RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417999.5

CHADL-202, Transcript of chondroadherin like, humanhuman

TSL 5

Gene CHADL, Length 2,248 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHADL-202ENST00000417999 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.02■■■■■ 6.56
CHADL-202ENST00000417999 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa48.88■■■■■ 5.42
CHADL-202ENST00000417999 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47■■■■■ 5.11
CHADL-202ENST00000417999 ABCC9O60706 1549 aa46.6■■■■■ 5.05
CHADL-202ENST00000417999 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.54■■■■■ 5.04
CHADL-202ENST00000417999 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.18■■■■■ 4.98
CHADL-202ENST00000417999 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.77■■■■■ 4.92
CHADL-202ENST00000417999 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.68■■■■■ 4.9
CHADL-202ENST00000417999 NACADO15069 1562 aa45.57■■■■■ 4.89
CHADL-202ENST00000417999 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.27■■■■■ 4.84
CHADL-202ENST00000417999 SCRIBQ14160 1630 aa45.1■■■■■ 4.81
CHADL-202ENST00000417999 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.51■■■■■ 4.72
CHADL-202ENST00000417999 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.99■■■■■ 4.63
CHADL-202ENST00000417999 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.95■■■■■ 4.63
CHADL-202ENST00000417999 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.89■■■■■ 4.62
CHADL-202ENST00000417999 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.65■■■■■ 4.58
CHADL-202ENST00000417999 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.4■■■■■ 4.54
CHADL-202ENST00000417999 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.34■■■■■ 4.53
CHADL-202ENST00000417999 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.24■■■■■ 4.51
CHADL-202ENST00000417999 SMARCA4P51532 1647 aa43.13■■■■■ 4.5
CHADL-202ENST00000417999 WIZO95785 1651 aa43.03■■■■■ 4.48
CHADL-202ENST00000417999 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.67■■■■■ 4.42
CHADL-202ENST00000417999 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.53■■■■■ 4.4
CHADL-202ENST00000417999 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.46■■■■■ 4.39
CHADL-202ENST00000417999 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.44■■■■■ 4.38
CHADL-202ENST00000417999 SMARCA2P51531 1590 aa42.38■■■■■ 4.37
CHADL-202ENST00000417999 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.22■■■■■ 4.35
CHADL-202ENST00000417999 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.13■■■■■ 4.33
CHADL-202ENST00000417999 NCAPD3P42695 1498 aa42.07■■■■■ 4.33
CHADL-202ENST00000417999 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.06■■■■■ 4.32
CHADL-202ENST00000417999 HMGXB3Q12766 1538 aa41.99■■■■■ 4.31
CHADL-202ENST00000417999 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.81■■■■■ 4.28
CHADL-202ENST00000417999 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.34■■■■■ 4.21
CHADL-202ENST00000417999 ABCC8Q09428 1581 aa41.21■■■■■ 4.19
CHADL-202ENST00000417999 TRIM41Q8WV44 630 aa41.19■■■■■ 4.18
CHADL-202ENST00000417999 CFTRP13569 1480 aa41.11■■■■■ 4.17
CHADL-202ENST00000417999 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.02■■■■■ 4.16
CHADL-202ENST00000417999 PRDM2Q13029 1718 aa40.93■■■■■ 4.14
CHADL-202ENST00000417999 NESP48681 1621 aa40.87■■■■■ 4.13
CHADL-202ENST00000417999 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.85■■■■■ 4.13
CHADL-202ENST00000417999 SYNJ1O43426 1573 aa40.76■■■■■ 4.12
CHADL-202ENST00000417999 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.69■■■■■ 4.1
CHADL-202ENST00000417999 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.6■■■■■ 4.09
CHADL-202ENST00000417999 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.57■■■■■ 4.09
CHADL-202ENST00000417999 TOP2BQ02880 1626 aa40.54■■■■■ 4.08
CHADL-202ENST00000417999 CUX1P39880 1505 aa40.52■■■■■ 4.08
CHADL-202ENST00000417999 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.49■■■■■ 4.07
CHADL-202ENST00000417999 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.38■■■■■ 4.05
CHADL-202ENST00000417999 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.37■■■■■ 4.05
CHADL-202ENST00000417999 SOGA1O94964 1423 aa40.36■■■■■ 4.05
CHADL-202ENST00000417999 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.35■■■■■ 4.05
CHADL-202ENST00000417999 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa40.32■■■■■ 4.04
CHADL-202ENST00000417999 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.26■■■■■ 4.04
CHADL-202ENST00000417999 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.17■■■■■ 4.02
CHADL-202ENST00000417999 TOPBP1Q92547 1522 aa40.14■■■■■ 4.02
CHADL-202ENST00000417999 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.13■■■■■ 4.02
CHADL-202ENST00000417999 EHMT2Q96KQ7 1210 aa40.12■■■■■ 4.01
CHADL-202ENST00000417999 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.11■■■■■ 4.01
CHADL-202ENST00000417999 EEA1Q15075 1411 aa40.02■■■■■ 4
CHADL-202ENST00000417999 CSRNP3Q8WYN3 585 aa39.95■■■■□ 3.99
CHADL-202ENST00000417999 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.95■■■■□ 3.99
CHADL-202ENST00000417999 ERCC6Q03468 1493 aa39.93■■■■□ 3.98
CHADL-202ENST00000417999 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.9■■■■□ 3.98
CHADL-202ENST00000417999 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.87■■■■□ 3.97
CHADL-202ENST00000417999 CUX2O14529 1486 aa39.82■■■■□ 3.96
CHADL-202ENST00000417999 KIF27Q86VH2 1401 aa39.8■■■■□ 3.96
CHADL-202ENST00000417999 WDR62O43379 1518 aa39.7■■■■□ 3.95
CHADL-202ENST00000417999 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.68■■■■□ 3.94
CHADL-202ENST00000417999 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.68■■■■□ 3.94
CHADL-202ENST00000417999 WDR97A6NE52 1622 aa39.63■■■■□ 3.93
CHADL-202ENST00000417999 KIF21BO75037 1637 aa39.61■■■■□ 3.93
CHADL-202ENST00000417999 GOLGA3Q08378 1498 aa39.56■■■■□ 3.92
CHADL-202ENST00000417999 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.56■■■■□ 3.92
CHADL-202ENST00000417999 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.53■■■■□ 3.92
CHADL-202ENST00000417999 IGF1RP08069 1367 aa39.51■■■■□ 3.91
CHADL-202ENST00000417999 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.5■■■■□ 3.91
CHADL-202ENST00000417999 UBTFP17480 764 aaKnown RBP39.5■■■■□ 3.91
CHADL-202ENST00000417999 PRXQ9BXM0 1461 aa39.49■■■■□ 3.91
CHADL-202ENST00000417999 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.42■■■■□ 3.9
CHADL-202ENST00000417999 TNIKQ9UKE5 1360 aa39.37■■■■□ 3.89
CHADL-202ENST00000417999 IFT140Q96RY7 1462 aa39.35■■■■□ 3.89
CHADL-202ENST00000417999 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.35■■■■□ 3.89
CHADL-202ENST00000417999 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.35■■■■□ 3.89
CHADL-202ENST00000417999 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.3■■■■□ 3.88
CHADL-202ENST00000417999 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.29■■■■□ 3.88
CHADL-202ENST00000417999 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.29■■■■□ 3.88
CHADL-202ENST00000417999 CEP162Q5TB80 1403 aa39.23■■■■□ 3.87
CHADL-202ENST00000417999 PBRM1Q86U86 1689 aa39.2■■■■□ 3.87
CHADL-202ENST00000417999 CUL7Q14999 1698 aa39.18■■■■□ 3.86
CHADL-202ENST00000417999 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.11■■■■□ 3.85
CHADL-202ENST00000417999 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP39.09■■■■□ 3.85
CHADL-202ENST00000417999 GRIN2BQ13224 1484 aa39.04■■■■□ 3.84
CHADL-202ENST00000417999 CLIP1P30622 1438 aa38.96■■■■□ 3.83
CHADL-202ENST00000417999 ADAMTS12P58397 1594 aa38.92■■■■□ 3.82
CHADL-202ENST00000417999 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.88■■■■□ 3.81
CHADL-202ENST00000417999 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.87■■■■□ 3.81
CHADL-202ENST00000417999 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa38.79■■■■□ 3.8
CHADL-202ENST00000417999 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.71■■■■□ 3.79
CHADL-202ENST00000417999 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa38.65■■■■□ 3.78
CHADL-202ENST00000417999 ARAP1Q96P48 1450 aa38.62■■■■□ 3.77
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