RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000413832.1

RAD18-202, Transcript of RAD18, E3 ubiquitin protein ligase, humanhuman

TSL 5

Gene RAD18, Length 581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD18-202ENST00000413832 NISCHQ9Y2I1 1504 aa45.01■■■■■ 4.8
RAD18-202ENST00000413832 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa40.06■■■■■ 4
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RAD18-202ENST00000413832 DCAF8L2P0C7V8 631 aa37.79■■■■□ 3.64
RAD18-202ENST00000413832 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa37.79■■■■□ 3.64
RAD18-202ENST00000413832 NACADO15069 1562 aa37.7■■■■□ 3.63
RAD18-202ENST00000413832 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP37.46■■■■□ 3.59
RAD18-202ENST00000413832 MYO15BQ96JP2 1530 aa37.39■■■■□ 3.58
RAD18-202ENST00000413832 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa37.2■■■■□ 3.55
RAD18-202ENST00000413832 UNC13AQ9UPW8 1703 aa36.93■■■■□ 3.5
RAD18-202ENST00000413832 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP36.79■■■■□ 3.48
RAD18-202ENST00000413832 BICRAQ9NZM4 1560 aa36.63■■■■□ 3.45
RAD18-202ENST00000413832 SCRIBQ14160 1630 aa36.59■■■■□ 3.45
RAD18-202ENST00000413832 DNAJC5BQ9UF47 199 aa36.23■■■■□ 3.39
RAD18-202ENST00000413832 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa36.19■■■■□ 3.38
RAD18-202ENST00000413832 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP35.68■■■■□ 3.3
RAD18-202ENST00000413832 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.58■■■■□ 3.29
RAD18-202ENST00000413832 CECR2Q9BXF3 1484 aa35.36■■■■□ 3.25
RAD18-202ENST00000413832 SMARCA4P51532 1647 aa34.96■■■■□ 3.19
RAD18-202ENST00000413832 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP34.91■■■■□ 3.18
RAD18-202ENST00000413832 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa34.79■■■■□ 3.16
RAD18-202ENST00000413832 NCAPD3P42695 1498 aa34.78■■■■□ 3.16
RAD18-202ENST00000413832 SMARCA2P51531 1590 aa34.76■■■■□ 3.16
RAD18-202ENST00000413832 MROH2BQ7Z745 1585 aa34.7■■■■□ 3.15
RAD18-202ENST00000413832 HMGXB3Q12766 1538 aa34.6■■■■□ 3.13
RAD18-202ENST00000413832 PEG3Q9GZU2 1588 aa34.58■■■■□ 3.13
RAD18-202ENST00000413832 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP34.52■■■■□ 3.12
RAD18-202ENST00000413832 WIZO95785 1651 aa34.35■■■■□ 3.09
RAD18-202ENST00000413832 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP34.27■■■■□ 3.08
RAD18-202ENST00000413832 NESP48681 1621 aa34.03■■■■□ 3.04
RAD18-202ENST00000413832 ERCC6Q03468 1493 aa33.95■■■■□ 3.03
RAD18-202ENST00000413832 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP33.94■■■■□ 3.02
RAD18-202ENST00000413832 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.89■■■■□ 3.02
RAD18-202ENST00000413832 CADPSQ9ULU8 1353 aa33.78■■■■□ 3
RAD18-202ENST00000413832 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33.7■■■□□ 2.98
RAD18-202ENST00000413832 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33.62■■■□□ 2.97
RAD18-202ENST00000413832 CUX2O14529 1486 aa33.58■■■□□ 2.97
RAD18-202ENST00000413832 CCDC88BA6NC98 1476 aa33.56■■■□□ 2.96
RAD18-202ENST00000413832 CFTRP13569 1480 aa33.54■■■□□ 2.96
RAD18-202ENST00000413832 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP33.5■■■□□ 2.95
RAD18-202ENST00000413832 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP33.41■■■□□ 2.94
RAD18-202ENST00000413832 FANCD2Q9BXW9 1451 aa33.41■■■□□ 2.94
RAD18-202ENST00000413832 CEP164Q9UPV0 1460 aa33.38■■■□□ 2.93
RAD18-202ENST00000413832 MRC2Q9UBG0 1479 aa33.35■■■□□ 2.93
RAD18-202ENST00000413832 PRDM2Q13029 1718 aa33.3■■■□□ 2.92
RAD18-202ENST00000413832 WDR62O43379 1518 aa33.22■■■□□ 2.91
RAD18-202ENST00000413832 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP33.07■■■□□ 2.89
RAD18-202ENST00000413832 TOPBP1Q92547 1522 aa32.86■■■□□ 2.85
RAD18-202ENST00000413832 ABCC8Q09428 1581 aa32.84■■■□□ 2.85
RAD18-202ENST00000413832 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa32.84■■■□□ 2.85
RAD18-202ENST00000413832 DNMBPQ6XZF7 1577 aa32.8■■■□□ 2.84
RAD18-202ENST00000413832 IFT140Q96RY7 1462 aa32.67■■■□□ 2.82
RAD18-202ENST00000413832 CUX1P39880 1505 aa32.57■■■□□ 2.8
RAD18-202ENST00000413832 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP32.56■■■□□ 2.8
RAD18-202ENST00000413832 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP32.55■■■□□ 2.8
RAD18-202ENST00000413832 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP32.49■■■□□ 2.79
RAD18-202ENST00000413832 FGD5Q6ZNL6 1462 aa32.48■■■□□ 2.79
RAD18-202ENST00000413832 SOGA1O94964 1423 aa32.45■■■□□ 2.79
RAD18-202ENST00000413832 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa32.45■■■□□ 2.79
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RAD18-202ENST00000413832 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP32.3■■■□□ 2.76
RAD18-202ENST00000413832 TOP2BQ02880 1626 aa32.25■■■□□ 2.75
RAD18-202ENST00000413832 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa32.25■■■□□ 2.75
RAD18-202ENST00000413832 SYNJ1O43426 1573 aa32.24■■■□□ 2.75
RAD18-202ENST00000413832 OSCARQ8IYS5 282 aa32.22■■■□□ 2.75
RAD18-202ENST00000413832 WDR97A6NE52 1622 aa32.21■■■□□ 2.75
RAD18-202ENST00000413832 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa32.14■■■□□ 2.74
RAD18-202ENST00000413832 GRIN2BQ13224 1484 aa32.08■■■□□ 2.73
RAD18-202ENST00000413832 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.07■■■□□ 2.72
RAD18-202ENST00000413832 FBLN2P98095 1184 aa32.06■■■□□ 2.72
RAD18-202ENST00000413832 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.05■■■□□ 2.72
RAD18-202ENST00000413832 CHD1O14646 1710 aa32.04■■■□□ 2.72
RAD18-202ENST00000413832 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.02■■■□□ 2.72
RAD18-202ENST00000413832 PBRM1Q86U86 1689 aa32.02■■■□□ 2.72
RAD18-202ENST00000413832 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP31.98■■■□□ 2.71
RAD18-202ENST00000413832 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP31.93■■■□□ 2.7
RAD18-202ENST00000413832 SYNJ2O15056 1496 aa31.87■■■□□ 2.69
RAD18-202ENST00000413832 ERICH3Q5RHP9 1530 aa31.76■■■□□ 2.68
RAD18-202ENST00000413832 ADAMTS12P58397 1594 aa31.73■■■□□ 2.67
RAD18-202ENST00000413832 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa31.7■■■□□ 2.66
RAD18-202ENST00000413832 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa31.7■■■□□ 2.66
RAD18-202ENST00000413832 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa31.7■■■□□ 2.66
RAD18-202ENST00000413832 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.68■■■□□ 2.66
RAD18-202ENST00000413832 ARHGEF11O15085 1522 aa31.67■■■□□ 2.66
RAD18-202ENST00000413832 TRIM41Q8WV44 630 aa31.67■■■□□ 2.66
RAD18-202ENST00000413832 KIF27Q86VH2 1401 aa31.66■■■□□ 2.66
RAD18-202ENST00000413832 GRIN2AQ12879 1464 aa31.65■■■□□ 2.66
RAD18-202ENST00000413832 CLASP1Q7Z460 1538 aa31.65■■■□□ 2.66
RAD18-202ENST00000413832 IGF1RP08069 1367 aa31.54■■■□□ 2.64
RAD18-202ENST00000413832 CEP170Q5SW79 1584 aa31.5■■■□□ 2.63
RAD18-202ENST00000413832 NUP160Q12769 1436 aa31.49■■■□□ 2.63
RAD18-202ENST00000413832 CUL7Q14999 1698 aa31.46■■■□□ 2.63
RAD18-202ENST00000413832 CYB5RLQ6IPT4 315 aa31.44■■■□□ 2.62
RAD18-202ENST00000413832 ARAP1Q96P48 1450 aa31.4■■■□□ 2.62
RAD18-202ENST00000413832 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa31.37■■■□□ 2.61
RAD18-202ENST00000413832 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa31.35■■■□□ 2.61
RAD18-202ENST00000413832 SHROOM2Q13796 1616 aa31.27■■■□□ 2.6
RAD18-202ENST00000413832 ERCC6L2Q5T890 1561 aa31.23■■■□□ 2.59
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