RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416214.1

PTRH1-203, Transcript of peptidyl-tRNA hydrolase 1 homolog, humanhuman

TSL 3

Gene PTRH1, Length 424 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTRH1-203ENST00000416214 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.85■■■■■ 6.85
PTRH1-203ENST00000416214 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.82■■■■■ 5.89
PTRH1-203ENST00000416214 ABCC9O60706 1549 aa51.33■■■■■ 5.81
PTRH1-203ENST00000416214 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.07■■■■■ 5.45
PTRH1-203ENST00000416214 NACADO15069 1562 aa48.82■■■■■ 5.41
PTRH1-203ENST00000416214 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.55■■■■■ 5.36
PTRH1-203ENST00000416214 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.27■■■■■ 5.32
PTRH1-203ENST00000416214 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.06■■■■■ 5.28
PTRH1-203ENST00000416214 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.04■■■■■ 5.28
PTRH1-203ENST00000416214 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.82■■■■■ 5.25
PTRH1-203ENST00000416214 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.78■■■■■ 5.24
PTRH1-203ENST00000416214 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.68■■■■■ 5.22
PTRH1-203ENST00000416214 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.62■■■■■ 5.21
PTRH1-203ENST00000416214 SCRIBQ14160 1630 aa47.23■■■■■ 5.15
PTRH1-203ENST00000416214 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.03■■■■■ 5.12
PTRH1-203ENST00000416214 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.43■■■■■ 5.02
PTRH1-203ENST00000416214 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.42■■■■■ 5.02
PTRH1-203ENST00000416214 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.18■■■■■ 4.98
PTRH1-203ENST00000416214 SMARCA4P51532 1647 aa45.08■■■■■ 4.81
PTRH1-203ENST00000416214 NCAPD3P42695 1498 aa45.02■■■■■ 4.8
PTRH1-203ENST00000416214 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.97■■■■■ 4.79
PTRH1-203ENST00000416214 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.9■■■■■ 4.78
PTRH1-203ENST00000416214 SMARCA2P51531 1590 aa44.9■■■■■ 4.78
PTRH1-203ENST00000416214 HMGXB3Q12766 1538 aa44.8■■■■■ 4.76
PTRH1-203ENST00000416214 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.63■■■■■ 4.73
PTRH1-203ENST00000416214 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.59■■■■■ 4.73
PTRH1-203ENST00000416214 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.58■■■■■ 4.73
PTRH1-203ENST00000416214 ERCC6Q03468 1493 aa44.29■■■■■ 4.68
PTRH1-203ENST00000416214 NESP48681 1621 aa44.21■■■■■ 4.67
PTRH1-203ENST00000416214 WIZO95785 1651 aa44.11■■■■■ 4.65
PTRH1-203ENST00000416214 CUX2O14529 1486 aa44.08■■■■■ 4.65
PTRH1-203ENST00000416214 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.01■■■■■ 4.64
PTRH1-203ENST00000416214 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.78■■■■■ 4.6
PTRH1-203ENST00000416214 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.75■■■■■ 4.59
PTRH1-203ENST00000416214 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.74■■■■■ 4.59
PTRH1-203ENST00000416214 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.68■■■■■ 4.58
PTRH1-203ENST00000416214 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.67■■■■■ 4.58
PTRH1-203ENST00000416214 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.58■■■■■ 4.57
PTRH1-203ENST00000416214 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.47■■■■■ 4.55
PTRH1-203ENST00000416214 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.32■■■■■ 4.52
PTRH1-203ENST00000416214 CFTRP13569 1480 aa43.28■■■■■ 4.52
PTRH1-203ENST00000416214 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.24■■■■■ 4.51
PTRH1-203ENST00000416214 WDR62O43379 1518 aa43.22■■■■■ 4.51
PTRH1-203ENST00000416214 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.21■■■■■ 4.51
PTRH1-203ENST00000416214 PRDM2Q13029 1718 aa43.03■■■■■ 4.48
PTRH1-203ENST00000416214 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.03■■■■■ 4.48
PTRH1-203ENST00000416214 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.84■■■■■ 4.45
PTRH1-203ENST00000416214 TOPBP1Q92547 1522 aa42.46■■■■■ 4.39
PTRH1-203ENST00000416214 ABCC8Q09428 1581 aa42.36■■■■■ 4.37
PTRH1-203ENST00000416214 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.36■■■■■ 4.37
PTRH1-203ENST00000416214 IFT140Q96RY7 1462 aa42.34■■■■■ 4.37
PTRH1-203ENST00000416214 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.23■■■■■ 4.35
PTRH1-203ENST00000416214 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.12■■■■■ 4.33
PTRH1-203ENST00000416214 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.09■■■■■ 4.33
PTRH1-203ENST00000416214 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.07■■■■■ 4.33
PTRH1-203ENST00000416214 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.04■■■■■ 4.32
PTRH1-203ENST00000416214 OSCARQ8IYS5 282 aa42.04■■■■■ 4.32
PTRH1-203ENST00000416214 CUX1P39880 1505 aa41.88■■■■■ 4.29
PTRH1-203ENST00000416214 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.87■■■■■ 4.29
PTRH1-203ENST00000416214 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.86■■■■■ 4.29
PTRH1-203ENST00000416214 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.85■■■■■ 4.29
PTRH1-203ENST00000416214 SOGA1O94964 1423 aa41.81■■■■■ 4.28
PTRH1-203ENST00000416214 TRIM41Q8WV44 630 aa41.78■■■■■ 4.28
PTRH1-203ENST00000416214 CHD1O14646 1710 aa41.72■■■■■ 4.27
PTRH1-203ENST00000416214 WDR97A6NE52 1622 aa41.69■■■■■ 4.26
PTRH1-203ENST00000416214 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.67■■■■■ 4.26
PTRH1-203ENST00000416214 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.58■■■■■ 4.25
PTRH1-203ENST00000416214 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.58■■■■■ 4.25
PTRH1-203ENST00000416214 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.58■■■■■ 4.25
PTRH1-203ENST00000416214 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.51■■■■■ 4.24
PTRH1-203ENST00000416214 FBLN2P98095 1184 aa41.48■■■■■ 4.23
PTRH1-203ENST00000416214 ARHGEF11O15085 1522 aa41.46■■■■■ 4.23
PTRH1-203ENST00000416214 GRIN2BQ13224 1484 aa41.43■■■■■ 4.22
PTRH1-203ENST00000416214 PBRM1Q86U86 1689 aa41.41■■■■■ 4.22
PTRH1-203ENST00000416214 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.41■■■■■ 4.22
PTRH1-203ENST00000416214 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.39■■■■■ 4.22
PTRH1-203ENST00000416214 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.37■■■■■ 4.21
PTRH1-203ENST00000416214 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.34■■■■■ 4.21
PTRH1-203ENST00000416214 TOP2BQ02880 1626 aa41.34■■■■■ 4.21
PTRH1-203ENST00000416214 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.34■■■■■ 4.21
PTRH1-203ENST00000416214 SYNJ1O43426 1573 aa41.31■■■■■ 4.2
PTRH1-203ENST00000416214 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.31■■■■■ 4.2
PTRH1-203ENST00000416214 SYNJ2O15056 1496 aa41.25■■■■■ 4.19
PTRH1-203ENST00000416214 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.24■■■■■ 4.19
PTRH1-203ENST00000416214 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.2■■■■■ 4.19
PTRH1-203ENST00000416214 ARAP1Q96P48 1450 aa41.09■■■■■ 4.17
PTRH1-203ENST00000416214 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.03■■■■■ 4.16
PTRH1-203ENST00000416214 ADAMTS12P58397 1594 aa41■■■■■ 4.15
PTRH1-203ENST00000416214 GRIN2AQ12879 1464 aa40.91■■■■■ 4.14
PTRH1-203ENST00000416214 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.89■■■■■ 4.14
PTRH1-203ENST00000416214 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.83■■■■■ 4.13
PTRH1-203ENST00000416214 CEP170Q5SW79 1584 aa40.78■■■■■ 4.12
PTRH1-203ENST00000416214 NUP160Q12769 1436 aa40.75■■■■■ 4.11
PTRH1-203ENST00000416214 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.58■■■■■ 4.09
PTRH1-203ENST00000416214 SHROOM2Q13796 1616 aa40.57■■■■■ 4.09
PTRH1-203ENST00000416214 KIF27Q86VH2 1401 aa40.49■■■■■ 4.07
PTRH1-203ENST00000416214 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.45■■■■■ 4.07
PTRH1-203ENST00000416214 CUL7Q14999 1698 aa40.42■■■■■ 4.06
PTRH1-203ENST00000416214 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.42■■■■■ 4.06
PTRH1-203ENST00000416214 IGF1RP08069 1367 aa40.39■■■■■ 4.06
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