RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412806.1

SH3BP5-204, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP5, Length 1,900 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-204ENST00000412806 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.29■■■■■ 5.32
SH3BP5-204ENST00000412806 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa41.97■■■■■ 4.31
SH3BP5-204ENST00000412806 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.63■■■■■ 4.1
SH3BP5-204ENST00000412806 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.86■■■■□ 3.97
SH3BP5-204ENST00000412806 DCAF8L2P0C7V8 631 aa39.82■■■■□ 3.97
SH3BP5-204ENST00000412806 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.72■■■■□ 3.95
SH3BP5-204ENST00000412806 ABCC9O60706 1549 aa39.46■■■■□ 3.91
SH3BP5-204ENST00000412806 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.23■■■■□ 3.87
SH3BP5-204ENST00000412806 NACADO15069 1562 aa38.97■■■■□ 3.83
SH3BP5-204ENST00000412806 SCRIBQ14160 1630 aa38.73■■■■□ 3.79
SH3BP5-204ENST00000412806 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa38.59■■■■□ 3.77
SH3BP5-204ENST00000412806 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.33■■■■□ 3.73
SH3BP5-204ENST00000412806 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.03■■■■□ 3.68
SH3BP5-204ENST00000412806 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.59■■■■□ 3.61
SH3BP5-204ENST00000412806 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.56■■■■□ 3.6
SH3BP5-204ENST00000412806 BICRAQ9NZM4 1560 aa37.5■■■■□ 3.59
SH3BP5-204ENST00000412806 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.38■■■■□ 3.57
SH3BP5-204ENST00000412806 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP37.27■■■■□ 3.56
SH3BP5-204ENST00000412806 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.25■■■■□ 3.55
SH3BP5-204ENST00000412806 WIZO95785 1651 aa37.15■■■■□ 3.54
SH3BP5-204ENST00000412806 SMARCA4P51532 1647 aa37.1■■■■□ 3.53
SH3BP5-204ENST00000412806 CHIC1Q5VXU3 224 aa36.83■■■■□ 3.49
SH3BP5-204ENST00000412806 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.67■■■■□ 3.46
SH3BP5-204ENST00000412806 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.57■■■■□ 3.45
SH3BP5-204ENST00000412806 SMARCA2P51531 1590 aa36.39■■■■□ 3.42
SH3BP5-204ENST00000412806 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.36■■■■□ 3.41
SH3BP5-204ENST00000412806 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.32■■■■□ 3.4
SH3BP5-204ENST00000412806 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.3■■■■□ 3.4
SH3BP5-204ENST00000412806 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.18■■■■□ 3.38
SH3BP5-204ENST00000412806 HMGXB3Q12766 1538 aa35.96■■■■□ 3.35
SH3BP5-204ENST00000412806 NCAPD3P42695 1498 aa35.95■■■■□ 3.35
SH3BP5-204ENST00000412806 TRIM41Q8WV44 630 aa35.95■■■■□ 3.34
SH3BP5-204ENST00000412806 ABCC8Q09428 1581 aa35.74■■■■□ 3.31
SH3BP5-204ENST00000412806 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.73■■■■□ 3.31
SH3BP5-204ENST00000412806 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa35.49■■■■□ 3.27
SH3BP5-204ENST00000412806 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP35.4■■■■□ 3.26
SH3BP5-204ENST00000412806 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.36■■■■□ 3.25
SH3BP5-204ENST00000412806 SYNJ1O43426 1573 aa35.29■■■■□ 3.24
SH3BP5-204ENST00000412806 CFTRP13569 1480 aa35.27■■■■□ 3.24
SH3BP5-204ENST00000412806 PRDM2Q13029 1718 aa35.25■■■■□ 3.23
SH3BP5-204ENST00000412806 SOGA1O94964 1423 aa35.08■■■■□ 3.21
SH3BP5-204ENST00000412806 TOP2BQ02880 1626 aa35.07■■■■□ 3.21
SH3BP5-204ENST00000412806 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.06■■■■□ 3.2
SH3BP5-204ENST00000412806 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.06■■■■□ 3.2
SH3BP5-204ENST00000412806 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.98■■■■□ 3.19
SH3BP5-204ENST00000412806 EHMT2Q96KQ7 1210 aa34.95■■■■□ 3.19
SH3BP5-204ENST00000412806 EEA1Q15075 1411 aa34.95■■■■□ 3.18
SH3BP5-204ENST00000412806 CUX1P39880 1505 aa34.92■■■■□ 3.18
SH3BP5-204ENST00000412806 CSRNP3Q8WYN3 585 aa34.77■■■■□ 3.16
SH3BP5-204ENST00000412806 NESP48681 1621 aa34.77■■■■□ 3.16
SH3BP5-204ENST00000412806 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.77■■■■□ 3.16
SH3BP5-204ENST00000412806 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.72■■■■□ 3.15
SH3BP5-204ENST00000412806 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.72■■■■□ 3.15
SH3BP5-204ENST00000412806 KIF21BO75037 1637 aa34.58■■■■□ 3.13
SH3BP5-204ENST00000412806 GOLGA3Q08378 1498 aa34.55■■■■□ 3.12
SH3BP5-204ENST00000412806 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.51■■■■□ 3.11
SH3BP5-204ENST00000412806 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.48■■■■□ 3.11
SH3BP5-204ENST00000412806 TNIKQ9UKE5 1360 aa34.48■■■■□ 3.11
SH3BP5-204ENST00000412806 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.47■■■■□ 3.11
SH3BP5-204ENST00000412806 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.41■■■■□ 3.1
SH3BP5-204ENST00000412806 KIF27Q86VH2 1401 aa34.4■■■■□ 3.1
SH3BP5-204ENST00000412806 TOPBP1Q92547 1522 aa34.39■■■■□ 3.1
SH3BP5-204ENST00000412806 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.38■■■■□ 3.09
SH3BP5-204ENST00000412806 UBTFP17480 764 aaKnown RBP34.38■■■■□ 3.09
SH3BP5-204ENST00000412806 CEP162Q5TB80 1403 aa34.37■■■■□ 3.09
SH3BP5-204ENST00000412806 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa34.35■■■■□ 3.09
SH3BP5-204ENST00000412806 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.31■■■■□ 3.08
SH3BP5-204ENST00000412806 CUX2O14529 1486 aa34.29■■■■□ 3.08
SH3BP5-204ENST00000412806 PRXQ9BXM0 1461 aa34.28■■■■□ 3.08
SH3BP5-204ENST00000412806 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.26■■■■□ 3.07
SH3BP5-204ENST00000412806 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.25■■■■□ 3.07
SH3BP5-204ENST00000412806 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.18■■■■□ 3.06
SH3BP5-204ENST00000412806 PCGF6Q9BYE7 350 aa34.17■■■■□ 3.06
SH3BP5-204ENST00000412806 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.14■■■■□ 3.06
SH3BP5-204ENST00000412806 WDR97A6NE52 1622 aa34.1■■■■□ 3.05
SH3BP5-204ENST00000412806 IGF1RP08069 1367 aa34.09■■■■□ 3.05
SH3BP5-204ENST00000412806 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP34.02■■■■□ 3.04
SH3BP5-204ENST00000412806 CLIP1P30622 1438 aa34.01■■■■□ 3.04
SH3BP5-204ENST00000412806 MRC2Q9UBG0 1479 aa33.97■■■■□ 3.03
SH3BP5-204ENST00000412806 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa33.91■■■■□ 3.02
SH3BP5-204ENST00000412806 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.89■■■■□ 3.02
SH3BP5-204ENST00000412806 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.89■■■■□ 3.02
SH3BP5-204ENST00000412806 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP33.85■■■■□ 3.01
SH3BP5-204ENST00000412806 CUL7Q14999 1698 aa33.84■■■■□ 3.01
SH3BP5-204ENST00000412806 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP33.83■■■■□ 3.01
SH3BP5-204ENST00000412806 WDR62O43379 1518 aa33.8■■■■□ 3
SH3BP5-204ENST00000412806 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.79■■■■□ 3
SH3BP5-204ENST00000412806 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.76■■■□□ 2.99
SH3BP5-204ENST00000412806 VPS8Q8N3P4 1428 aa33.75■■■□□ 2.99
SH3BP5-204ENST00000412806 ERCC6Q03468 1493 aa33.74■■■□□ 2.99
SH3BP5-204ENST00000412806 ARAP1Q96P48 1450 aa33.69■■■□□ 2.98
SH3BP5-204ENST00000412806 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP33.69■■■□□ 2.98
SH3BP5-204ENST00000412806 PBRM1Q86U86 1689 aa33.66■■■□□ 2.98
SH3BP5-204ENST00000412806 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa33.61■■■□□ 2.97
SH3BP5-204ENST00000412806 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa33.6■■■□□ 2.97
SH3BP5-204ENST00000412806 IFT140Q96RY7 1462 aa33.59■■■□□ 2.97
SH3BP5-204ENST00000412806 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP33.54■■■□□ 2.963e-8■■■■■ 26.9
SH3BP5-204ENST00000412806 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP33.52■■■□□ 2.96
SH3BP5-204ENST00000412806 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.49■■■□□ 2.95
SH3BP5-204ENST00000412806 ADAMTS12P58397 1594 aa33.42■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.3 ms