RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416366.1

LINC00174-202, long intergenic non-protein coding RNA 174, humanhuman

TSL 4

Gene LINC00174, Length 520 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00174-202ENST00000416366 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.01■■■■■ 6.88
LINC00174-202ENST00000416366 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.95■■■■■ 5.91
LINC00174-202ENST00000416366 ABCC9O60706 1549 aa51.79■■■■■ 5.88
LINC00174-202ENST00000416366 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.39■■■■■ 5.5
LINC00174-202ENST00000416366 NACADO15069 1562 aa49.12■■■■■ 5.45
LINC00174-202ENST00000416366 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.84■■■■■ 5.41
LINC00174-202ENST00000416366 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.57■■■■■ 5.37
LINC00174-202ENST00000416366 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.55■■■■■ 5.36
LINC00174-202ENST00000416366 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.27■■■■■ 5.32
LINC00174-202ENST00000416366 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.22■■■■■ 5.31
LINC00174-202ENST00000416366 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.09■■■■■ 5.29
LINC00174-202ENST00000416366 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.97■■■■■ 5.27
LINC00174-202ENST00000416366 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.97■■■■■ 5.27
LINC00174-202ENST00000416366 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.38■■■■■ 5.17
LINC00174-202ENST00000416366 SCRIBQ14160 1630 aa47.27■■■■■ 5.16
LINC00174-202ENST00000416366 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.8■■■■■ 5.08
LINC00174-202ENST00000416366 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.76■■■■■ 5.08
LINC00174-202ENST00000416366 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.67■■■■■ 5.06
LINC00174-202ENST00000416366 NCAPD3P42695 1498 aa45.4■■■■■ 4.86
LINC00174-202ENST00000416366 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.23■■■■■ 4.83
LINC00174-202ENST00000416366 SMARCA4P51532 1647 aa45.18■■■■■ 4.82
LINC00174-202ENST00000416366 SMARCA2P51531 1590 aa45.09■■■■■ 4.81
LINC00174-202ENST00000416366 HMGXB3Q12766 1538 aa45.01■■■■■ 4.8
LINC00174-202ENST00000416366 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.99■■■■■ 4.79
LINC00174-202ENST00000416366 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.8■■■■■ 4.76
LINC00174-202ENST00000416366 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.75■■■■■ 4.75
LINC00174-202ENST00000416366 ERCC6Q03468 1493 aa44.68■■■■■ 4.74
LINC00174-202ENST00000416366 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.68■■■■■ 4.74
LINC00174-202ENST00000416366 CUX2O14529 1486 aa44.63■■■■■ 4.73
LINC00174-202ENST00000416366 NESP48681 1621 aa44.54■■■■■ 4.72
LINC00174-202ENST00000416366 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.51■■■■■ 4.72
LINC00174-202ENST00000416366 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.29■■■■■ 4.68
LINC00174-202ENST00000416366 WIZO95785 1651 aa44.11■■■■■ 4.65
LINC00174-202ENST00000416366 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.05■■■■■ 4.64
LINC00174-202ENST00000416366 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.05■■■■■ 4.64
LINC00174-202ENST00000416366 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.01■■■■■ 4.64
LINC00174-202ENST00000416366 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.93■■■■■ 4.62
LINC00174-202ENST00000416366 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.84■■■■■ 4.61
LINC00174-202ENST00000416366 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.62■■■■■ 4.57
LINC00174-202ENST00000416366 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.58■■■■■ 4.57
LINC00174-202ENST00000416366 CFTRP13569 1480 aa43.53■■■■■ 4.56
LINC00174-202ENST00000416366 WDR62O43379 1518 aa43.52■■■■■ 4.56
LINC00174-202ENST00000416366 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.46■■■■■ 4.55
LINC00174-202ENST00000416366 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.45■■■■■ 4.55
LINC00174-202ENST00000416366 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.13■■■■■ 4.49
LINC00174-202ENST00000416366 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.08■■■■■ 4.49
LINC00174-202ENST00000416366 PRDM2Q13029 1718 aa42.99■■■■■ 4.47
LINC00174-202ENST00000416366 OSCARQ8IYS5 282 aa42.66■■■■■ 4.42
LINC00174-202ENST00000416366 TOPBP1Q92547 1522 aa42.65■■■■■ 4.42
LINC00174-202ENST00000416366 IFT140Q96RY7 1462 aa42.63■■■■■ 4.42
LINC00174-202ENST00000416366 ABCC8Q09428 1581 aa42.61■■■■■ 4.41
LINC00174-202ENST00000416366 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.51■■■■■ 4.4
LINC00174-202ENST00000416366 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.49■■■■■ 4.39
LINC00174-202ENST00000416366 TRIM41Q8WV44 630 aa42.48■■■■■ 4.39
LINC00174-202ENST00000416366 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.26■■■■■ 4.36
LINC00174-202ENST00000416366 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.24■■■■■ 4.35
LINC00174-202ENST00000416366 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.23■■■■■ 4.35
LINC00174-202ENST00000416366 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.17■■■■■ 4.34
LINC00174-202ENST00000416366 SOGA1O94964 1423 aa42.06■■■■■ 4.32
LINC00174-202ENST00000416366 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.05■■■■■ 4.32
LINC00174-202ENST00000416366 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.99■■■■■ 4.31
LINC00174-202ENST00000416366 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.99■■■■■ 4.31
LINC00174-202ENST00000416366 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.99■■■■■ 4.31
LINC00174-202ENST00000416366 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.96■■■■■ 4.31
LINC00174-202ENST00000416366 CUX1P39880 1505 aa41.95■■■■■ 4.31
LINC00174-202ENST00000416366 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.94■■■■■ 4.3
LINC00174-202ENST00000416366 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.94■■■■■ 4.3
LINC00174-202ENST00000416366 ARHGEF11O15085 1522 aa41.9■■■■■ 4.3
LINC00174-202ENST00000416366 CHD1O14646 1710 aa41.89■■■■■ 4.3
LINC00174-202ENST00000416366 WDR97A6NE52 1622 aa41.87■■■■■ 4.29
LINC00174-202ENST00000416366 FBLN2P98095 1184 aa41.83■■■■■ 4.29
LINC00174-202ENST00000416366 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.71■■■■■ 4.27
LINC00174-202ENST00000416366 GRIN2BQ13224 1484 aa41.66■■■■■ 4.26
LINC00174-202ENST00000416366 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.65■■■■■ 4.26
LINC00174-202ENST00000416366 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.61■■■■■ 4.25
LINC00174-202ENST00000416366 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.6■■■■■ 4.25
LINC00174-202ENST00000416366 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.54■■■■■ 4.24
LINC00174-202ENST00000416366 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.53■■■■■ 4.24
LINC00174-202ENST00000416366 SYNJ2O15056 1496 aa41.51■■■■■ 4.24
LINC00174-202ENST00000416366 ARAP1Q96P48 1450 aa41.5■■■■■ 4.23
LINC00174-202ENST00000416366 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.49■■■■■ 4.23
LINC00174-202ENST00000416366 SYNJ1O43426 1573 aa41.46■■■■■ 4.23
LINC00174-202ENST00000416366 PBRM1Q86U86 1689 aa41.42■■■■■ 4.22
LINC00174-202ENST00000416366 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.41■■■■■ 4.22
LINC00174-202ENST00000416366 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.38■■■■■ 4.22
LINC00174-202ENST00000416366 TOP2BQ02880 1626 aa41.33■■■■■ 4.21
LINC00174-202ENST00000416366 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.32■■■■■ 4.2
LINC00174-202ENST00000416366 GRIN2AQ12879 1464 aa41.11■■■■■ 4.17
LINC00174-202ENST00000416366 ADAMTS12P58397 1594 aa41.07■■■■■ 4.16
LINC00174-202ENST00000416366 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.06■■■■■ 4.16
LINC00174-202ENST00000416366 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.03■■■■■ 4.16
LINC00174-202ENST00000416366 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.01■■■■■ 4.16
LINC00174-202ENST00000416366 NUP160Q12769 1436 aa41.01■■■■■ 4.15
LINC00174-202ENST00000416366 CEP170Q5SW79 1584 aa40.94■■■■■ 4.14
LINC00174-202ENST00000416366 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.82■■■■■ 4.13
LINC00174-202ENST00000416366 SHROOM2Q13796 1616 aa40.78■■■■■ 4.12
LINC00174-202ENST00000416366 JPH4Q96JJ6 628 aa40.62■■■■■ 4.09
LINC00174-202ENST00000416366 IGF1RP08069 1367 aa40.57■■■■■ 4.08
LINC00174-202ENST00000416366 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.57■■■■■ 4.08
LINC00174-202ENST00000416366 KIF27Q86VH2 1401 aa40.55■■■■■ 4.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.3 ms