RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417767.1

PARVG-204, Transcript of parvin gamma, humanhuman

TSL 2

Gene PARVG, Length 622 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVG-204ENST00000417767 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.86■■■■■ 6.53
PARVG-204ENST00000417767 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.96■■■■■ 5.59
PARVG-204ENST00000417767 ABCC9O60706 1549 aa49.92■■■■■ 5.58
PARVG-204ENST00000417767 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.55■■■■■ 5.2
PARVG-204ENST00000417767 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.33■■■■■ 5.17
PARVG-204ENST00000417767 NACADO15069 1562 aa47.25■■■■■ 5.15
PARVG-204ENST00000417767 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.62■■■■■ 5.05
PARVG-204ENST00000417767 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.61■■■■■ 5.05
PARVG-204ENST00000417767 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.58■■■■■ 5.05
PARVG-204ENST00000417767 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.34■■■■■ 5.01
PARVG-204ENST00000417767 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.31■■■■■ 5
PARVG-204ENST00000417767 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.1■■■■■ 4.97
PARVG-204ENST00000417767 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.07■■■■■ 4.97
PARVG-204ENST00000417767 SCRIBQ14160 1630 aa45.65■■■■■ 4.9
PARVG-204ENST00000417767 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.5■■■■■ 4.87
PARVG-204ENST00000417767 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.04■■■■■ 4.8
PARVG-204ENST00000417767 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.99■■■■■ 4.79
PARVG-204ENST00000417767 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.94■■■■■ 4.78
PARVG-204ENST00000417767 NCAPD3P42695 1498 aa43.63■■■■■ 4.57
PARVG-204ENST00000417767 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.54■■■■■ 4.56
PARVG-204ENST00000417767 SMARCA4P51532 1647 aa43.51■■■■■ 4.56
PARVG-204ENST00000417767 SMARCA2P51531 1590 aa43.43■■■■■ 4.54
PARVG-204ENST00000417767 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.36■■■■■ 4.53
PARVG-204ENST00000417767 HMGXB3Q12766 1538 aa43.29■■■■■ 4.52
PARVG-204ENST00000417767 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.18■■■■■ 4.5
PARVG-204ENST00000417767 ERCC6Q03468 1493 aa43.14■■■■■ 4.5
PARVG-204ENST00000417767 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.05■■■■■ 4.48
PARVG-204ENST00000417767 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.03■■■■■ 4.48
PARVG-204ENST00000417767 NESP48681 1621 aa42.9■■■■■ 4.46
PARVG-204ENST00000417767 CUX2O14529 1486 aa42.89■■■■■ 4.46
PARVG-204ENST00000417767 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.69■■■■■ 4.42
PARVG-204ENST00000417767 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.61■■■■■ 4.41
PARVG-204ENST00000417767 WIZO95785 1651 aa42.53■■■■■ 4.4
PARVG-204ENST00000417767 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.44■■■■■ 4.38
PARVG-204ENST00000417767 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.37■■■■■ 4.37
PARVG-204ENST00000417767 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.35■■■■■ 4.37
PARVG-204ENST00000417767 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.29■■■■■ 4.36
PARVG-204ENST00000417767 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.26■■■■■ 4.36
PARVG-204ENST00000417767 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.02■■■■■ 4.32
PARVG-204ENST00000417767 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.02■■■■■ 4.32
PARVG-204ENST00000417767 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.92■■■■■ 4.3
PARVG-204ENST00000417767 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.88■■■■■ 4.29
PARVG-204ENST00000417767 CFTRP13569 1480 aa41.87■■■■■ 4.29
PARVG-204ENST00000417767 WDR62O43379 1518 aa41.85■■■■■ 4.29
PARVG-204ENST00000417767 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.58■■■■■ 4.25
PARVG-204ENST00000417767 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.49■■■■■ 4.23
PARVG-204ENST00000417767 PRDM2Q13029 1718 aa41.37■■■■■ 4.21
PARVG-204ENST00000417767 TOPBP1Q92547 1522 aa41.08■■■■■ 4.17
PARVG-204ENST00000417767 OSCARQ8IYS5 282 aa41.08■■■■■ 4.17
PARVG-204ENST00000417767 IFT140Q96RY7 1462 aa41.06■■■■■ 4.16
PARVG-204ENST00000417767 ABCC8Q09428 1581 aa41.03■■■■■ 4.16
PARVG-204ENST00000417767 TRIM41Q8WV44 630 aa41.03■■■■■ 4.16
PARVG-204ENST00000417767 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.96■■■■■ 4.15
PARVG-204ENST00000417767 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.94■■■■■ 4.14
PARVG-204ENST00000417767 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.72■■■■■ 4.11
PARVG-204ENST00000417767 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.7■■■■■ 4.11
PARVG-204ENST00000417767 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.68■■■■■ 4.1
PARVG-204ENST00000417767 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.65■■■■■ 4.1
PARVG-204ENST00000417767 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.64■■■■■ 4.1
PARVG-204ENST00000417767 SOGA1O94964 1423 aa40.57■■■■■ 4.08
PARVG-204ENST00000417767 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.56■■■■■ 4.08
PARVG-204ENST00000417767 FBLN2P98095 1184 aa40.49■■■■■ 4.07
PARVG-204ENST00000417767 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.47■■■■■ 4.07
PARVG-204ENST00000417767 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.47■■■■■ 4.07
PARVG-204ENST00000417767 CUX1P39880 1505 aa40.43■■■■■ 4.06
PARVG-204ENST00000417767 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.4■■■■■ 4.06
PARVG-204ENST00000417767 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.4■■■■■ 4.06
PARVG-204ENST00000417767 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.4■■■■■ 4.06
PARVG-204ENST00000417767 CHD1O14646 1710 aa40.34■■■■■ 4.05
PARVG-204ENST00000417767 ARHGEF11O15085 1522 aa40.31■■■■■ 4.04
PARVG-204ENST00000417767 WDR97A6NE52 1622 aa40.24■■■■■ 4.03
PARVG-204ENST00000417767 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.24■■■■■ 4.03
PARVG-204ENST00000417767 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.18■■■■■ 4.02
PARVG-204ENST00000417767 GRIN2BQ13224 1484 aa40.16■■■■■ 4.02
PARVG-204ENST00000417767 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.13■■■■■ 4.01
PARVG-204ENST00000417767 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.11■■■■■ 4.01
PARVG-204ENST00000417767 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.05■■■■■ 4
PARVG-204ENST00000417767 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40■■■■□ 3.99
PARVG-204ENST00000417767 SYNJ2O15056 1496 aa39.99■■■■□ 3.99
PARVG-204ENST00000417767 SYNJ1O43426 1573 aa39.95■■■■□ 3.99
PARVG-204ENST00000417767 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.95■■■■□ 3.99
PARVG-204ENST00000417767 ARAP1Q96P48 1450 aa39.93■■■■□ 3.98
PARVG-204ENST00000417767 PBRM1Q86U86 1689 aa39.92■■■■□ 3.98
PARVG-204ENST00000417767 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.89■■■■□ 3.98
PARVG-204ENST00000417767 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.87■■■■□ 3.97
PARVG-204ENST00000417767 TOP2BQ02880 1626 aa39.83■■■■□ 3.97
PARVG-204ENST00000417767 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.8■■■■□ 3.96
PARVG-204ENST00000417767 TRHP20396 242 aaPredicted RBP39.69■■■■□ 3.94
PARVG-204ENST00000417767 GRIN2AQ12879 1464 aa39.62■■■■□ 3.93
PARVG-204ENST00000417767 ADAMTS12P58397 1594 aa39.59■■■■□ 3.93
PARVG-204ENST00000417767 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.55■■■■□ 3.92
PARVG-204ENST00000417767 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.5■■■■□ 3.91
PARVG-204ENST00000417767 NUP160Q12769 1436 aa39.45■■■■□ 3.91
PARVG-204ENST00000417767 CEP170Q5SW79 1584 aa39.43■■■■□ 3.9
PARVG-204ENST00000417767 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.31■■■■□ 3.88
PARVG-204ENST00000417767 SHROOM2Q13796 1616 aa39.19■■■■□ 3.86
PARVG-204ENST00000417767 JPH4Q96JJ6 628 aa39.16■■■■□ 3.86
PARVG-204ENST00000417767 KIF27Q86VH2 1401 aa39.15■■■■□ 3.86
PARVG-204ENST00000417767 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP39.14■■■■□ 3.86
PARVG-204ENST00000417767 IGF1RP08069 1367 aa39.09■■■■□ 3.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.7 ms