RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417867.1

TUSC2-202, Transcript of tumor suppressor 2, mitochondrial calcium regulator, humanhuman

TSL 5

Gene TUSC2, Length 561 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUSC2-202ENST00000417867 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.63■■■■■ 5.37
TUSC2-202ENST00000417867 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.5■■■■■ 4.55
TUSC2-202ENST00000417867 ABCC9O60706 1549 aa43.02■■■■■ 4.48
TUSC2-202ENST00000417867 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.14■■■■■ 4.18
TUSC2-202ENST00000417867 NACADO15069 1562 aa40.95■■■■■ 4.15
TUSC2-202ENST00000417867 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.82■■■■■ 4.13
TUSC2-202ENST00000417867 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.5■■■■■ 4.07
TUSC2-202ENST00000417867 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.43■■■■■ 4.06
TUSC2-202ENST00000417867 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.39■■■■■ 4.06
TUSC2-202ENST00000417867 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.16■■■■■ 4.02
TUSC2-202ENST00000417867 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.1■■■■■ 4.01
TUSC2-202ENST00000417867 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.99■■■■□ 3.99
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TUSC2-202ENST00000417867 SCRIBQ14160 1630 aa39.66■■■■□ 3.94
TUSC2-202ENST00000417867 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.36■■■■□ 3.89
TUSC2-202ENST00000417867 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.93■■■■□ 3.82
TUSC2-202ENST00000417867 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.93■■■■□ 3.82
TUSC2-202ENST00000417867 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.67■■■■□ 3.78
TUSC2-202ENST00000417867 SMARCA4P51532 1647 aa37.88■■■■□ 3.65
TUSC2-202ENST00000417867 NCAPD3P42695 1498 aa37.77■■■■□ 3.64
TUSC2-202ENST00000417867 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.75■■■■□ 3.63
TUSC2-202ENST00000417867 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.71■■■■□ 3.63
TUSC2-202ENST00000417867 SMARCA2P51531 1590 aa37.66■■■■□ 3.62
TUSC2-202ENST00000417867 HMGXB3Q12766 1538 aa37.56■■■■□ 3.6
TUSC2-202ENST00000417867 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.51■■■■□ 3.59
TUSC2-202ENST00000417867 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.48■■■■□ 3.59
TUSC2-202ENST00000417867 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.39■■■■□ 3.58
TUSC2-202ENST00000417867 WIZO95785 1651 aa37.15■■■■□ 3.54
TUSC2-202ENST00000417867 NESP48681 1621 aa37.12■■■■□ 3.53
TUSC2-202ENST00000417867 ERCC6Q03468 1493 aa37.06■■■■□ 3.52
TUSC2-202ENST00000417867 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.9■■■■□ 3.5
TUSC2-202ENST00000417867 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.85■■■■□ 3.49
TUSC2-202ENST00000417867 CUX2O14529 1486 aa36.84■■■■□ 3.49
TUSC2-202ENST00000417867 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.74■■■■□ 3.47
TUSC2-202ENST00000417867 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.67■■■■□ 3.46
TUSC2-202ENST00000417867 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.64■■■■□ 3.46
TUSC2-202ENST00000417867 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.62■■■■□ 3.45
TUSC2-202ENST00000417867 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.59■■■■□ 3.45
TUSC2-202ENST00000417867 CFTRP13569 1480 aa36.34■■■■□ 3.41
TUSC2-202ENST00000417867 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.31■■■■□ 3.4
TUSC2-202ENST00000417867 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.29■■■■□ 3.4
TUSC2-202ENST00000417867 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.25■■■■□ 3.39
TUSC2-202ENST00000417867 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.24■■■■□ 3.39
TUSC2-202ENST00000417867 WDR62O43379 1518 aa36.22■■■■□ 3.39
TUSC2-202ENST00000417867 PRDM2Q13029 1718 aa36.2■■■■□ 3.39
TUSC2-202ENST00000417867 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.2■■■■□ 3.39
TUSC2-202ENST00000417867 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.96■■■■□ 3.35
TUSC2-202ENST00000417867 TOPBP1Q92547 1522 aa35.64■■■■□ 3.3
TUSC2-202ENST00000417867 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.55■■■■□ 3.28
TUSC2-202ENST00000417867 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.55■■■■□ 3.28
TUSC2-202ENST00000417867 ABCC8Q09428 1581 aa35.54■■■■□ 3.28
TUSC2-202ENST00000417867 IFT140Q96RY7 1462 aa35.48■■■■□ 3.27
TUSC2-202ENST00000417867 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.44■■■■□ 3.26
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TUSC2-202ENST00000417867 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.29■■■■□ 3.24
TUSC2-202ENST00000417867 OSCARQ8IYS5 282 aa35.21■■■■□ 3.23
TUSC2-202ENST00000417867 CUX1P39880 1505 aa35.21■■■■□ 3.23
TUSC2-202ENST00000417867 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.17■■■■□ 3.22
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TUSC2-202ENST00000417867 SOGA1O94964 1423 aa35.12■■■■□ 3.21
TUSC2-202ENST00000417867 CHD1O14646 1710 aa35.03■■■■□ 3.2
TUSC2-202ENST00000417867 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35■■■■□ 3.19
TUSC2-202ENST00000417867 WDR97A6NE52 1622 aa34.97■■■■□ 3.19
TUSC2-202ENST00000417867 TRIM41Q8WV44 630 aa34.92■■■■□ 3.18
TUSC2-202ENST00000417867 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.83■■■■□ 3.17
TUSC2-202ENST00000417867 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.83■■■■□ 3.17
TUSC2-202ENST00000417867 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.83■■■■□ 3.17
TUSC2-202ENST00000417867 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.81■■■■□ 3.16
TUSC2-202ENST00000417867 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.81■■■■□ 3.16
TUSC2-202ENST00000417867 PBRM1Q86U86 1689 aa34.8■■■■□ 3.16
TUSC2-202ENST00000417867 FBLN2P98095 1184 aa34.8■■■■□ 3.16
TUSC2-202ENST00000417867 TOP2BQ02880 1626 aa34.77■■■■□ 3.16
TUSC2-202ENST00000417867 SYNJ1O43426 1573 aa34.76■■■■□ 3.16
TUSC2-202ENST00000417867 GRIN2BQ13224 1484 aa34.76■■■■□ 3.15
TUSC2-202ENST00000417867 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.75■■■■□ 3.15
TUSC2-202ENST00000417867 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.73■■■■□ 3.15
TUSC2-202ENST00000417867 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.73■■■■□ 3.15
TUSC2-202ENST00000417867 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.71■■■■□ 3.15
TUSC2-202ENST00000417867 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.71■■■■□ 3.15
TUSC2-202ENST00000417867 ARHGEF11O15085 1522 aa34.71■■■■□ 3.15
TUSC2-202ENST00000417867 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.6■■■■□ 3.13
TUSC2-202ENST00000417867 SYNJ2O15056 1496 aa34.59■■■■□ 3.13
TUSC2-202ENST00000417867 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.54■■■■□ 3.12
TUSC2-202ENST00000417867 ADAMTS12P58397 1594 aa34.4■■■■□ 3.1
TUSC2-202ENST00000417867 ARAP1Q96P48 1450 aa34.4■■■■□ 3.1
TUSC2-202ENST00000417867 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.39■■■■□ 3.1
TUSC2-202ENST00000417867 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.33■■■■□ 3.09
TUSC2-202ENST00000417867 GRIN2AQ12879 1464 aa34.33■■■■□ 3.09
TUSC2-202ENST00000417867 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.26■■■■□ 3.07
TUSC2-202ENST00000417867 CEP170Q5SW79 1584 aa34.24■■■■□ 3.07
TUSC2-202ENST00000417867 NUP160Q12769 1436 aa34.18■■■■□ 3.06
TUSC2-202ENST00000417867 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.08■■■■□ 3.05
TUSC2-202ENST00000417867 SHROOM2Q13796 1616 aa34.06■■■■□ 3.04
TUSC2-202ENST00000417867 KIF27Q86VH2 1401 aa34.02■■■■□ 3.04
TUSC2-202ENST00000417867 IGF1RP08069 1367 aa33.98■■■■□ 3.03
TUSC2-202ENST00000417867 CUL7Q14999 1698 aa33.96■■■■□ 3.03
TUSC2-202ENST00000417867 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.92■■■■□ 3.02
TUSC2-202ENST00000417867 TRHP20396 242 aaPredicted RBP33.85■■■■□ 3.01
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