RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421044.1

EEF1GP3-201, Transcript of eukaryotic translation elongation factor 1 gamma pseudogene 3, humanhuman

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Gene EEF1GP3, Length 1,288 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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EEF1GP3-201ENST00000421044 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.78■■□□□ 1.72
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EEF1GP3-201ENST00000421044 SCRIBQ14160 1630 aa24.63■■□□□ 1.53
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EEF1GP3-201ENST00000421044 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.44■■□□□ 1.5
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EEF1GP3-201ENST00000421044 SMARCA2P51531 1590 aa23.49■■□□□ 1.35
EEF1GP3-201ENST00000421044 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.48■■□□□ 1.35
EEF1GP3-201ENST00000421044 HMGXB3Q12766 1538 aa23.43■■□□□ 1.34
EEF1GP3-201ENST00000421044 ERCC6Q03468 1493 aa23.43■■□□□ 1.34
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EEF1GP3-201ENST00000421044 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.92■■□□□ 1.26
EEF1GP3-201ENST00000421044 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.79■■□□□ 1.24
EEF1GP3-201ENST00000421044 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
EEF1GP3-201ENST00000421044 WDR62O43379 1518 aa22.7■■□□□ 1.22
EEF1GP3-201ENST00000421044 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.69■■□□□ 1.22
EEF1GP3-201ENST00000421044 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.67■■□□□ 1.22
EEF1GP3-201ENST00000421044 CFTRP13569 1480 aa22.66■■□□□ 1.22
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EEF1GP3-201ENST00000421044 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
EEF1GP3-201ENST00000421044 TRIM41Q8WV44 630 aa22.44■■□□□ 1.18
EEF1GP3-201ENST00000421044 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.43■■□□□ 1.18
EEF1GP3-201ENST00000421044 OSCARQ8IYS5 282 aa22.4■■□□□ 1.18
EEF1GP3-201ENST00000421044 PRDM2Q13029 1718 aa22.34■■□□□ 1.17
EEF1GP3-201ENST00000421044 IFT140Q96RY7 1462 aa22.26■■□□□ 1.15
EEF1GP3-201ENST00000421044 TOPBP1Q92547 1522 aa22.22■■□□□ 1.15
EEF1GP3-201ENST00000421044 ABCC8Q09428 1581 aa22.21■■□□□ 1.15
EEF1GP3-201ENST00000421044 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
EEF1GP3-201ENST00000421044 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.12■■□□□ 1.13
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EEF1GP3-201ENST00000421044 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.03■■□□□ 1.12
EEF1GP3-201ENST00000421044 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
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EEF1GP3-201ENST00000421044 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa21.99■■□□□ 1.11
EEF1GP3-201ENST00000421044 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa21.99■■□□□ 1.11
EEF1GP3-201ENST00000421044 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
EEF1GP3-201ENST00000421044 FBLN2P98095 1184 aa21.95■■□□□ 1.1
EEF1GP3-201ENST00000421044 SOGA1O94964 1423 aa21.95■■□□□ 1.1
EEF1GP3-201ENST00000421044 ARHGEF11O15085 1522 aa21.94■■□□□ 1.1
EEF1GP3-201ENST00000421044 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.93■■□□□ 1.1
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EEF1GP3-201ENST00000421044 CHD1O14646 1710 aa21.86■■□□□ 1.09
EEF1GP3-201ENST00000421044 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.85■■□□□ 1.09
EEF1GP3-201ENST00000421044 CUX1P39880 1505 aa21.8■■□□□ 1.08
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EEF1GP3-201ENST00000421044 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
EEF1GP3-201ENST00000421044 WDR97A6NE52 1622 aa21.78■■□□□ 1.08
EEF1GP3-201ENST00000421044 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.77■■□□□ 1.07
EEF1GP3-201ENST00000421044 GRIN2BQ13224 1484 aa21.73■■□□□ 1.07
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EEF1GP3-201ENST00000421044 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.61■■□□□ 1.05
EEF1GP3-201ENST00000421044 PBRM1Q86U86 1689 aa21.56■■□□□ 1.04
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EEF1GP3-201ENST00000421044 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.53■■□□□ 1.04
EEF1GP3-201ENST00000421044 TOP2BQ02880 1626 aa21.45■■□□□ 1.02
EEF1GP3-201ENST00000421044 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.44■■□□□ 1.02
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EEF1GP3-201ENST00000421044 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.38■■□□□ 1.01
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EEF1GP3-201ENST00000421044 NUP160Q12769 1436 aa21.37■■□□□ 1.01
EEF1GP3-201ENST00000421044 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.34■■□□□ 1.01
EEF1GP3-201ENST00000421044 CEP170Q5SW79 1584 aa21.33■■□□□ 1.01
EEF1GP3-201ENST00000421044 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.3■■□□□ 1
EEF1GP3-201ENST00000421044 SHROOM2Q13796 1616 aa21.23■□□□□ 0.99
EEF1GP3-201ENST00000421044 JPH4Q96JJ6 628 aa21.23■□□□□ 0.99
EEF1GP3-201ENST00000421044 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.2■□□□□ 0.98
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EEF1GP3-201ENST00000421044 KIF27Q86VH2 1401 aa21.09■□□□□ 0.97
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