RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412471.5

SLC5A6-204, Transcript of solute carrier family 5 member 6, humanhuman

TSL 5

Gene SLC5A6, Length 917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A6-204ENST00000412471 NISCHQ9Y2I1 1504 aa71.06■■■■■ 8.97
SLC5A6-204ENST00000412471 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa63.26■■■■■ 7.72
SLC5A6-204ENST00000412471 ABCC9O60706 1549 aa61.85■■■■■ 7.49
SLC5A6-204ENST00000412471 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa59.55■■■■■ 7.12
SLC5A6-204ENST00000412471 NACADO15069 1562 aa59.47■■■■■ 7.11
SLC5A6-204ENST00000412471 DCAF8L2P0C7V8 631 aa59.26■■■■■ 7.08
SLC5A6-204ENST00000412471 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP59.2■■■■■ 7.07
SLC5A6-204ENST00000412471 MYO15BQ96JP2 1530 aa59.12■■■■■ 7.05
SLC5A6-204ENST00000412471 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa58.84■■■■■ 7.01
SLC5A6-204ENST00000412471 UNC13AQ9UPW8 1703 aa58.16■■■■■ 6.9
SLC5A6-204ENST00000412471 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP57.73■■■■■ 6.83
SLC5A6-204ENST00000412471 BICRAQ9NZM4 1560 aa57.71■■■■■ 6.83
SLC5A6-204ENST00000412471 SCRIBQ14160 1630 aa57.65■■■■■ 6.82
SLC5A6-204ENST00000412471 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa57.2■■■■■ 6.75
SLC5A6-204ENST00000412471 DNAJC5BQ9UF47 199 aa56.74■■■■■ 6.67
SLC5A6-204ENST00000412471 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP56.21■■■■■ 6.59
SLC5A6-204ENST00000412471 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa55.97■■■■■ 6.55
SLC5A6-204ENST00000412471 CECR2Q9BXF3 1484 aa55.61■■■■■ 6.49
SLC5A6-204ENST00000412471 SMARCA4P51532 1647 aa55.16■■■■■ 6.42
SLC5A6-204ENST00000412471 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP55.1■■■■■ 6.41
SLC5A6-204ENST00000412471 NCAPD3P42695 1498 aa54.85■■■■■ 6.37
SLC5A6-204ENST00000412471 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa54.85■■■■■ 6.37
SLC5A6-204ENST00000412471 SMARCA2P51531 1590 aa54.83■■■■■ 6.37
SLC5A6-204ENST00000412471 MROH2BQ7Z745 1585 aa54.73■■■■■ 6.35
SLC5A6-204ENST00000412471 PEG3Q9GZU2 1588 aa54.64■■■■■ 6.34
SLC5A6-204ENST00000412471 HMGXB3Q12766 1538 aa54.61■■■■■ 6.33
SLC5A6-204ENST00000412471 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP54.41■■■■■ 6.3
SLC5A6-204ENST00000412471 WIZO95785 1651 aa54.14■■■■■ 6.26
SLC5A6-204ENST00000412471 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP54.09■■■■■ 6.25
SLC5A6-204ENST00000412471 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP53.62■■■■■ 6.17
SLC5A6-204ENST00000412471 NESP48681 1621 aa53.5■■■■■ 6.15
SLC5A6-204ENST00000412471 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa53.44■■■■■ 6.14
SLC5A6-204ENST00000412471 ERCC6Q03468 1493 aa53.35■■■■■ 6.13
SLC5A6-204ENST00000412471 CADPSQ9ULU8 1353 aa53.23■■■■■ 6.11
SLC5A6-204ENST00000412471 PDS5BQ9NTI5 1447 aa53.05■■■■■ 6.08
SLC5A6-204ENST00000412471 CCDC88BA6NC98 1476 aa52.93■■■■■ 6.06
SLC5A6-204ENST00000412471 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa52.91■■■■■ 6.06
SLC5A6-204ENST00000412471 CFTRP13569 1480 aa52.91■■■■■ 6.06
SLC5A6-204ENST00000412471 CUX2O14529 1486 aa52.83■■■■■ 6.05
SLC5A6-204ENST00000412471 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP52.76■■■■■ 6.04
SLC5A6-204ENST00000412471 FANCD2Q9BXW9 1451 aa52.63■■■■■ 6.01
SLC5A6-204ENST00000412471 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP52.6■■■■■ 6.01
SLC5A6-204ENST00000412471 CEP164Q9UPV0 1460 aa52.59■■■■■ 6.01
SLC5A6-204ENST00000412471 PRDM2Q13029 1718 aa52.57■■■■■ 6.01
SLC5A6-204ENST00000412471 MRC2Q9UBG0 1479 aa52.52■■■■■ 6
SLC5A6-204ENST00000412471 WDR62O43379 1518 aa52.35■■■■■ 5.97
SLC5A6-204ENST00000412471 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP52.1■■■■■ 5.93
SLC5A6-204ENST00000412471 ABCC8Q09428 1581 aa51.81■■■■■ 5.88
SLC5A6-204ENST00000412471 TOPBP1Q92547 1522 aa51.79■■■■■ 5.88
SLC5A6-204ENST00000412471 DNMBPQ6XZF7 1577 aa51.74■■■■■ 5.87
SLC5A6-204ENST00000412471 IFT140Q96RY7 1462 aa51.49■■■■■ 5.83
SLC5A6-204ENST00000412471 CUX1P39880 1505 aa51.36■■■■■ 5.81
SLC5A6-204ENST00000412471 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP51.34■■■■■ 5.81
SLC5A6-204ENST00000412471 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP51.23■■■■■ 5.79
SLC5A6-204ENST00000412471 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP51.21■■■■■ 5.79
SLC5A6-204ENST00000412471 FGD5Q6ZNL6 1462 aa51.21■■■■■ 5.79
SLC5A6-204ENST00000412471 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa51.2■■■■■ 5.79
SLC5A6-204ENST00000412471 SOGA1O94964 1423 aa51.1■■■■■ 5.77
SLC5A6-204ENST00000412471 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa51.08■■■■■ 5.77
SLC5A6-204ENST00000412471 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP51.06■■■■■ 5.77
SLC5A6-204ENST00000412471 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP51.03■■■■■ 5.76
SLC5A6-204ENST00000412471 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa50.95■■■■■ 5.75
SLC5A6-204ENST00000412471 TOP2BQ02880 1626 aa50.94■■■■■ 5.74
SLC5A6-204ENST00000412471 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP50.9■■■■■ 5.742e-6■■■■■ 27.7
SLC5A6-204ENST00000412471 SYNJ1O43426 1573 aa50.89■■■■■ 5.74
SLC5A6-204ENST00000412471 WDR97A6NE52 1622 aa50.89■■■■■ 5.74
SLC5A6-204ENST00000412471 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP50.8■■■■■ 5.72
SLC5A6-204ENST00000412471 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa50.72■■■■■ 5.71
SLC5A6-204ENST00000412471 OSCARQ8IYS5 282 aa50.57■■■■■ 5.69
SLC5A6-204ENST00000412471 GRIN2BQ13224 1484 aa50.55■■■■■ 5.68
SLC5A6-204ENST00000412471 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa50.54■■■■■ 5.68
SLC5A6-204ENST00000412471 GAPVD1Q14C86 1478 aa50.53■■■■■ 5.68
SLC5A6-204ENST00000412471 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa50.47■■■■■ 5.67
SLC5A6-204ENST00000412471 PBRM1Q86U86 1689 aa50.45■■■■■ 5.67
SLC5A6-204ENST00000412471 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP50.45■■■■■ 5.67
SLC5A6-204ENST00000412471 CHD1O14646 1710 aa50.42■■■■■ 5.66
SLC5A6-204ENST00000412471 FBLN2P98095 1184 aa50.28■■■■■ 5.64
SLC5A6-204ENST00000412471 SYNJ2O15056 1496 aa50.23■■■■■ 5.63
SLC5A6-204ENST00000412471 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP50.17■■■■■ 5.62
SLC5A6-204ENST00000412471 ERICH3Q5RHP9 1530 aa50.13■■■■■ 5.62
SLC5A6-204ENST00000412471 ADAMTS12P58397 1594 aa50.07■■■■■ 5.61
SLC5A6-204ENST00000412471 KIF27Q86VH2 1401 aa49.97■■■■■ 5.59
SLC5A6-204ENST00000412471 FHAD1B1AJZ9 1412 aa49.96■■■■■ 5.59
SLC5A6-204ENST00000412471 GRIN2AQ12879 1464 aa49.89■■■■■ 5.58
SLC5A6-204ENST00000412471 CLASP1Q7Z460 1538 aa49.89■■■■■ 5.58
SLC5A6-204ENST00000412471 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa49.81■■■■■ 5.56
SLC5A6-204ENST00000412471 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa49.81■■■■■ 5.56
SLC5A6-204ENST00000412471 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa49.81■■■■■ 5.56
SLC5A6-204ENST00000412471 ARHGEF11O15085 1522 aa49.8■■■■■ 5.56
SLC5A6-204ENST00000412471 IGF1RP08069 1367 aa49.72■■■■■ 5.55
SLC5A6-204ENST00000412471 TRIM41Q8WV44 630 aa49.72■■■■■ 5.55
SLC5A6-204ENST00000412471 NUP160Q12769 1436 aa49.68■■■■■ 5.54
SLC5A6-204ENST00000412471 CUL7Q14999 1698 aa49.68■■■■■ 5.54
SLC5A6-204ENST00000412471 CEP170Q5SW79 1584 aa49.64■■■■■ 5.54
SLC5A6-204ENST00000412471 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa49.44■■■■■ 5.51
SLC5A6-204ENST00000412471 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa49.43■■■■■ 5.5
SLC5A6-204ENST00000412471 ARAP1Q96P48 1450 aa49.38■■■■■ 5.5
SLC5A6-204ENST00000412471 SHROOM2Q13796 1616 aa49.33■■■■■ 5.49
SLC5A6-204ENST00000412471 CYB5RLQ6IPT4 315 aa49.26■■■■■ 5.48
SLC5A6-204ENST00000412471 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa49.19■■■■■ 5.46
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