ 3.05
SEMA5B-204ENST00000421053 OSCARQ8IYS5 282 aa34.06■■■■□ 3.04
SEMA5B-204ENST00000421053 SOGA1O94964 1423 aa34.01■■■■□ 3.03
SEMA5B-204ENST00000421053 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.98■■■■□ 3.03
SEMA5B-204ENST00000421053 CHD1O14646 1710 aa33.94■■■■□ 3.02
SEMA5B-204ENST00000421053 TRIM41Q8WV44 630 aa33.94■■■■□ 3.02
SEMA5B-204ENST00000421053 WDR97A6NE52 1622 aa33.86■■■■□ 3.01
SEMA5B-204ENST00000421053 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa33.78■■■■□ 3
SEMA5B-204ENST00000421053 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa33.78■■■■□ 3
SEMA5B-204ENST00000421053 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa33.78■■■■□ 3
SEMA5B-204ENST00000421053 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa33.78■■■■□ 3
SEMA5B-204ENST00000421053 FBLN2P98095 1184 aa33.75■■■□□ 2.99
SEMA5B-204ENST00000421053 SYNJ1O43426 1573 aa33.74■■■□□ 2.99
SEMA5B-204ENST00000421053 PBRM1Q86U86 1689 aa33.68■■■□□ 2.98
SEMA5B-204ENST00000421053 ARHGEF11O15085 1522 aa33.67■■■□□ 2.98
SEMA5B-204ENST00000421053 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.67■■■□□ 2.98
SEMA5B-204ENST00000421053 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.65■■■□□ 2.98
SEMA5B-204ENST00000421053 TOP2BQ02880 1626 aa33.64■■■□□ 2.98
SEMA5B-204ENST00000421053 GRIN2BQ13224 1484 aa33.64■■■□□ 2.98
SEMA5B-204ENST00000421053 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.64■■■□□ 2.98
SEMA5B-204ENST00000421053 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.64■■■□□ 2.98
SEMA5B-204ENST00000421053 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.61■■■□□ 2.97
SEMA5B-204ENST00000421053 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP33.57■■■□□ 2.97
SEMA5B-204ENST00000421053 CLASP1Q7Z460 1538 aa33.49■■■□□ 2.95
SEMA5B-204ENST00000421053 SYNJ2O15056 1496 aa33.49■■■□□ 2.95
SEMA5B-204ENST00000421053 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP33.48■■■□□ 2.95
SEMA5B-204ENST00000421053 ARAP1Q96P48 1450 aa33.41■■■□□ 2.94
SEMA5B-204ENST00000421053 ADAMTS12P58397 1594 aa33.36■■■□□ 2.93
SEMA5B-204ENST00000421053 CYB5RLQ6IPT4 315 aa33.36■■■□□ 2.93
SEMA5B-204ENST00000421053 GRIN2AQ12879 1464 aa33.26■■■□□ 2.92
SEMA5B-204ENST00000421053 CEP170Q5SW79 1584 aa33.22■■■□□ 2.91
SEMA5B-204ENST00000421053 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.19■■■□□ 2.9
SEMA5B-204ENST00000421053 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.16■■■□□ 2.9
SEMA5B-204ENST00000421053 ERCC6L2Q5T890 1561 aa33.15■■■□□ 2.9
SEMA5B-204ENST00000421053 NUP160Q12769 1436 aa33.12■■■□□ 2.89
SEMA5B-204ENST00000421053 SHROOM2Q13796 1616 aa32.97■■■□□ 2.87
SEMA5B-204ENST00000421053 IGF1RP08069 1367 aa32.93■■■□□ 2.86
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SEMA5B-204ENST00000421053 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32.88■■■□□ 2.85
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SEMA5B-204ENST00000421053 CUL7Q14999 1698 aa32.81■■■□□ 2.84
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