RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416785.1

RPSAP2-201, Transcript of ribosomal protein SA pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene RPSAP2, Length 888 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP2-201ENST00000416785 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
RPSAP2-201ENST00000416785 NISCHQ9Y2I1 1504 aa21.83■■□□□ 1.09
RPSAP2-201ENST00000416785 CHIC1Q5VXU3 224 aa20.78■□□□□ 0.92
RPSAP2-201ENST00000416785 ABCC9O60706 1549 aa19.97■□□□□ 0.79
RPSAP2-201ENST00000416785 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa19.74■□□□□ 0.75
RPSAP2-201ENST00000416785 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa18.89■□□□□ 0.61
RPSAP2-201ENST00000416785 DNAJC5BQ9UF47 199 aa18.85■□□□□ 0.61
RPSAP2-201ENST00000416785 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
RPSAP2-201ENST00000416785 NACADO15069 1562 aa18.67■□□□□ 0.58
RPSAP2-201ENST00000416785 DCAF8L2P0C7V8 631 aa18.62■□□□□ 0.57
RPSAP2-201ENST00000416785 UNC13AQ9UPW8 1703 aa18.55■□□□□ 0.56
RPSAP2-201ENST00000416785 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP18.53■□□□□ 0.56
RPSAP2-201ENST00000416785 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
RPSAP2-201ENST00000416785 BICRAQ9NZM4 1560 aa18.32■□□□□ 0.52
RPSAP2-201ENST00000416785 MYO15BQ96JP2 1530 aa18.26■□□□□ 0.51
RPSAP2-201ENST00000416785 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
RPSAP2-201ENST00000416785 SCRIBQ14160 1630 aa18.02■□□□□ 0.48
RPSAP2-201ENST00000416785 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa18.02■□□□□ 0.48
RPSAP2-201ENST00000416785 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa17.99■□□□□ 0.47
RPSAP2-201ENST00000416785 CECR2Q9BXF3 1484 aa17.97■□□□□ 0.47
RPSAP2-201ENST00000416785 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa17.97■□□□□ 0.47
RPSAP2-201ENST00000416785 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
RPSAP2-201ENST00000416785 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa17.46■□□□□ 0.39
RPSAP2-201ENST00000416785 FOXD1Q16676 465 aa17.43■□□□□ 0.38
RPSAP2-201ENST00000416785 ERCC6Q03468 1493 aa17.25■□□□□ 0.35
RPSAP2-201ENST00000416785 CUX2O14529 1486 aa17.24■□□□□ 0.35
RPSAP2-201ENST00000416785 NCAPD3P42695 1498 aa17.19■□□□□ 0.34
RPSAP2-201ENST00000416785 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa17.14■□□□□ 0.33
RPSAP2-201ENST00000416785 SMARCA4P51532 1647 aa17.12■□□□□ 0.33
RPSAP2-201ENST00000416785 SMARCA2P51531 1590 aa17.11■□□□□ 0.33
RPSAP2-201ENST00000416785 NESP48681 1621 aa17.08■□□□□ 0.32
RPSAP2-201ENST00000416785 HMGXB3Q12766 1538 aa17.08■□□□□ 0.32
RPSAP2-201ENST00000416785 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
RPSAP2-201ENST00000416785 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
RPSAP2-201ENST00000416785 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
RPSAP2-201ENST00000416785 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa16.91■□□□□ 0.3
RPSAP2-201ENST00000416785 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa16.9■□□□□ 0.3
RPSAP2-201ENST00000416785 PEG3Q9GZU2 1588 aa16.89■□□□□ 0.29
RPSAP2-201ENST00000416785 MROH2BQ7Z745 1585 aa16.85■□□□□ 0.29
RPSAP2-201ENST00000416785 PDS5BQ9NTI5 1447 aa16.79■□□□□ 0.28
RPSAP2-201ENST00000416785 TRIM41Q8WV44 630 aa16.71■□□□□ 0.27
RPSAP2-201ENST00000416785 WIZO95785 1651 aa16.69■□□□□ 0.26
RPSAP2-201ENST00000416785 CADPSQ9ULU8 1353 aa16.68■□□□□ 0.26
RPSAP2-201ENST00000416785 MRC2Q9UBG0 1479 aa16.67■□□□□ 0.26
RPSAP2-201ENST00000416785 WDR62O43379 1518 aa16.63■□□□□ 0.25
RPSAP2-201ENST00000416785 PLPPR3Q6T4P5 718 aa16.6■□□□□ 0.25
RPSAP2-201ENST00000416785 CEP164Q9UPV0 1460 aa16.58■□□□□ 0.24
RPSAP2-201ENST00000416785 FANCD2Q9BXW9 1451 aa16.53■□□□□ 0.24
RPSAP2-201ENST00000416785 CFTRP13569 1480 aa16.43■□□□□ 0.22
RPSAP2-201ENST00000416785 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
RPSAP2-201ENST00000416785 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
RPSAP2-201ENST00000416785 OSCARQ8IYS5 282 aa16.41■□□□□ 0.22
RPSAP2-201ENST00000416785 PRDM2Q13029 1718 aa16.4■□□□□ 0.22
RPSAP2-201ENST00000416785 MSH5O43196 834 aa16.39■□□□□ 0.21
RPSAP2-201ENST00000416785 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
RPSAP2-201ENST00000416785 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa16.3■□□□□ 0.2
RPSAP2-201ENST00000416785 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa16.3■□□□□ 0.2
RPSAP2-201ENST00000416785 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa16.3■□□□□ 0.2
RPSAP2-201ENST00000416785 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
RPSAP2-201ENST00000416785 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
RPSAP2-201ENST00000416785 PPP6R1Q9UPN7 881 aa16.23■□□□□ 0.19
RPSAP2-201ENST00000416785 IFT140Q96RY7 1462 aa16.22■□□□□ 0.19
RPSAP2-201ENST00000416785 CCDC88BA6NC98 1476 aa16.22■□□□□ 0.19
RPSAP2-201ENST00000416785 TOPBP1Q92547 1522 aa16.2■□□□□ 0.18
RPSAP2-201ENST00000416785 ARHGEF11O15085 1522 aa16.19■□□□□ 0.18
RPSAP2-201ENST00000416785 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
RPSAP2-201ENST00000416785 ADRA2BP18089 450 aa16.17■□□□□ 0.18
RPSAP2-201ENST00000416785 CHD1O14646 1710 aa16.16■□□□□ 0.18
RPSAP2-201ENST00000416785 DNMBPQ6XZF7 1577 aa16.13■□□□□ 0.17
RPSAP2-201ENST00000416785 ABCC8Q09428 1581 aa16.12■□□□□ 0.17
RPSAP2-201ENST00000416785 CYB5RLQ6IPT4 315 aa16.08■□□□□ 0.16
RPSAP2-201ENST00000416785 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
RPSAP2-201ENST00000416785 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP16.07■□□□□ 0.16
RPSAP2-201ENST00000416785 FBLN2P98095 1184 aa16.06■□□□□ 0.16
RPSAP2-201ENST00000416785 POTEDQ86YR6 584 aa16.03■□□□□ 0.16
RPSAP2-201ENST00000416785 TRHP20396 242 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
RPSAP2-201ENST00000416785 ARAP1Q96P48 1450 aa16.01■□□□□ 0.15
RPSAP2-201ENST00000416785 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
RPSAP2-201ENST00000416785 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa15.98■□□□□ 0.15
RPSAP2-201ENST00000416785 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
RPSAP2-201ENST00000416785 SOGA1O94964 1423 aa15.94■□□□□ 0.14
RPSAP2-201ENST00000416785 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa15.92■□□□□ 0.14
RPSAP2-201ENST00000416785 FGD5Q6ZNL6 1462 aa15.9■□□□□ 0.14
RPSAP2-201ENST00000416785 CLASP1Q7Z460 1538 aa15.88■□□□□ 0.13
RPSAP2-201ENST00000416785 SYNJ1O43426 1573 aa15.87■□□□□ 0.13
RPSAP2-201ENST00000416785 WDR97A6NE52 1622 aa15.86■□□□□ 0.13
RPSAP2-201ENST00000416785 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
RPSAP2-201ENST00000416785 CUX1P39880 1505 aa15.84■□□□□ 0.13
RPSAP2-201ENST00000416785 PBRM1Q86U86 1689 aa15.84■□□□□ 0.13
RPSAP2-201ENST00000416785 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
RPSAP2-201ENST00000416785 GRIN2BQ13224 1484 aa15.82■□□□□ 0.12
RPSAP2-201ENST00000416785 SYNJ2O15056 1496 aa15.78■□□□□ 0.12
RPSAP2-201ENST00000416785 GAPVD1Q14C86 1478 aa15.74■□□□□ 0.11
RPSAP2-201ENST00000416785 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa15.71■□□□□ 0.11
RPSAP2-201ENST00000416785 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa15.67■□□□□ 0.1
RPSAP2-201ENST00000416785 ERCC6L2Q5T890 1561 aa15.65■□□□□ 0.1
RPSAP2-201ENST00000416785 ADAMTS12P58397 1594 aa15.62■□□□□ 0.09
RPSAP2-201ENST00000416785 GRIN2AQ12879 1464 aa15.61■□□□□ 0.09
RPSAP2-201ENST00000416785 CEP170Q5SW79 1584 aa15.6■□□□□ 0.09
RPSAP2-201ENST00000416785 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.5 ms