RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414969.2

SLC6A1-AS1-201, SLC6A1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene SLC6A1-AS1, Length 584 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 NISCHQ9Y2I1 1504 aa28.15■■■□□ 2.1
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa25.01■■□□□ 1.59
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 ABCC9O60706 1549 aa24.56■■□□□ 1.52
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 DCAF8L2P0C7V8 631 aa23.58■■□□□ 1.37
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.57■■□□□ 1.36
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 NACADO15069 1562 aa23.53■■□□□ 1.36
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 MYO15BQ96JP2 1530 aa23.34■■□□□ 1.33
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa23.25■■□□□ 1.31
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.06■■□□□ 1.28
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP22.95■■□□□ 1.26
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 SCRIBQ14160 1630 aa22.88■■□□□ 1.25
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 BICRAQ9NZM4 1560 aa22.86■■□□□ 1.25
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa22.57■■□□□ 1.2
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.55■■□□□ 1.2
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.2■■□□□ 1.14
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.05■■□□□ 1.12
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 SMARCA4P51532 1647 aa21.85■■□□□ 1.09
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa21.75■■□□□ 1.07
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 MROH2BQ7Z745 1585 aa21.71■■□□□ 1.07
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 NCAPD3P42695 1498 aa21.71■■□□□ 1.07
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 SMARCA2P51531 1590 aa21.7■■□□□ 1.06
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 PEG3Q9GZU2 1588 aa21.61■■□□□ 1.05
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 HMGXB3Q12766 1538 aa21.6■■□□□ 1.05
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 WIZO95785 1651 aa21.49■■□□□ 1.03
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 NESP48681 1621 aa21.24■□□□□ 0.99
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 ERCC6Q03468 1493 aa21.15■□□□□ 0.98
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.14■□□□□ 0.98
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.09■□□□□ 0.97
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.01■□□□□ 0.95
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 CCDC88BA6NC98 1476 aa21■□□□□ 0.95
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa20.98■□□□□ 0.95
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 CFTRP13569 1480 aa20.95■□□□□ 0.94
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 CUX2O14529 1486 aa20.9■□□□□ 0.94
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 FANCD2Q9BXW9 1451 aa20.87■□□□□ 0.93
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 CEP164Q9UPV0 1460 aa20.83■□□□□ 0.93
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 PRDM2Q13029 1718 aa20.81■□□□□ 0.92
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 MRC2Q9UBG0 1479 aa20.81■□□□□ 0.92
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 WDR62O43379 1518 aa20.73■□□□□ 0.91
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 TOPBP1Q92547 1522 aa20.53■□□□□ 0.88
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 ABCC8Q09428 1581 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 DNMBPQ6XZF7 1577 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 IFT140Q96RY7 1462 aa20.39■□□□□ 0.85
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 CUX1P39880 1505 aa20.37■□□□□ 0.85
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 FGD5Q6ZNL6 1462 aa20.3■□□□□ 0.84
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa20.29■□□□□ 0.84
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20.29■□□□□ 0.84
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 SOGA1O94964 1423 aa20.27■□□□□ 0.83
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP20.23■□□□□ 0.83
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP20.21■□□□□ 0.83
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 SYNJ1O43426 1573 aa20.19■□□□□ 0.82
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 TOP2BQ02880 1626 aa20.17■□□□□ 0.82
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa20.17■□□□□ 0.82
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 WDR97A6NE52 1622 aa20.13■□□□□ 0.81
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.09■□□□□ 0.81
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 OSCARQ8IYS5 282 aa20.04■□□□□ 0.8
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.03■□□□□ 0.8
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.02■□□□□ 0.8
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 GRIN2BQ13224 1484 aa20.02■□□□□ 0.8
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.02■□□□□ 0.8
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 PBRM1Q86U86 1689 aa20■□□□□ 0.79
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 CHD1O14646 1710 aa19.99■□□□□ 0.79
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 FBLN2P98095 1184 aa19.98■□□□□ 0.79
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP19.9■□□□□ 0.78
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 SYNJ2O15056 1496 aa19.89■□□□□ 0.77
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 ADAMTS12P58397 1594 aa19.84■□□□□ 0.77
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 ERICH3Q5RHP9 1530 aa19.84■□□□□ 0.77
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 KIF27Q86VH2 1401 aa19.8■□□□□ 0.76
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 FHAD1B1AJZ9 1412 aa19.79■□□□□ 0.76
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 GRIN2AQ12879 1464 aa19.77■□□□□ 0.76
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 CLASP1Q7Z460 1538 aa19.76■□□□□ 0.75
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 TRIM41Q8WV44 630 aa19.75■□□□□ 0.75
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa19.75■□□□□ 0.75
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa19.75■□□□□ 0.75
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa19.75■□□□□ 0.75
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 ARHGEF11O15085 1522 aa19.74■□□□□ 0.75
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 IGF1RP08069 1367 aa19.72■□□□□ 0.75
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 CEP170Q5SW79 1584 aa19.69■□□□□ 0.74
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 NUP160Q12769 1436 aa19.68■□□□□ 0.74
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 CUL7Q14999 1698 aa19.66■□□□□ 0.74
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa19.66■□□□□ 0.74
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa19.6■□□□□ 0.73
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 ARAP1Q96P48 1450 aa19.59■□□□□ 0.73
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 CYB5RLQ6IPT4 315 aa19.57■□□□□ 0.72
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 SHROOM2Q13796 1616 aa19.53■□□□□ 0.72
SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 ERCC6L2Q5T890 1561 aa19.52■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 117.6 ms