RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412051.5

C7orf50-204, Transcript of chromosome 7 open reading frame 50, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2

Gene C7orf50, Length 1,147 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C7orf50-204ENST00000412051 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.32■■■■■ 6.29
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C7orf50-204ENST00000412051 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.69■■■■■ 5.07
C7orf50-204ENST00000412051 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.69■■■■■ 5.06
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C7orf50-204ENST00000412051 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.86■■■■■ 4.93
C7orf50-204ENST00000412051 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.5■■■■■ 4.87
C7orf50-204ENST00000412051 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.47■■■■■ 4.87
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C7orf50-204ENST00000412051 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.78■■■■■ 4.76
C7orf50-204ENST00000412051 SCRIBQ14160 1630 aa44.61■■■■■ 4.73
C7orf50-204ENST00000412051 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.61■■■■■ 4.73
C7orf50-204ENST00000412051 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.55■■■■■ 4.72
C7orf50-204ENST00000412051 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.42■■■■■ 4.7
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C7orf50-204ENST00000412051 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.01■■■■■ 4.48
C7orf50-204ENST00000412051 NCAPD3P42695 1498 aa42.74■■■■■ 4.43
C7orf50-204ENST00000412051 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.6■■■■■ 4.41
C7orf50-204ENST00000412051 CUX2O14529 1486 aa42.57■■■■■ 4.41
C7orf50-204ENST00000412051 ERCC6Q03468 1493 aa42.52■■■■■ 4.4
C7orf50-204ENST00000412051 SMARCA4P51532 1647 aa42.49■■■■■ 4.39
C7orf50-204ENST00000412051 HMGXB3Q12766 1538 aa42.4■■■■■ 4.38
C7orf50-204ENST00000412051 SMARCA2P51531 1590 aa42.39■■■■■ 4.38
C7orf50-204ENST00000412051 NESP48681 1621 aa42.32■■■■■ 4.37
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C7orf50-204ENST00000412051 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.05■■■■■ 4.32
C7orf50-204ENST00000412051 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.96■■■■■ 4.31
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C7orf50-204ENST00000412051 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.84■■■■■ 4.29
C7orf50-204ENST00000412051 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.78■■■■■ 4.28
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C7orf50-204ENST00000412051 WIZO95785 1651 aa41.43■■■■■ 4.22
C7orf50-204ENST00000412051 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.41■■■■■ 4.22
C7orf50-204ENST00000412051 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.28■■■■■ 4.2
C7orf50-204ENST00000412051 WDR62O43379 1518 aa41.23■■■■■ 4.19
C7orf50-204ENST00000412051 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.02■■■■■ 4.16
C7orf50-204ENST00000412051 TRIM41Q8WV44 630 aa40.99■■■■■ 4.15
C7orf50-204ENST00000412051 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.97■■■■■ 4.15
C7orf50-204ENST00000412051 CFTRP13569 1480 aa40.89■■■■■ 4.14
C7orf50-204ENST00000412051 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.85■■■■■ 4.13
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C7orf50-204ENST00000412051 PRDM2Q13029 1718 aa40.53■■■■■ 4.08
C7orf50-204ENST00000412051 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.35■■■■■ 4.05
C7orf50-204ENST00000412051 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.31■■■■■ 4.04
C7orf50-204ENST00000412051 IFT140Q96RY7 1462 aa40.21■■■■■ 4.03
C7orf50-204ENST00000412051 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.2■■■■■ 4.03
C7orf50-204ENST00000412051 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.2■■■■■ 4.03
C7orf50-204ENST00000412051 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.2■■■■■ 4.03
C7orf50-204ENST00000412051 TOPBP1Q92547 1522 aa40.18■■■■■ 4.02
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C7orf50-204ENST00000412051 CHD1O14646 1710 aa39.87■■■■□ 3.97
C7orf50-204ENST00000412051 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.86■■■■□ 3.97
C7orf50-204ENST00000412051 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.75■■■■□ 3.95
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C7orf50-204ENST00000412051 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.66■■■■□ 3.94
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C7orf50-204ENST00000412051 FBLN2P98095 1184 aa39.58■■■■□ 3.93
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C7orf50-204ENST00000412051 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.35■■■■□ 3.89
C7orf50-204ENST00000412051 WDR97A6NE52 1622 aa39.33■■■■□ 3.89
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C7orf50-204ENST00000412051 GRIN2BQ13224 1484 aa39.2■■■■□ 3.87
C7orf50-204ENST00000412051 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.2■■■■□ 3.87
C7orf50-204ENST00000412051 PBRM1Q86U86 1689 aa39.15■■■■□ 3.86
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C7orf50-204ENST00000412051 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.03■■■■□ 3.84
C7orf50-204ENST00000412051 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.99■■■■□ 3.83
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C7orf50-204ENST00000412051 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.8■■■■□ 3.8
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C7orf50-204ENST00000412051 GRIN2AQ12879 1464 aa38.73■■■■□ 3.79
C7orf50-204ENST00000412051 ADAMTS12P58397 1594 aa38.71■■■■□ 3.79
C7orf50-204ENST00000412051 CEP170Q5SW79 1584 aa38.7■■■■□ 3.79
C7orf50-204ENST00000412051 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.65■■■■□ 3.78
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C7orf50-204ENST00000412051 TOP2BQ02880 1626 aa38.62■■■■□ 3.77
C7orf50-204ENST00000412051 NUP160Q12769 1436 aa38.62■■■■□ 3.77
C7orf50-204ENST00000412051 SHROOM2Q13796 1616 aa38.55■■■■□ 3.76
C7orf50-204ENST00000412051 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.49■■■■□ 3.75
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C7orf50-204ENST00000412051 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP38.38■■■■□ 3.73
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C7orf50-204ENST00000412051 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.18■■■■□ 3.7
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