RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417193.5

LINC00671-202, long intergenic non-protein coding RNA 671, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LINC00671, Length 560 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00671-202ENST00000417193 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.02■■■■□ 3.68
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LINC00671-202ENST00000417193 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.45■■■□□ 2.63
LINC00671-202ENST00000417193 NACADO15069 1562 aa31.36■■■□□ 2.61
LINC00671-202ENST00000417193 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.22■■■□□ 2.59
LINC00671-202ENST00000417193 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.15■■■□□ 2.58
LINC00671-202ENST00000417193 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.65■■■□□ 2.5
LINC00671-202ENST00000417193 SCRIBQ14160 1630 aa30.62■■■□□ 2.49
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LINC00671-202ENST00000417193 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.25■■■□□ 2.43
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LINC00671-202ENST00000417193 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
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LINC00671-202ENST00000417193 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.16■■■□□ 2.26
LINC00671-202ENST00000417193 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.12■■■□□ 2.25
LINC00671-202ENST00000417193 WIZO95785 1651 aa29.04■■■□□ 2.24
LINC00671-202ENST00000417193 SMARCA2P51531 1590 aa29.03■■■□□ 2.24
LINC00671-202ENST00000417193 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.02■■■□□ 2.24
LINC00671-202ENST00000417193 NCAPD3P42695 1498 aa28.91■■■□□ 2.22
LINC00671-202ENST00000417193 HMGXB3Q12766 1538 aa28.89■■■□□ 2.22
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LINC00671-202ENST00000417193 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
LINC00671-202ENST00000417193 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.18
LINC00671-202ENST00000417193 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.38■■■□□ 2.13
LINC00671-202ENST00000417193 CFTRP13569 1480 aa28.08■■■□□ 2.09
LINC00671-202ENST00000417193 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.07■■■□□ 2.08
LINC00671-202ENST00000417193 PRDM2Q13029 1718 aa28.06■■■□□ 2.08
LINC00671-202ENST00000417193 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.04■■■□□ 2.08
LINC00671-202ENST00000417193 NESP48681 1621 aa28■■■□□ 2.07
LINC00671-202ENST00000417193 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.77■■■□□ 2.04
LINC00671-202ENST00000417193 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.75■■■□□ 2.03
LINC00671-202ENST00000417193 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.75■■■□□ 2.03
LINC00671-202ENST00000417193 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.65■■■□□ 2.02
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LINC00671-202ENST00000417193 ABCC8Q09428 1581 aa27.56■■■□□ 2
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LINC00671-202ENST00000417193 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.46■■□□□ 1.99
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LINC00671-202ENST00000417193 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.45■■□□□ 1.99
LINC00671-202ENST00000417193 SYNJ1O43426 1573 aa27.45■■□□□ 1.99
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LINC00671-202ENST00000417193 TRIM41Q8WV44 630 aa27.09■■□□□ 1.93
LINC00671-202ENST00000417193 IFT140Q96RY7 1462 aa27.05■■□□□ 1.92
LINC00671-202ENST00000417193 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.05■■□□□ 1.92
LINC00671-202ENST00000417193 SOGA1O94964 1423 aa27.03■■□□□ 1.92
LINC00671-202ENST00000417193 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.03■■□□□ 1.92
LINC00671-202ENST00000417193 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.93■■□□□ 1.9
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LINC00671-202ENST00000417193 KIF27Q86VH2 1401 aa26.81■■□□□ 1.88
LINC00671-202ENST00000417193 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.8■■□□□ 1.88
LINC00671-202ENST00000417193 PBRM1Q86U86 1689 aa26.79■■□□□ 1.88
LINC00671-202ENST00000417193 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
LINC00671-202ENST00000417193 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.76■■□□□ 1.87
LINC00671-202ENST00000417193 EEA1Q15075 1411 aa26.76■■□□□ 1.87
LINC00671-202ENST00000417193 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.75■■□□□ 1.876e-8■■■■■ 27.2
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LINC00671-202ENST00000417193 GRIN2BQ13224 1484 aa26.68■■□□□ 1.86
LINC00671-202ENST00000417193 CUL7Q14999 1698 aa26.63■■□□□ 1.85
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LINC00671-202ENST00000417193 ADAMTS12P58397 1594 aa26.61■■□□□ 1.85
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LINC00671-202ENST00000417193 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.57■■□□□ 1.84
LINC00671-202ENST00000417193 PRXQ9BXM0 1461 aa26.55■■□□□ 1.84
LINC00671-202ENST00000417193 KIF21BO75037 1637 aa26.52■■□□□ 1.84
LINC00671-202ENST00000417193 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.52■■□□□ 1.84
LINC00671-202ENST00000417193 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.48■■□□□ 1.83
LINC00671-202ENST00000417193 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
LINC00671-202ENST00000417193 SYNJ2O15056 1496 aa26.46■■□□□ 1.83
LINC00671-202ENST00000417193 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.46■■□□□ 1.83
LINC00671-202ENST00000417193 CHD1O14646 1710 aa26.42■■□□□ 1.82
LINC00671-202ENST00000417193 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.42■■□□□ 1.82
LINC00671-202ENST00000417193 GRIN2AQ12879 1464 aa26.37■■□□□ 1.81
LINC00671-202ENST00000417193 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.37■■□□□ 1.81
LINC00671-202ENST00000417193 GOLGA3Q08378 1498 aa26.33■■□□□ 1.81
LINC00671-202ENST00000417193 CEP170Q5SW79 1584 aa26.27■■□□□ 1.8
LINC00671-202ENST00000417193 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.25■■□□□ 1.79
LINC00671-202ENST00000417193 NUP160Q12769 1436 aa26.25■■□□□ 1.79
LINC00671-202ENST00000417193 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
LINC00671-202ENST00000417193 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.16■■□□□ 1.78
LINC00671-202ENST00000417193 FBLN2P98095 1184 aa26.14■■□□□ 1.78
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