RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000413051.2

TRIOBP-206, Transcript of TRIO and F-actin binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene TRIOBP, Length 904 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBP-206ENST00000413051 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.69■■■■■ 6.51
TRIOBP-206ENST00000413051 ABCC9O60706 1549 aa50.69■■■■■ 5.71
TRIOBP-206ENST00000413051 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.22■■■■■ 5.63
TRIOBP-206ENST00000413051 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.02■■■■■ 5.28
TRIOBP-206ENST00000413051 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.01■■■■■ 5.28
TRIOBP-206ENST00000413051 NACADO15069 1562 aa47.56■■■■■ 5.2
TRIOBP-206ENST00000413051 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.21■■■■■ 5.15
TRIOBP-206ENST00000413051 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.11■■■■■ 5.13
TRIOBP-206ENST00000413051 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.08■■■■■ 5.13
TRIOBP-206ENST00000413051 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.7■■■■■ 5.07
TRIOBP-206ENST00000413051 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.69■■■■■ 5.06
TRIOBP-206ENST00000413051 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.04■■■■■ 4.96
TRIOBP-206ENST00000413051 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.94■■■■■ 4.95
TRIOBP-206ENST00000413051 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.9■■■■■ 4.94
TRIOBP-206ENST00000413051 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.79■■■■■ 4.92
TRIOBP-206ENST00000413051 SCRIBQ14160 1630 aa45.74■■■■■ 4.91
TRIOBP-206ENST00000413051 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.69■■■■■ 4.91
TRIOBP-206ENST00000413051 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.55■■■■■ 4.88
TRIOBP-206ENST00000413051 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.41■■■■■ 4.7
TRIOBP-206ENST00000413051 NCAPD3P42695 1498 aa43.89■■■■■ 4.62
TRIOBP-206ENST00000413051 CUX2O14529 1486 aa43.85■■■■■ 4.61
TRIOBP-206ENST00000413051 ERCC6Q03468 1493 aa43.77■■■■■ 4.6
TRIOBP-206ENST00000413051 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.7■■■■■ 4.59
TRIOBP-206ENST00000413051 SMARCA4P51532 1647 aa43.58■■■■■ 4.57
TRIOBP-206ENST00000413051 SMARCA2P51531 1590 aa43.55■■■■■ 4.56
TRIOBP-206ENST00000413051 HMGXB3Q12766 1538 aa43.53■■■■■ 4.56
TRIOBP-206ENST00000413051 NESP48681 1621 aa43.43■■■■■ 4.54
TRIOBP-206ENST00000413051 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.25■■■■■ 4.51
TRIOBP-206ENST00000413051 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.25■■■■■ 4.51
TRIOBP-206ENST00000413051 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.12■■■■■ 4.49
TRIOBP-206ENST00000413051 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.09■■■■■ 4.49
TRIOBP-206ENST00000413051 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.02■■■■■ 4.48
TRIOBP-206ENST00000413051 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.93■■■■■ 4.46
TRIOBP-206ENST00000413051 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.9■■■■■ 4.46
TRIOBP-206ENST00000413051 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.74■■■■■ 4.43
TRIOBP-206ENST00000413051 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.53■■■■■ 4.4
TRIOBP-206ENST00000413051 WIZO95785 1651 aa42.44■■■■■ 4.38
TRIOBP-206ENST00000413051 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.43■■■■■ 4.38
TRIOBP-206ENST00000413051 WDR62O43379 1518 aa42.36■■■■■ 4.37
TRIOBP-206ENST00000413051 TRIM41Q8WV44 630 aa42.27■■■■■ 4.36
TRIOBP-206ENST00000413051 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.17■■■■■ 4.34
TRIOBP-206ENST00000413051 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.08■■■■■ 4.33
TRIOBP-206ENST00000413051 CFTRP13569 1480 aa41.96■■■■■ 4.31
TRIOBP-206ENST00000413051 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.83■■■■■ 4.29
TRIOBP-206ENST00000413051 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.79■■■■■ 4.28
TRIOBP-206ENST00000413051 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.79■■■■■ 4.28
TRIOBP-206ENST00000413051 OSCARQ8IYS5 282 aa41.76■■■■■ 4.28
TRIOBP-206ENST00000413051 PRDM2Q13029 1718 aa41.62■■■■■ 4.25
TRIOBP-206ENST00000413051 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.36■■■■■ 4.21
TRIOBP-206ENST00000413051 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.36■■■■■ 4.21
TRIOBP-206ENST00000413051 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.36■■■■■ 4.21
TRIOBP-206ENST00000413051 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.36■■■■■ 4.21
TRIOBP-206ENST00000413051 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.34■■■■■ 4.21
TRIOBP-206ENST00000413051 IFT140Q96RY7 1462 aa41.32■■■■■ 4.2
TRIOBP-206ENST00000413051 TOPBP1Q92547 1522 aa41.23■■■■■ 4.19
TRIOBP-206ENST00000413051 ARHGEF11O15085 1522 aa41.13■■■■■ 4.18
TRIOBP-206ENST00000413051 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.12■■■■■ 4.17
TRIOBP-206ENST00000413051 ABCC8Q09428 1581 aa41.08■■■■■ 4.17
TRIOBP-206ENST00000413051 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.04■■■■■ 4.16
TRIOBP-206ENST00000413051 CHD1O14646 1710 aa40.96■■■■■ 4.15
TRIOBP-206ENST00000413051 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.95■■■■■ 4.15
TRIOBP-206ENST00000413051 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.9■■■■■ 4.14
TRIOBP-206ENST00000413051 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.85■■■■■ 4.13
TRIOBP-206ENST00000413051 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.77■■■■■ 4.12
TRIOBP-206ENST00000413051 FBLN2P98095 1184 aa40.72■■■■■ 4.11
TRIOBP-206ENST00000413051 ARAP1Q96P48 1450 aa40.7■■■■■ 4.11
TRIOBP-206ENST00000413051 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.65■■■■■ 4.1
TRIOBP-206ENST00000413051 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.57■■■■■ 4.08
TRIOBP-206ENST00000413051 SOGA1O94964 1423 aa40.57■■■■■ 4.08
TRIOBP-206ENST00000413051 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.54■■■■■ 4.08
TRIOBP-206ENST00000413051 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.47■■■■■ 4.07
TRIOBP-206ENST00000413051 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.45■■■■■ 4.07
TRIOBP-206ENST00000413051 WDR97A6NE52 1622 aa40.43■■■■■ 4.06
TRIOBP-206ENST00000413051 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.41■■■■■ 4.06
TRIOBP-206ENST00000413051 CUX1P39880 1505 aa40.37■■■■■ 4.05
TRIOBP-206ENST00000413051 SYNJ1O43426 1573 aa40.32■■■■■ 4.05
TRIOBP-206ENST00000413051 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.32■■■■■ 4.05
TRIOBP-206ENST00000413051 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.32■■■■■ 4.04
TRIOBP-206ENST00000413051 GRIN2BQ13224 1484 aa40.27■■■■■ 4.04
TRIOBP-206ENST00000413051 SYNJ2O15056 1496 aa40.19■■■■■ 4.03
TRIOBP-206ENST00000413051 PBRM1Q86U86 1689 aa40.18■■■■■ 4.02
TRIOBP-206ENST00000413051 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.07■■■■■ 4.01
TRIOBP-206ENST00000413051 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.98■■■■□ 3.99
TRIOBP-206ENST00000413051 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.95■■■■□ 3.99
TRIOBP-206ENST00000413051 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.78■■■■□ 3.96
TRIOBP-206ENST00000413051 GRIN2AQ12879 1464 aa39.76■■■■□ 3.96
TRIOBP-206ENST00000413051 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP39.71■■■■□ 3.95
TRIOBP-206ENST00000413051 ADAMTS12P58397 1594 aa39.71■■■■□ 3.95
TRIOBP-206ENST00000413051 CEP170Q5SW79 1584 aa39.68■■■■□ 3.94
TRIOBP-206ENST00000413051 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.68■■■■□ 3.94
TRIOBP-206ENST00000413051 NUP160Q12769 1436 aa39.65■■■■□ 3.94
TRIOBP-206ENST00000413051 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.61■■■■□ 3.93
TRIOBP-206ENST00000413051 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.61■■■■□ 3.93
TRIOBP-206ENST00000413051 TOP2BQ02880 1626 aa39.58■■■■□ 3.93
TRIOBP-206ENST00000413051 SHROOM2Q13796 1616 aa39.57■■■■□ 3.92
TRIOBP-206ENST00000413051 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.53■■■■□ 3.92
TRIOBP-206ENST00000413051 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.45■■■■□ 3.91
TRIOBP-206ENST00000413051 KIF13AQ9H1H9 1805 aa39.39■■■■□ 3.9
TRIOBP-206ENST00000413051 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP39.31■■■■□ 3.88
TRIOBP-206ENST00000413051 JPH4Q96JJ6 628 aa39.23■■■■□ 3.87
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