RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416650.5

APTR-202, Transcript of Alu-mediated CDKN1A/p21 transcriptional regulator, humanhuman

TSL 3

Gene APTR, Length 609 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTR-202ENST00000416650 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.33■■■■■ 6.29
APTR-202ENST00000416650 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa48.86■■■■■ 5.41
APTR-202ENST00000416650 ABCC9O60706 1549 aa48.44■■■■■ 5.35
APTR-202ENST00000416650 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.3■■■■■ 5
APTR-202ENST00000416650 NACADO15069 1562 aa46.01■■■■■ 4.96
APTR-202ENST00000416650 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.53■■■■■ 4.88
APTR-202ENST00000416650 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.45■■■■■ 4.87
APTR-202ENST00000416650 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.45■■■■■ 4.87
APTR-202ENST00000416650 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.14■■■■■ 4.82
APTR-202ENST00000416650 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.1■■■■■ 4.81
APTR-202ENST00000416650 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45■■■■■ 4.79
APTR-202ENST00000416650 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.95■■■■■ 4.79
APTR-202ENST00000416650 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.94■■■■■ 4.78
APTR-202ENST00000416650 SCRIBQ14160 1630 aa44.42■■■■■ 4.7
APTR-202ENST00000416650 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.39■■■■■ 4.7
APTR-202ENST00000416650 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.88■■■■■ 4.61
APTR-202ENST00000416650 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.82■■■■■ 4.61
APTR-202ENST00000416650 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.63■■■■■ 4.57
APTR-202ENST00000416650 SMARCA4P51532 1647 aa42.42■■■■■ 4.38
APTR-202ENST00000416650 NCAPD3P42695 1498 aa42.39■■■■■ 4.38
APTR-202ENST00000416650 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.3■■■■■ 4.36
APTR-202ENST00000416650 SMARCA2P51531 1590 aa42.27■■■■■ 4.36
APTR-202ENST00000416650 HMGXB3Q12766 1538 aa42.21■■■■■ 4.35
APTR-202ENST00000416650 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.2■■■■■ 4.35
APTR-202ENST00000416650 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.01■■■■■ 4.32
APTR-202ENST00000416650 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.93■■■■■ 4.3
APTR-202ENST00000416650 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.86■■■■■ 4.29
APTR-202ENST00000416650 ERCC6Q03468 1493 aa41.83■■■■■ 4.29
APTR-202ENST00000416650 CUX2O14529 1486 aa41.73■■■■■ 4.27
APTR-202ENST00000416650 NESP48681 1621 aa41.69■■■■■ 4.26
APTR-202ENST00000416650 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.52■■■■■ 4.24
APTR-202ENST00000416650 WIZO95785 1651 aa41.44■■■■■ 4.22
APTR-202ENST00000416650 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.37■■■■■ 4.21
APTR-202ENST00000416650 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.34■■■■■ 4.21
APTR-202ENST00000416650 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.32■■■■■ 4.21
APTR-202ENST00000416650 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.15■■■■■ 4.18
APTR-202ENST00000416650 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.07■■■■■ 4.16
APTR-202ENST00000416650 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41■■■■■ 4.15
APTR-202ENST00000416650 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.92■■■■■ 4.14
APTR-202ENST00000416650 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.84■■■■■ 4.13
APTR-202ENST00000416650 WDR62O43379 1518 aa40.79■■■■■ 4.12
APTR-202ENST00000416650 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.73■■■■■ 4.11
APTR-202ENST00000416650 CFTRP13569 1480 aa40.7■■■■■ 4.11
APTR-202ENST00000416650 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.67■■■■■ 4.1
APTR-202ENST00000416650 PRDM2Q13029 1718 aa40.62■■■■■ 4.09
APTR-202ENST00000416650 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.35■■■■■ 4.05
APTR-202ENST00000416650 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.34■■■■■ 4.05
APTR-202ENST00000416650 TOPBP1Q92547 1522 aa39.95■■■■□ 3.99
APTR-202ENST00000416650 IFT140Q96RY7 1462 aa39.88■■■■□ 3.98
APTR-202ENST00000416650 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.88■■■■□ 3.97
APTR-202ENST00000416650 ABCC8Q09428 1581 aa39.85■■■■□ 3.97
APTR-202ENST00000416650 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.79■■■■□ 3.96
APTR-202ENST00000416650 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.72■■■■□ 3.95
APTR-202ENST00000416650 OSCARQ8IYS5 282 aa39.68■■■■□ 3.94
APTR-202ENST00000416650 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.65■■■■□ 3.94
APTR-202ENST00000416650 TRIM41Q8WV44 630 aa39.58■■■■□ 3.93
APTR-202ENST00000416650 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.55■■■■□ 3.92
APTR-202ENST00000416650 CHD1O14646 1710 aa39.45■■■■□ 3.91
APTR-202ENST00000416650 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.4■■■■□ 3.9
APTR-202ENST00000416650 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.39■■■■□ 3.9
APTR-202ENST00000416650 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.39■■■■□ 3.9
APTR-202ENST00000416650 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.39■■■■□ 3.9
APTR-202ENST00000416650 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.34■■■■□ 3.89
APTR-202ENST00000416650 CUX1P39880 1505 aa39.34■■■■□ 3.89
APTR-202ENST00000416650 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.32■■■■□ 3.89
APTR-202ENST00000416650 WDR97A6NE52 1622 aa39.31■■■■□ 3.88
APTR-202ENST00000416650 SOGA1O94964 1423 aa39.28■■■■□ 3.88
APTR-202ENST00000416650 ARHGEF11O15085 1522 aa39.22■■■■□ 3.87
APTR-202ENST00000416650 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.19■■■■□ 3.86
APTR-202ENST00000416650 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.16■■■■□ 3.86
APTR-202ENST00000416650 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.08■■■■□ 3.85
APTR-202ENST00000416650 PBRM1Q86U86 1689 aa39.05■■■■□ 3.84
APTR-202ENST00000416650 FBLN2P98095 1184 aa39.01■■■■□ 3.84
APTR-202ENST00000416650 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39■■■■□ 3.83
APTR-202ENST00000416650 GRIN2BQ13224 1484 aa38.98■■■■□ 3.83
APTR-202ENST00000416650 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.92■■■■□ 3.82
APTR-202ENST00000416650 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.89■■■■□ 3.82
APTR-202ENST00000416650 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.89■■■■□ 3.82
APTR-202ENST00000416650 SYNJ1O43426 1573 aa38.89■■■■□ 3.82
APTR-202ENST00000416650 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.87■■■■□ 3.81
APTR-202ENST00000416650 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.86■■■■□ 3.81
APTR-202ENST00000416650 SYNJ2O15056 1496 aa38.86■■■■□ 3.81
APTR-202ENST00000416650 ARAP1Q96P48 1450 aa38.84■■■■□ 3.81
APTR-202ENST00000416650 TOP2BQ02880 1626 aa38.81■■■■□ 3.8
APTR-202ENST00000416650 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.77■■■■□ 3.8
APTR-202ENST00000416650 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.73■■■■□ 3.79
APTR-202ENST00000416650 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.72■■■■□ 3.79
APTR-202ENST00000416650 ADAMTS12P58397 1594 aa38.61■■■■□ 3.77
APTR-202ENST00000416650 GRIN2AQ12879 1464 aa38.51■■■■□ 3.76
APTR-202ENST00000416650 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.44■■■■□ 3.74
APTR-202ENST00000416650 CEP170Q5SW79 1584 aa38.42■■■■□ 3.74
APTR-202ENST00000416650 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.37■■■■□ 3.73
APTR-202ENST00000416650 NUP160Q12769 1436 aa38.36■■■■□ 3.73
APTR-202ENST00000416650 SHROOM2Q13796 1616 aa38.28■■■■□ 3.72
APTR-202ENST00000416650 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.27■■■■□ 3.72
APTR-202ENST00000416650 TRHP20396 242 aaPredicted RBP38.24■■■■□ 3.71
APTR-202ENST00000416650 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.07■■■■□ 3.69
APTR-202ENST00000416650 CUL7Q14999 1698 aa38.01■■■■□ 3.67
APTR-202ENST00000416650 KIF27Q86VH2 1401 aa37.94■■■■□ 3.66
APTR-202ENST00000416650 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP37.91■■■■□ 3.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.2 ms