RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412542.1

RPSAP61-201, Transcript of ribosomal protein SA pseudogene 61, humanhuman

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Gene RPSAP61, Length 878 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP61-201ENST00000412542 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.17■■■□□ 2.58
RPSAP61-201ENST00000412542 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.92■■■□□ 2.06
RPSAP61-201ENST00000412542 ABCC9O60706 1549 aa27.57■■■□□ 2
RPSAP61-201ENST00000412542 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.43■■□□□ 1.82
RPSAP61-201ENST00000412542 NACADO15069 1562 aa26.3■■□□□ 1.8
RPSAP61-201ENST00000412542 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.25■■□□□ 1.79
RPSAP61-201ENST00000412542 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.98■■□□□ 1.75
RPSAP61-201ENST00000412542 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
RPSAP61-201ENST00000412542 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.78■■□□□ 1.72
RPSAP61-201ENST00000412542 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.76■■□□□ 1.71
RPSAP61-201ENST00000412542 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.67■■□□□ 1.7
RPSAP61-201ENST00000412542 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.52■■□□□ 1.68
RPSAP61-201ENST00000412542 SCRIBQ14160 1630 aa25.45■■□□□ 1.67
RPSAP61-201ENST00000412542 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.4■■□□□ 1.66
RPSAP61-201ENST00000412542 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.34■■□□□ 1.65
RPSAP61-201ENST00000412542 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
RPSAP61-201ENST00000412542 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.92■■□□□ 1.58
RPSAP61-201ENST00000412542 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.81■■□□□ 1.56
RPSAP61-201ENST00000412542 SMARCA4P51532 1647 aa24.28■■□□□ 1.48
RPSAP61-201ENST00000412542 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
RPSAP61-201ENST00000412542 SMARCA2P51531 1590 aa24.22■■□□□ 1.47
RPSAP61-201ENST00000412542 NCAPD3P42695 1498 aa24.2■■□□□ 1.47
RPSAP61-201ENST00000412542 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.19■■□□□ 1.46
RPSAP61-201ENST00000412542 HMGXB3Q12766 1538 aa24.11■■□□□ 1.45
RPSAP61-201ENST00000412542 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
RPSAP61-201ENST00000412542 PEG3Q9GZU2 1588 aa24■■□□□ 1.43
RPSAP61-201ENST00000412542 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.99■■□□□ 1.43
RPSAP61-201ENST00000412542 ERCC6Q03468 1493 aa23.87■■□□□ 1.41
RPSAP61-201ENST00000412542 WIZO95785 1651 aa23.76■■□□□ 1.39
RPSAP61-201ENST00000412542 NESP48681 1621 aa23.71■■□□□ 1.39
RPSAP61-201ENST00000412542 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.69■■□□□ 1.38
RPSAP61-201ENST00000412542 CUX2O14529 1486 aa23.67■■□□□ 1.38
RPSAP61-201ENST00000412542 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
RPSAP61-201ENST00000412542 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.56■■□□□ 1.36
RPSAP61-201ENST00000412542 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
RPSAP61-201ENST00000412542 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.51■■□□□ 1.35
RPSAP61-201ENST00000412542 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.5■■□□□ 1.35
RPSAP61-201ENST00000412542 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
RPSAP61-201ENST00000412542 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.31■■□□□ 1.32
RPSAP61-201ENST00000412542 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.31■■□□□ 1.32
RPSAP61-201ENST00000412542 CFTRP13569 1480 aa23.3■■□□□ 1.32
RPSAP61-201ENST00000412542 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.27■■□□□ 1.32
RPSAP61-201ENST00000412542 WDR62O43379 1518 aa23.23■■□□□ 1.31
RPSAP61-201ENST00000412542 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.2■■□□□ 1.3
RPSAP61-201ENST00000412542 PRDM2Q13029 1718 aa23.19■■□□□ 1.3
RPSAP61-201ENST00000412542 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.18■■□□□ 1.3
RPSAP61-201ENST00000412542 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
RPSAP61-201ENST00000412542 ABCC8Q09428 1581 aa22.89■■□□□ 1.25
RPSAP61-201ENST00000412542 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
RPSAP61-201ENST00000412542 TOPBP1Q92547 1522 aa22.85■■□□□ 1.25
RPSAP61-201ENST00000412542 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.83■■□□□ 1.25
RPSAP61-201ENST00000412542 IFT140Q96RY7 1462 aa22.81■■□□□ 1.24
RPSAP61-201ENST00000412542 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
RPSAP61-201ENST00000412542 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
RPSAP61-201ENST00000412542 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
RPSAP61-201ENST00000412542 OSCARQ8IYS5 282 aa22.61■■□□□ 1.21
RPSAP61-201ENST00000412542 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
RPSAP61-201ENST00000412542 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.55■■□□□ 1.2
RPSAP61-201ENST00000412542 CUX1P39880 1505 aa22.55■■□□□ 1.2
RPSAP61-201ENST00000412542 SOGA1O94964 1423 aa22.55■■□□□ 1.2
RPSAP61-201ENST00000412542 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.52■■□□□ 1.2
RPSAP61-201ENST00000412542 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.51■■□□□ 1.19
RPSAP61-201ENST00000412542 WDR97A6NE52 1622 aa22.49■■□□□ 1.19
RPSAP61-201ENST00000412542 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
RPSAP61-201ENST00000412542 TRIM41Q8WV44 630 aa22.42■■□□□ 1.18
RPSAP61-201ENST00000412542 CHD1O14646 1710 aa22.42■■□□□ 1.18
RPSAP61-201ENST00000412542 FBLN2P98095 1184 aa22.4■■□□□ 1.18
RPSAP61-201ENST00000412542 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.35■■□□□ 1.17
RPSAP61-201ENST00000412542 GRIN2BQ13224 1484 aa22.34■■□□□ 1.17
RPSAP61-201ENST00000412542 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.33■■□□□ 1.17
RPSAP61-201ENST00000412542 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
RPSAP61-201ENST00000412542 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.31■■□□□ 1.16
RPSAP61-201ENST00000412542 PBRM1Q86U86 1689 aa22.31■■□□□ 1.16
RPSAP61-201ENST00000412542 TOP2BQ02880 1626 aa22.31■■□□□ 1.16
RPSAP61-201ENST00000412542 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.3■■□□□ 1.16
RPSAP61-201ENST00000412542 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.3■■□□□ 1.16
RPSAP61-201ENST00000412542 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.29■■□□□ 1.16
RPSAP61-201ENST00000412542 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.29■■□□□ 1.16
RPSAP61-201ENST00000412542 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.29■■□□□ 1.16
RPSAP61-201ENST00000412542 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
RPSAP61-201ENST00000412542 SYNJ1O43426 1573 aa22.26■■□□□ 1.15
RPSAP61-201ENST00000412542 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.25■■□□□ 1.15
RPSAP61-201ENST00000412542 ARHGEF11O15085 1522 aa22.25■■□□□ 1.15
RPSAP61-201ENST00000412542 SYNJ2O15056 1496 aa22.22■■□□□ 1.15
RPSAP61-201ENST00000412542 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.11■■□□□ 1.13
RPSAP61-201ENST00000412542 ADAMTS12P58397 1594 aa22.08■■□□□ 1.13
RPSAP61-201ENST00000412542 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.06■■□□□ 1.12
RPSAP61-201ENST00000412542 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.06■■□□□ 1.12
RPSAP61-201ENST00000412542 GRIN2AQ12879 1464 aa22.04■■□□□ 1.12
RPSAP61-201ENST00000412542 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.03■■□□□ 1.12
RPSAP61-201ENST00000412542 ARAP1Q96P48 1450 aa22.02■■□□□ 1.12
RPSAP61-201ENST00000412542 CEP170Q5SW79 1584 aa21.92■■□□□ 1.1
RPSAP61-201ENST00000412542 KIF27Q86VH2 1401 aa21.92■■□□□ 1.1
RPSAP61-201ENST00000412542 NUP160Q12769 1436 aa21.91■■□□□ 1.1
RPSAP61-201ENST00000412542 CUL7Q14999 1698 aa21.85■■□□□ 1.09
RPSAP61-201ENST00000412542 SHROOM2Q13796 1616 aa21.8■■□□□ 1.08
RPSAP61-201ENST00000412542 TRHP20396 242 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
RPSAP61-201ENST00000412542 IGF1RP08069 1367 aa21.76■■□□□ 1.07
RPSAP61-201ENST00000412542 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.76■■□□□ 1.07
RPSAP61-201ENST00000412542 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.74■■□□□ 1.07
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