RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418779.5

C1orf228-203, Transcript of Uncharacterized protein C1orf228, humanhuman

TSL 2

Gene C1orf228, Length 757 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf228-203ENST00000418779 NISCHQ9Y2I1 1504 aa65.92■■■■■ 8.14
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C1orf228-203ENST00000418779 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa55.5■■■■■ 6.48
C1orf228-203ENST00000418779 NACADO15069 1562 aa55.33■■■■■ 6.45
C1orf228-203ENST00000418779 DCAF8L2P0C7V8 631 aa55.23■■■■■ 6.43
C1orf228-203ENST00000418779 MYO15BQ96JP2 1530 aa54.84■■■■■ 6.37
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C1orf228-203ENST00000418779 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa54.47■■■■■ 6.31
C1orf228-203ENST00000418779 UNC13AQ9UPW8 1703 aa54.39■■■■■ 6.3
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C1orf228-203ENST00000418779 SCRIBQ14160 1630 aa53.64■■■■■ 6.18
C1orf228-203ENST00000418779 DNAJC5BQ9UF47 199 aa53.64■■■■■ 6.18
C1orf228-203ENST00000418779 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa53.17■■■■■ 6.1
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C1orf228-203ENST00000418779 CECR2Q9BXF3 1484 aa52.08■■■■■ 5.93
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C1orf228-203ENST00000418779 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa51.07■■■■■ 5.77
C1orf228-203ENST00000418779 SMARCA2P51531 1590 aa50.94■■■■■ 5.74
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C1orf228-203ENST00000418779 HMGXB3Q12766 1538 aa50.78■■■■■ 5.72
C1orf228-203ENST00000418779 PEG3Q9GZU2 1588 aa50.73■■■■■ 5.71
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C1orf228-203ENST00000418779 NESP48681 1621 aa50.07■■■■■ 5.61
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C1orf228-203ENST00000418779 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa49.79■■■■■ 5.56
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C1orf228-203ENST00000418779 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa49.47■■■■■ 5.51
C1orf228-203ENST00000418779 PDS5BQ9NTI5 1447 aa49.43■■■■■ 5.5
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C1orf228-203ENST00000418779 CCDC88BA6NC98 1476 aa49.11■■■■■ 5.45
C1orf228-203ENST00000418779 FANCD2Q9BXW9 1451 aa49.01■■■■■ 5.44
C1orf228-203ENST00000418779 MRC2Q9UBG0 1479 aa48.99■■■■■ 5.43
C1orf228-203ENST00000418779 CEP164Q9UPV0 1460 aa48.97■■■■■ 5.43
C1orf228-203ENST00000418779 WDR62O43379 1518 aa48.87■■■■■ 5.41
C1orf228-203ENST00000418779 PRDM2Q13029 1718 aa48.83■■■■■ 5.41
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C1orf228-203ENST00000418779 DNMBPQ6XZF7 1577 aa48.09■■■■■ 5.29
C1orf228-203ENST00000418779 ABCC8Q09428 1581 aa48.09■■■■■ 5.29
C1orf228-203ENST00000418779 IFT140Q96RY7 1462 aa47.95■■■■■ 5.27
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C1orf228-203ENST00000418779 FGD5Q6ZNL6 1462 aa47.59■■■■■ 5.21
C1orf228-203ENST00000418779 SOGA1O94964 1423 aa47.54■■■■■ 5.2
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C1orf228-203ENST00000418779 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP47.35■■■■■ 5.17
C1orf228-203ENST00000418779 WDR97A6NE52 1622 aa47.26■■■■■ 5.16
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C1orf228-203ENST00000418779 TOP2BQ02880 1626 aa47.16■■■■■ 5.14
C1orf228-203ENST00000418779 CHD1O14646 1710 aa47.15■■■■■ 5.14
C1orf228-203ENST00000418779 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa47.08■■■■■ 5.13
C1orf228-203ENST00000418779 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa47.05■■■■■ 5.12
C1orf228-203ENST00000418779 GRIN2BQ13224 1484 aa47.02■■■■■ 5.12
C1orf228-203ENST00000418779 GAPVD1Q14C86 1478 aa46.98■■■■■ 5.11
C1orf228-203ENST00000418779 FBLN2P98095 1184 aa46.98■■■■■ 5.11
C1orf228-203ENST00000418779 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa46.97■■■■■ 5.11
C1orf228-203ENST00000418779 PBRM1Q86U86 1689 aa46.97■■■■■ 5.11
C1orf228-203ENST00000418779 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP46.92■■■■■ 5.1
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C1orf228-203ENST00000418779 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa46.78■■■■■ 5.08
C1orf228-203ENST00000418779 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa46.78■■■■■ 5.08
C1orf228-203ENST00000418779 SYNJ2O15056 1496 aa46.76■■■■■ 5.08
C1orf228-203ENST00000418779 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP46.76■■■■■ 5.08
C1orf228-203ENST00000418779 ARHGEF11O15085 1522 aa46.69■■■■■ 5.07
C1orf228-203ENST00000418779 CLASP1Q7Z460 1538 aa46.59■■■■■ 5.05
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C1orf228-203ENST00000418779 ERICH3Q5RHP9 1530 aa46.49■■■■■ 5.03
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C1orf228-203ENST00000418779 FHAD1B1AJZ9 1412 aa46.4■■■■■ 5.02
C1orf228-203ENST00000418779 ARAP1Q96P48 1450 aa46.31■■■■■ 5
C1orf228-203ENST00000418779 CYB5RLQ6IPT4 315 aa46.27■■■■■ 5
C1orf228-203ENST00000418779 CEP170Q5SW79 1584 aa46.26■■■■■ 5
C1orf228-203ENST00000418779 NUP160Q12769 1436 aa46.24■■■■■ 4.99
C1orf228-203ENST00000418779 KIF27Q86VH2 1401 aa46.2■■■■■ 4.99
C1orf228-203ENST00000418779 IGF1RP08069 1367 aa46.13■■■■■ 4.98
C1orf228-203ENST00000418779 CUL7Q14999 1698 aa46■■■■■ 4.95
C1orf228-203ENST00000418779 ERCC6L2Q5T890 1561 aa45.98■■■■■ 4.95
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C1orf228-203ENST00000418779 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa45.82■■■■■ 4.93
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