RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418719.1

ZKSCAN7-203, Transcript of zinc finger with KRAB and SCAN domains 7, humanhuman

TSL 2

Gene ZKSCAN7, Length 1,294 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN7-203ENST00000418719 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.23■■■■■ 6.27
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ZKSCAN7-203ENST00000418719 ABCC9O60706 1549 aa46.95■■■■■ 5.11
ZKSCAN7-203ENST00000418719 NACADO15069 1562 aa45.28■■■■■ 4.84
ZKSCAN7-203ENST00000418719 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.28■■■■■ 4.84
ZKSCAN7-203ENST00000418719 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.21■■■■■ 4.83
ZKSCAN7-203ENST00000418719 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.18■■■■■ 4.82
ZKSCAN7-203ENST00000418719 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.1■■■■■ 4.81
ZKSCAN7-203ENST00000418719 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.93■■■■■ 4.78
ZKSCAN7-203ENST00000418719 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.2■■■■■ 4.67
ZKSCAN7-203ENST00000418719 SCRIBQ14160 1630 aa43.91■■■■■ 4.62
ZKSCAN7-203ENST00000418719 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.88■■■■■ 4.62
ZKSCAN7-203ENST00000418719 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.88■■■■■ 4.61
ZKSCAN7-203ENST00000418719 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.52■■■■■ 4.56
ZKSCAN7-203ENST00000418719 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.98■■■■■ 4.47
ZKSCAN7-203ENST00000418719 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.72■■■■■ 4.43
ZKSCAN7-203ENST00000418719 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.5■■■■■ 4.39
ZKSCAN7-203ENST00000418719 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.21■■■■■ 4.35
ZKSCAN7-203ENST00000418719 SMARCA4P51532 1647 aa42.04■■■■■ 4.32
ZKSCAN7-203ENST00000418719 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.04■■■■■ 4.32
ZKSCAN7-203ENST00000418719 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.79■■■■■ 4.28
ZKSCAN7-203ENST00000418719 NCAPD3P42695 1498 aa41.78■■■■■ 4.28
ZKSCAN7-203ENST00000418719 SMARCA2P51531 1590 aa41.77■■■■■ 4.28
ZKSCAN7-203ENST00000418719 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.76■■■■■ 4.28
ZKSCAN7-203ENST00000418719 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.67■■■■■ 4.26
ZKSCAN7-203ENST00000418719 HMGXB3Q12766 1538 aa41.58■■■■■ 4.25
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ZKSCAN7-203ENST00000418719 WIZO95785 1651 aa41.3■■■■■ 4.2
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ZKSCAN7-203ENST00000418719 NESP48681 1621 aa40.66■■■■■ 4.1
ZKSCAN7-203ENST00000418719 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.65■■■■■ 4.1
ZKSCAN7-203ENST00000418719 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.55■■■■■ 4.08
ZKSCAN7-203ENST00000418719 ERCC6Q03468 1493 aa40.49■■■■■ 4.07
ZKSCAN7-203ENST00000418719 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.43■■■■■ 4.06
ZKSCAN7-203ENST00000418719 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.37■■■■■ 4.05
ZKSCAN7-203ENST00000418719 CFTRP13569 1480 aa40.34■■■■■ 4.05
ZKSCAN7-203ENST00000418719 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.34■■■■■ 4.05
ZKSCAN7-203ENST00000418719 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.19■■■■■ 4.02
ZKSCAN7-203ENST00000418719 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.07■■■■■ 4.01
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ZKSCAN7-203ENST00000418719 TOPBP1Q92547 1522 aa39.45■■■■□ 3.91
ZKSCAN7-203ENST00000418719 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.42■■■■□ 3.9
ZKSCAN7-203ENST00000418719 IFT140Q96RY7 1462 aa39.19■■■■□ 3.86
ZKSCAN7-203ENST00000418719 CUX1P39880 1505 aa39.18■■■■□ 3.86
ZKSCAN7-203ENST00000418719 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.11■■■■□ 3.85
ZKSCAN7-203ENST00000418719 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.04■■■■□ 3.84
ZKSCAN7-203ENST00000418719 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39■■■■□ 3.83
ZKSCAN7-203ENST00000418719 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.99■■■■□ 3.83
ZKSCAN7-203ENST00000418719 SOGA1O94964 1423 aa38.97■■■■□ 3.83
ZKSCAN7-203ENST00000418719 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.95■■■■□ 3.83
ZKSCAN7-203ENST00000418719 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.92■■■■□ 3.82
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ZKSCAN7-203ENST00000418719 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.89■■■■□ 3.82
ZKSCAN7-203ENST00000418719 SYNJ1O43426 1573 aa38.87■■■■□ 3.81
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ZKSCAN7-203ENST00000418719 WDR97A6NE52 1622 aa38.76■■■■□ 3.8
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ZKSCAN7-203ENST00000418719 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.69■■■■□ 3.78
ZKSCAN7-203ENST00000418719 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.66■■■■□ 3.78
ZKSCAN7-203ENST00000418719 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.52■■■■□ 3.76
ZKSCAN7-203ENST00000418719 GRIN2BQ13224 1484 aa38.51■■■■□ 3.76
ZKSCAN7-203ENST00000418719 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.51■■■■□ 3.76
ZKSCAN7-203ENST00000418719 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.41■■■■□ 3.74
ZKSCAN7-203ENST00000418719 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.41■■■■□ 3.74
ZKSCAN7-203ENST00000418719 PBRM1Q86U86 1689 aa38.4■■■■□ 3.74
ZKSCAN7-203ENST00000418719 OSCARQ8IYS5 282 aa38.4■■■■□ 3.74
ZKSCAN7-203ENST00000418719 CHD1O14646 1710 aa38.29■■■■□ 3.72
ZKSCAN7-203ENST00000418719 SYNJ2O15056 1496 aa38.24■■■■□ 3.71
ZKSCAN7-203ENST00000418719 FBLN2P98095 1184 aa38.24■■■■□ 3.71
ZKSCAN7-203ENST00000418719 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.23■■■■□ 3.71
ZKSCAN7-203ENST00000418719 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.2■■■■□ 3.71
ZKSCAN7-203ENST00000418719 KIF27Q86VH2 1401 aa38.19■■■■□ 3.7
ZKSCAN7-203ENST00000418719 TRIM41Q8WV44 630 aa38.14■■■■□ 3.7
ZKSCAN7-203ENST00000418719 ADAMTS12P58397 1594 aa38.13■■■■□ 3.69
ZKSCAN7-203ENST00000418719 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.1■■■■□ 3.69
ZKSCAN7-203ENST00000418719 IGF1RP08069 1367 aa38.01■■■■□ 3.68
ZKSCAN7-203ENST00000418719 GRIN2AQ12879 1464 aa38■■■■□ 3.67
ZKSCAN7-203ENST00000418719 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.92■■■■□ 3.66
ZKSCAN7-203ENST00000418719 CUL7Q14999 1698 aa37.9■■■■□ 3.66
ZKSCAN7-203ENST00000418719 NUP160Q12769 1436 aa37.85■■■■□ 3.65
ZKSCAN7-203ENST00000418719 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.81■■■■□ 3.64
ZKSCAN7-203ENST00000418719 CEP170Q5SW79 1584 aa37.79■■■■□ 3.64
ZKSCAN7-203ENST00000418719 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.78■■■■□ 3.64
ZKSCAN7-203ENST00000418719 ARHGEF11O15085 1522 aa37.77■■■■□ 3.64
ZKSCAN7-203ENST00000418719 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.75■■■■□ 3.63
ZKSCAN7-203ENST00000418719 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.74■■■■□ 3.63
ZKSCAN7-203ENST00000418719 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.74■■■■□ 3.63
ZKSCAN7-203ENST00000418719 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.74■■■■□ 3.63
ZKSCAN7-203ENST00000418719 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa37.58■■■■□ 3.61
ZKSCAN7-203ENST00000418719 EEA1Q15075 1411 aa37.56■■■■□ 3.6
ZKSCAN7-203ENST00000418719 SHROOM2Q13796 1616 aa37.54■■■■□ 3.6
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