RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418339.5

TRIOBP-208, Transcript of TRIO and F-actin binding protein, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2

Gene TRIOBP, Length 939 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBP-208ENST00000418339 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.87■■■■■ 5.57
TRIOBP-208ENST00000418339 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.66■■■■■ 4.74
TRIOBP-208ENST00000418339 ABCC9O60706 1549 aa44.26■■■■■ 4.68
TRIOBP-208ENST00000418339 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.35■■■■■ 4.37
TRIOBP-208ENST00000418339 NACADO15069 1562 aa42.11■■■■■ 4.33
TRIOBP-208ENST00000418339 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.05■■■■■ 4.32
TRIOBP-208ENST00000418339 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.6■■■■■ 4.25
TRIOBP-208ENST00000418339 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.4■■■■■ 4.22
TRIOBP-208ENST00000418339 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.37■■■■■ 4.21
TRIOBP-208ENST00000418339 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.26■■■■■ 4.2
TRIOBP-208ENST00000418339 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.22■■■■■ 4.19
TRIOBP-208ENST00000418339 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.08■■■■■ 4.17
TRIOBP-208ENST00000418339 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.99■■■■■ 4.15
TRIOBP-208ENST00000418339 SCRIBQ14160 1630 aa40.71■■■■■ 4.11
TRIOBP-208ENST00000418339 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.55■■■■■ 4.08
TRIOBP-208ENST00000418339 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.01■■■■■ 4
TRIOBP-208ENST00000418339 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.01■■■■□ 3.99
TRIOBP-208ENST00000418339 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.84■■■■□ 3.97
TRIOBP-208ENST00000418339 SMARCA4P51532 1647 aa38.85■■■■□ 3.81
TRIOBP-208ENST00000418339 NCAPD3P42695 1498 aa38.82■■■■□ 3.81
TRIOBP-208ENST00000418339 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.76■■■■□ 3.8
TRIOBP-208ENST00000418339 SMARCA2P51531 1590 aa38.74■■■■□ 3.79
TRIOBP-208ENST00000418339 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.74■■■■□ 3.79
TRIOBP-208ENST00000418339 HMGXB3Q12766 1538 aa38.61■■■■□ 3.77
TRIOBP-208ENST00000418339 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.47■■■■□ 3.75
TRIOBP-208ENST00000418339 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.44■■■■□ 3.74
TRIOBP-208ENST00000418339 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.41■■■■□ 3.74
TRIOBP-208ENST00000418339 ERCC6Q03468 1493 aa38.27■■■■□ 3.72
TRIOBP-208ENST00000418339 NESP48681 1621 aa38.09■■■■□ 3.69
TRIOBP-208ENST00000418339 CUX2O14529 1486 aa38.02■■■■□ 3.68
TRIOBP-208ENST00000418339 WIZO95785 1651 aa38.01■■■■□ 3.68
TRIOBP-208ENST00000418339 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.95■■■■□ 3.67
TRIOBP-208ENST00000418339 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.75■■■■□ 3.63
TRIOBP-208ENST00000418339 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.73■■■■□ 3.63
TRIOBP-208ENST00000418339 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.69■■■■□ 3.62
TRIOBP-208ENST00000418339 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.68■■■■□ 3.62
TRIOBP-208ENST00000418339 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.65■■■■□ 3.62
TRIOBP-208ENST00000418339 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.56■■■■□ 3.6
TRIOBP-208ENST00000418339 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.53■■■■□ 3.6
TRIOBP-208ENST00000418339 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.36■■■■□ 3.57
TRIOBP-208ENST00000418339 CFTRP13569 1480 aa37.32■■■■□ 3.56
TRIOBP-208ENST00000418339 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.31■■■■□ 3.56
TRIOBP-208ENST00000418339 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.27■■■■□ 3.56
TRIOBP-208ENST00000418339 WDR62O43379 1518 aa37.23■■■■□ 3.55
TRIOBP-208ENST00000418339 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.11■■■■□ 3.53
TRIOBP-208ENST00000418339 PRDM2Q13029 1718 aa37.09■■■■□ 3.53
TRIOBP-208ENST00000418339 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.9■■■■□ 3.5
TRIOBP-208ENST00000418339 ABCC8Q09428 1581 aa36.61■■■■□ 3.45
TRIOBP-208ENST00000418339 TOPBP1Q92547 1522 aa36.59■■■■□ 3.45
TRIOBP-208ENST00000418339 IFT140Q96RY7 1462 aa36.54■■■■□ 3.44
TRIOBP-208ENST00000418339 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.53■■■■□ 3.44
TRIOBP-208ENST00000418339 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.45■■■■□ 3.43
TRIOBP-208ENST00000418339 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.39■■■■□ 3.42
TRIOBP-208ENST00000418339 OSCARQ8IYS5 282 aa36.36■■■■□ 3.41
TRIOBP-208ENST00000418339 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.26■■■■□ 3.39
TRIOBP-208ENST00000418339 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.24■■■■□ 3.39
TRIOBP-208ENST00000418339 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.23■■■■□ 3.39
TRIOBP-208ENST00000418339 TRIM41Q8WV44 630 aa36.13■■■■□ 3.37
TRIOBP-208ENST00000418339 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.12■■■■□ 3.37
TRIOBP-208ENST00000418339 SOGA1O94964 1423 aa36.11■■■■□ 3.37
TRIOBP-208ENST00000418339 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.1■■■■□ 3.37
TRIOBP-208ENST00000418339 CUX1P39880 1505 aa36.08■■■■□ 3.37
TRIOBP-208ENST00000418339 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.08■■■■□ 3.37
TRIOBP-208ENST00000418339 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.97■■■■□ 3.35
TRIOBP-208ENST00000418339 CHD1O14646 1710 aa35.96■■■■□ 3.35
TRIOBP-208ENST00000418339 WDR97A6NE52 1622 aa35.95■■■■□ 3.35
TRIOBP-208ENST00000418339 FBLN2P98095 1184 aa35.91■■■■□ 3.34
TRIOBP-208ENST00000418339 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.83■■■■□ 3.33
TRIOBP-208ENST00000418339 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.83■■■■□ 3.33
TRIOBP-208ENST00000418339 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.83■■■■□ 3.33
TRIOBP-208ENST00000418339 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.8■■■■□ 3.32
TRIOBP-208ENST00000418339 GRIN2BQ13224 1484 aa35.76■■■■□ 3.32
TRIOBP-208ENST00000418339 ARHGEF11O15085 1522 aa35.74■■■■□ 3.31
TRIOBP-208ENST00000418339 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.73■■■■□ 3.31
TRIOBP-208ENST00000418339 PBRM1Q86U86 1689 aa35.69■■■■□ 3.3
TRIOBP-208ENST00000418339 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.69■■■■□ 3.3
TRIOBP-208ENST00000418339 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.68■■■■□ 3.3
TRIOBP-208ENST00000418339 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.68■■■■□ 3.3
TRIOBP-208ENST00000418339 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.66■■■■□ 3.3
TRIOBP-208ENST00000418339 TOP2BQ02880 1626 aa35.65■■■■□ 3.3
TRIOBP-208ENST00000418339 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.65■■■■□ 3.3
TRIOBP-208ENST00000418339 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.61■■■■□ 3.29
TRIOBP-208ENST00000418339 SYNJ2O15056 1496 aa35.6■■■■□ 3.29
TRIOBP-208ENST00000418339 SYNJ1O43426 1573 aa35.59■■■■□ 3.29
TRIOBP-208ENST00000418339 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.48■■■■□ 3.27
TRIOBP-208ENST00000418339 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.47■■■■□ 3.27
TRIOBP-208ENST00000418339 ARAP1Q96P48 1450 aa35.39■■■■□ 3.26
TRIOBP-208ENST00000418339 ADAMTS12P58397 1594 aa35.32■■■■□ 3.24
TRIOBP-208ENST00000418339 GRIN2AQ12879 1464 aa35.29■■■■□ 3.24
TRIOBP-208ENST00000418339 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.27■■■■□ 3.24
TRIOBP-208ENST00000418339 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.24■■■■□ 3.23
TRIOBP-208ENST00000418339 CEP170Q5SW79 1584 aa35.13■■■■□ 3.21
TRIOBP-208ENST00000418339 NUP160Q12769 1436 aa35.12■■■■□ 3.21
TRIOBP-208ENST00000418339 TRHP20396 242 aaPredicted RBP35.03■■■■□ 3.2
TRIOBP-208ENST00000418339 KIF27Q86VH2 1401 aa34.98■■■■□ 3.19
TRIOBP-208ENST00000418339 SHROOM2Q13796 1616 aa34.95■■■■□ 3.18
TRIOBP-208ENST00000418339 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.93■■■■□ 3.18
TRIOBP-208ENST00000418339 CUL7Q14999 1698 aa34.88■■■■□ 3.17
TRIOBP-208ENST00000418339 IGF1RP08069 1367 aa34.85■■■■□ 3.17
TRIOBP-208ENST00000418339 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.81■■■■□ 3.16
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