RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418795.3

FAM27E3-201, Transcript of family with sequence similarity 27 member E3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM27E3, Length 1,593 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3-201ENST00000418795 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.24■■■□□ 2.59
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FAM27E3-201ENST00000418795 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.15■■□□□ 1.78
FAM27E3-201ENST00000418795 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.14■■□□□ 1.78
FAM27E3-201ENST00000418795 NACADO15069 1562 aa26.11■■□□□ 1.77
FAM27E3-201ENST00000418795 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
FAM27E3-201ENST00000418795 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.94■■□□□ 1.74
FAM27E3-201ENST00000418795 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.81■■□□□ 1.72
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FAM27E3-201ENST00000418795 SCRIBQ14160 1630 aa25.36■■□□□ 1.65
FAM27E3-201ENST00000418795 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.14■■□□□ 1.62
FAM27E3-201ENST00000418795 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.07■■□□□ 1.6
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FAM27E3-201ENST00000418795 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.65■■□□□ 1.54
FAM27E3-201ENST00000418795 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.49■■□□□ 1.51
FAM27E3-201ENST00000418795 SMARCA4P51532 1647 aa24.24■■□□□ 1.47
FAM27E3-201ENST00000418795 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
FAM27E3-201ENST00000418795 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.14■■□□□ 1.46
FAM27E3-201ENST00000418795 NCAPD3P42695 1498 aa24.13■■□□□ 1.45
FAM27E3-201ENST00000418795 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.09■■□□□ 1.45
FAM27E3-201ENST00000418795 SMARCA2P51531 1590 aa24.06■■□□□ 1.44
FAM27E3-201ENST00000418795 PEG3Q9GZU2 1588 aa24■■□□□ 1.43
FAM27E3-201ENST00000418795 HMGXB3Q12766 1538 aa23.98■■□□□ 1.43
FAM27E3-201ENST00000418795 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
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FAM27E3-201ENST00000418795 NESP48681 1621 aa23.6■■□□□ 1.37
FAM27E3-201ENST00000418795 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
FAM27E3-201ENST00000418795 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.47■■□□□ 1.35
FAM27E3-201ENST00000418795 ERCC6Q03468 1493 aa23.47■■□□□ 1.35
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FAM27E3-201ENST00000418795 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.32■■□□□ 1.32
FAM27E3-201ENST00000418795 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.29■■□□□ 1.32
FAM27E3-201ENST00000418795 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.29■■□□□ 1.32
FAM27E3-201ENST00000418795 CFTRP13569 1480 aa23.27■■□□□ 1.32
FAM27E3-201ENST00000418795 CUX2O14529 1486 aa23.24■■□□□ 1.31
FAM27E3-201ENST00000418795 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
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FAM27E3-201ENST00000418795 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.15■■□□□ 1.3
FAM27E3-201ENST00000418795 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.11■■□□□ 1.29
FAM27E3-201ENST00000418795 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.09■■□□□ 1.29
FAM27E3-201ENST00000418795 PRDM2Q13029 1718 aa23.05■■□□□ 1.28
FAM27E3-201ENST00000418795 WDR62O43379 1518 aa23.03■■□□□ 1.28
FAM27E3-201ENST00000418795 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
FAM27E3-201ENST00000418795 TOPBP1Q92547 1522 aa22.77■■□□□ 1.24
FAM27E3-201ENST00000418795 ABCC8Q09428 1581 aa22.73■■□□□ 1.23
FAM27E3-201ENST00000418795 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.73■■□□□ 1.23
FAM27E3-201ENST00000418795 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.64■■□□□ 1.22
FAM27E3-201ENST00000418795 IFT140Q96RY7 1462 aa22.62■■□□□ 1.21
FAM27E3-201ENST00000418795 CUX1P39880 1505 aa22.6■■□□□ 1.21
FAM27E3-201ENST00000418795 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
FAM27E3-201ENST00000418795 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.2
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FAM27E3-201ENST00000418795 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.52■■□□□ 1.2
FAM27E3-201ENST00000418795 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.51■■□□□ 1.19
FAM27E3-201ENST00000418795 SOGA1O94964 1423 aa22.48■■□□□ 1.19
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FAM27E3-201ENST00000418795 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.44■■□□□ 1.18
FAM27E3-201ENST00000418795 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.41■■□□□ 1.18
FAM27E3-201ENST00000418795 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
FAM27E3-201ENST00000418795 SYNJ1O43426 1573 aa22.38■■□□□ 1.17
FAM27E3-201ENST00000418795 TOP2BQ02880 1626 aa22.36■■□□□ 1.17
FAM27E3-201ENST00000418795 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.36■■□□□ 1.17
FAM27E3-201ENST00000418795 WDR97A6NE52 1622 aa22.32■■□□□ 1.16
FAM27E3-201ENST00000418795 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.29■■□□□ 1.16
FAM27E3-201ENST00000418795 OSCARQ8IYS5 282 aa22.29■■□□□ 1.16
FAM27E3-201ENST00000418795 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.22■■□□□ 1.15
FAM27E3-201ENST00000418795 GRIN2BQ13224 1484 aa22.21■■□□□ 1.15
FAM27E3-201ENST00000418795 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.21■■□□□ 1.15
FAM27E3-201ENST00000418795 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.21■■□□□ 1.15
FAM27E3-201ENST00000418795 CHD1O14646 1710 aa22.18■■□□□ 1.14
FAM27E3-201ENST00000418795 PBRM1Q86U86 1689 aa22.16■■□□□ 1.14
FAM27E3-201ENST00000418795 FBLN2P98095 1184 aa22.16■■□□□ 1.14
FAM27E3-201ENST00000418795 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
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FAM27E3-201ENST00000418795 ADAMTS12P58397 1594 aa21.99■■□□□ 1.11
FAM27E3-201ENST00000418795 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.95■■□□□ 1.11
FAM27E3-201ENST00000418795 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.95■■□□□ 1.1
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FAM27E3-201ENST00000418795 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa21.94■■□□□ 1.1
FAM27E3-201ENST00000418795 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa21.94■■□□□ 1.1
FAM27E3-201ENST00000418795 GRIN2AQ12879 1464 aa21.94■■□□□ 1.1
FAM27E3-201ENST00000418795 ARHGEF11O15085 1522 aa21.94■■□□□ 1.1
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FAM27E3-201ENST00000418795 TRIM41Q8WV44 630 aa21.88■■□□□ 1.09
FAM27E3-201ENST00000418795 NUP160Q12769 1436 aa21.85■■□□□ 1.09
FAM27E3-201ENST00000418795 CEP170Q5SW79 1584 aa21.85■■□□□ 1.09
FAM27E3-201ENST00000418795 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.79■■□□□ 1.08
FAM27E3-201ENST00000418795 CUL7Q14999 1698 aa21.78■■□□□ 1.08
FAM27E3-201ENST00000418795 ARAP1Q96P48 1450 aa21.77■■□□□ 1.08
FAM27E3-201ENST00000418795 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.75■■□□□ 1.07
FAM27E3-201ENST00000418795 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.75■■□□□ 1.07
FAM27E3-201ENST00000418795 SHROOM2Q13796 1616 aa21.68■■□□□ 1.06
FAM27E3-201ENST00000418795 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.68■■□□□ 1.06
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