RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419059.1

SLC19A3-204, Transcript of solute carrier family 19 member 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SLC19A3, Length 852 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC19A3-204ENST00000419059 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP30.19■■■□□ 2.42
SLC19A3-204ENST00000419059 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.47■■■□□ 2.31
SLC19A3-204ENST00000419059 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.46■■■□□ 2.31
SLC19A3-204ENST00000419059 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.32■■□□□ 1.8
SLC19A3-204ENST00000419059 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
SLC19A3-204ENST00000419059 ABCC9O60706 1549 aa25.83■■□□□ 1.72
SLC19A3-204ENST00000419059 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
SLC19A3-204ENST00000419059 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.82■■□□□ 1.56
SLC19A3-204ENST00000419059 NACADO15069 1562 aa24.76■■□□□ 1.55
SLC19A3-204ENST00000419059 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.57■■□□□ 1.52
SLC19A3-204ENST00000419059 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
SLC19A3-204ENST00000419059 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.54■■□□□ 1.52
SLC19A3-204ENST00000419059 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.4■■□□□ 1.5
SLC19A3-204ENST00000419059 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.26■■□□□ 1.47
SLC19A3-204ENST00000419059 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.07■■□□□ 1.44
SLC19A3-204ENST00000419059 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.04■■□□□ 1.44
SLC19A3-204ENST00000419059 SCRIBQ14160 1630 aa23.95■■□□□ 1.43
SLC19A3-204ENST00000419059 PLPPR3Q6T4P5 718 aa23.91■■□□□ 1.42
SLC19A3-204ENST00000419059 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.86■■□□□ 1.41
SLC19A3-204ENST00000419059 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.78■■□□□ 1.4
SLC19A3-204ENST00000419059 FOXD1Q16676 465 aa23.71■■□□□ 1.39
SLC19A3-204ENST00000419059 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
SLC19A3-204ENST00000419059 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.39■■□□□ 1.33
SLC19A3-204ENST00000419059 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.24■■□□□ 1.31
SLC19A3-204ENST00000419059 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.92■■□□□ 1.26
SLC19A3-204ENST00000419059 SMARCA4P51532 1647 aa22.92■■□□□ 1.26
SLC19A3-204ENST00000419059 ADRA2BP18089 450 aa22.88■■□□□ 1.25
SLC19A3-204ENST00000419059 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
SLC19A3-204ENST00000419059 NCAPD3P42695 1498 aa22.82■■□□□ 1.24
SLC19A3-204ENST00000419059 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.8■■□□□ 1.24
SLC19A3-204ENST00000419059 SMARCA2P51531 1590 aa22.79■■□□□ 1.24
SLC19A3-204ENST00000419059 HMGXB3Q12766 1538 aa22.74■■□□□ 1.23
SLC19A3-204ENST00000419059 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.72■■□□□ 1.23
SLC19A3-204ENST00000419059 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.69■■□□□ 1.22
SLC19A3-204ENST00000419059 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
SLC19A3-204ENST00000419059 WIZO95785 1651 aa22.44■■□□□ 1.18
SLC19A3-204ENST00000419059 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
SLC19A3-204ENST00000419059 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
SLC19A3-204ENST00000419059 NESP48681 1621 aa22.31■■□□□ 1.16
SLC19A3-204ENST00000419059 ERCC6Q03468 1493 aa22.28■■□□□ 1.16
SLC19A3-204ENST00000419059 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.27■■□□□ 1.16
SLC19A3-204ENST00000419059 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SLC19A3-204ENST00000419059 CUX2O14529 1486 aa22.15■■□□□ 1.14
SLC19A3-204ENST00000419059 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.12■■□□□ 1.13
SLC19A3-204ENST00000419059 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.08■■□□□ 1.13
SLC19A3-204ENST00000419059 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
SLC19A3-204ENST00000419059 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.07■■□□□ 1.12
SLC19A3-204ENST00000419059 CFTRP13569 1480 aa21.99■■□□□ 1.11
SLC19A3-204ENST00000419059 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.91■■□□□ 1.1
SLC19A3-204ENST00000419059 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.9■■□□□ 1.1
SLC19A3-204ENST00000419059 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.9■■□□□ 1.1
SLC19A3-204ENST00000419059 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.89■■□□□ 1.09
SLC19A3-204ENST00000419059 PRDM2Q13029 1718 aa21.86■■□□□ 1.09
SLC19A3-204ENST00000419059 WDR62O43379 1518 aa21.85■■□□□ 1.09
SLC19A3-204ENST00000419059 MSH5O43196 834 aa21.72■■□□□ 1.07
SLC19A3-204ENST00000419059 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
SLC19A3-204ENST00000419059 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
SLC19A3-204ENST00000419059 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa21.56■■□□□ 1.04
SLC19A3-204ENST00000419059 TOPBP1Q92547 1522 aa21.53■■□□□ 1.04
SLC19A3-204ENST00000419059 ABCC8Q09428 1581 aa21.51■■□□□ 1.03
SLC19A3-204ENST00000419059 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.51■■□□□ 1.03
SLC19A3-204ENST00000419059 IFT140Q96RY7 1462 aa21.44■■□□□ 1.02
SLC19A3-204ENST00000419059 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
SLC19A3-204ENST00000419059 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
SLC19A3-204ENST00000419059 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
SLC19A3-204ENST00000419059 CUX1P39880 1505 aa21.3■■□□□ 1
SLC19A3-204ENST00000419059 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
SLC19A3-204ENST00000419059 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.26■□□□□ 0.99
SLC19A3-204ENST00000419059 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.21■□□□□ 0.99
SLC19A3-204ENST00000419059 SOGA1O94964 1423 aa21.2■□□□□ 0.98
SLC19A3-204ENST00000419059 WDR97A6NE52 1622 aa21.19■□□□□ 0.98
SLC19A3-204ENST00000419059 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.17■□□□□ 0.98
SLC19A3-204ENST00000419059 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa21.13■□□□□ 0.97
SLC19A3-204ENST00000419059 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.11■□□□□ 0.97
SLC19A3-204ENST00000419059 OSCARQ8IYS5 282 aa21.1■□□□□ 0.97
SLC19A3-204ENST00000419059 TOP2BQ02880 1626 aa21.1■□□□□ 0.97
SLC19A3-204ENST00000419059 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.09■□□□□ 0.97
SLC19A3-204ENST00000419059 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
SLC19A3-204ENST00000419059 SYNJ1O43426 1573 aa21.08■□□□□ 0.97
SLC19A3-204ENST00000419059 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.05■□□□□ 0.96
SLC19A3-204ENST00000419059 CHD1O14646 1710 aa21.04■□□□□ 0.96
SLC19A3-204ENST00000419059 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.02■□□□□ 0.96
SLC19A3-204ENST00000419059 GRIN2BQ13224 1484 aa21.01■□□□□ 0.95
SLC19A3-204ENST00000419059 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.01■□□□□ 0.95
SLC19A3-204ENST00000419059 PBRM1Q86U86 1689 aa20.99■□□□□ 0.95
SLC19A3-204ENST00000419059 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
SLC19A3-204ENST00000419059 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.98■□□□□ 0.95
SLC19A3-204ENST00000419059 SYNJ2O15056 1496 aa20.9■□□□□ 0.94
SLC19A3-204ENST00000419059 FBLN2P98095 1184 aa20.89■□□□□ 0.93
SLC19A3-204ENST00000419059 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa20.86■□□□□ 0.93
SLC19A3-204ENST00000419059 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa20.86■□□□□ 0.93
SLC19A3-204ENST00000419059 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa20.86■□□□□ 0.93
SLC19A3-204ENST00000419059 ARHGEF11O15085 1522 aa20.85■□□□□ 0.93
SLC19A3-204ENST00000419059 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
SLC19A3-204ENST00000419059 ADAMTS12P58397 1594 aa20.83■□□□□ 0.92
SLC19A3-204ENST00000419059 CLASP1Q7Z460 1538 aa20.83■□□□□ 0.92
SLC19A3-204ENST00000419059 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.81■□□□□ 0.92
SLC19A3-204ENST00000419059 KCNA4P22459 653 aa20.78■□□□□ 0.92
SLC19A3-204ENST00000419059 TRIM41Q8WV44 630 aa20.77■□□□□ 0.92
SLC19A3-204ENST00000419059 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.8 ms