RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411858.1

CCZ1B-202, Transcript of CCZ1 homolog B, vacuolar protein trafficking and biogenesis associated, humanhuman

TSL 5

Gene CCZ1B, Length 571 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCZ1B-202ENST00000411858 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.56■■■■■ 7.28
CCZ1B-202ENST00000411858 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa54.23■■■■■ 6.27
CCZ1B-202ENST00000411858 ABCC9O60706 1549 aa53.73■■■■■ 6.19
CCZ1B-202ENST00000411858 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa51.35■■■■■ 5.81
CCZ1B-202ENST00000411858 NACADO15069 1562 aa51.1■■■■■ 5.77
CCZ1B-202ENST00000411858 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.82■■■■■ 5.73
CCZ1B-202ENST00000411858 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.55■■■■■ 5.68
CCZ1B-202ENST00000411858 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.36■■■■■ 5.65
CCZ1B-202ENST00000411858 UNC13AQ9UPW8 1703 aa50.34■■■■■ 5.65
CCZ1B-202ENST00000411858 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.04■■■■■ 5.6
CCZ1B-202ENST00000411858 DNAJC5BQ9UF47 199 aa50.03■■■■■ 5.6
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CCZ1B-202ENST00000411858 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.92■■■■■ 5.58
CCZ1B-202ENST00000411858 SCRIBQ14160 1630 aa49.38■■■■■ 5.49
CCZ1B-202ENST00000411858 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.25■■■■■ 5.47
CCZ1B-202ENST00000411858 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.61■■■■■ 5.37
CCZ1B-202ENST00000411858 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP48.61■■■■■ 5.37
CCZ1B-202ENST00000411858 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.35■■■■■ 5.33
CCZ1B-202ENST00000411858 SMARCA4P51532 1647 aa47.17■■■■■ 5.14
CCZ1B-202ENST00000411858 NCAPD3P42695 1498 aa47.14■■■■■ 5.14
CCZ1B-202ENST00000411858 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47.06■■■■■ 5.12
CCZ1B-202ENST00000411858 SMARCA2P51531 1590 aa46.95■■■■■ 5.11
CCZ1B-202ENST00000411858 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.94■■■■■ 5.11
CCZ1B-202ENST00000411858 HMGXB3Q12766 1538 aa46.89■■■■■ 5.1
CCZ1B-202ENST00000411858 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.73■■■■■ 5.07
CCZ1B-202ENST00000411858 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.7■■■■■ 5.07
CCZ1B-202ENST00000411858 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.6■■■■■ 5.05
CCZ1B-202ENST00000411858 ERCC6Q03468 1493 aa46.31■■■■■ 5
CCZ1B-202ENST00000411858 NESP48681 1621 aa46.3■■■■■ 5
CCZ1B-202ENST00000411858 CUX2O14529 1486 aa46.18■■■■■ 4.98
CCZ1B-202ENST00000411858 WIZO95785 1651 aa46.16■■■■■ 4.98
CCZ1B-202ENST00000411858 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.11■■■■■ 4.97
CCZ1B-202ENST00000411858 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa46.05■■■■■ 4.96
CCZ1B-202ENST00000411858 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.85■■■■■ 4.93
CCZ1B-202ENST00000411858 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.8■■■■■ 4.92
CCZ1B-202ENST00000411858 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.68■■■■■ 4.9
CCZ1B-202ENST00000411858 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.68■■■■■ 4.9
CCZ1B-202ENST00000411858 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.62■■■■■ 4.89
CCZ1B-202ENST00000411858 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.6■■■■■ 4.89
CCZ1B-202ENST00000411858 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.34■■■■■ 4.85
CCZ1B-202ENST00000411858 CFTRP13569 1480 aa45.29■■■■■ 4.84
CCZ1B-202ENST00000411858 WDR62O43379 1518 aa45.26■■■■■ 4.84
CCZ1B-202ENST00000411858 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.22■■■■■ 4.83
CCZ1B-202ENST00000411858 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.19■■■■■ 4.82
CCZ1B-202ENST00000411858 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.17■■■■■ 4.82
CCZ1B-202ENST00000411858 PRDM2Q13029 1718 aa45.03■■■■■ 4.8
CCZ1B-202ENST00000411858 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.85■■■■■ 4.77
CCZ1B-202ENST00000411858 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.85■■■■■ 4.77
CCZ1B-202ENST00000411858 TOPBP1Q92547 1522 aa44.41■■■■■ 4.7
CCZ1B-202ENST00000411858 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.31■■■■■ 4.68
CCZ1B-202ENST00000411858 IFT140Q96RY7 1462 aa44.29■■■■■ 4.68
CCZ1B-202ENST00000411858 ABCC8Q09428 1581 aa44.28■■■■■ 4.68
CCZ1B-202ENST00000411858 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.21■■■■■ 4.67
CCZ1B-202ENST00000411858 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP44.05■■■■■ 4.64
CCZ1B-202ENST00000411858 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP44.05■■■■■ 4.64
CCZ1B-202ENST00000411858 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.99■■■■■ 4.63
CCZ1B-202ENST00000411858 OSCARQ8IYS5 282 aa43.98■■■■■ 4.63
CCZ1B-202ENST00000411858 CUX1P39880 1505 aa43.81■■■■■ 4.6
CCZ1B-202ENST00000411858 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.81■■■■■ 4.6
CCZ1B-202ENST00000411858 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.78■■■■■ 4.6
CCZ1B-202ENST00000411858 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.76■■■■■ 4.6
CCZ1B-202ENST00000411858 TRIM41Q8WV44 630 aa43.72■■■■■ 4.59
CCZ1B-202ENST00000411858 SOGA1O94964 1423 aa43.7■■■■■ 4.59
CCZ1B-202ENST00000411858 CHD1O14646 1710 aa43.68■■■■■ 4.58
CCZ1B-202ENST00000411858 WDR97A6NE52 1622 aa43.62■■■■■ 4.57
CCZ1B-202ENST00000411858 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43.57■■■■■ 4.57
CCZ1B-202ENST00000411858 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.57■■■■■ 4.57
CCZ1B-202ENST00000411858 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.57■■■■■ 4.57
CCZ1B-202ENST00000411858 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.56■■■■■ 4.56
CCZ1B-202ENST00000411858 ARHGEF11O15085 1522 aa43.43■■■■■ 4.54
CCZ1B-202ENST00000411858 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.43■■■■■ 4.54
CCZ1B-202ENST00000411858 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.42■■■■■ 4.54
CCZ1B-202ENST00000411858 GRIN2BQ13224 1484 aa43.33■■■■■ 4.53
CCZ1B-202ENST00000411858 SYNJ1O43426 1573 aa43.33■■■■■ 4.53
CCZ1B-202ENST00000411858 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.32■■■■■ 4.53
CCZ1B-202ENST00000411858 PBRM1Q86U86 1689 aa43.31■■■■■ 4.52
CCZ1B-202ENST00000411858 TOP2BQ02880 1626 aa43.31■■■■■ 4.52
CCZ1B-202ENST00000411858 FBLN2P98095 1184 aa43.3■■■■■ 4.52
CCZ1B-202ENST00000411858 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.29■■■■■ 4.52
CCZ1B-202ENST00000411858 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.29■■■■■ 4.52
CCZ1B-202ENST00000411858 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.26■■■■■ 4.52
CCZ1B-202ENST00000411858 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.22■■■■■ 4.51
CCZ1B-202ENST00000411858 CLASP1Q7Z460 1538 aa43.17■■■■■ 4.5
CCZ1B-202ENST00000411858 SYNJ2O15056 1496 aa43.15■■■■■ 4.5
CCZ1B-202ENST00000411858 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.08■■■■■ 4.49
CCZ1B-202ENST00000411858 ARAP1Q96P48 1450 aa43.06■■■■■ 4.48
CCZ1B-202ENST00000411858 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.93■■■■■ 4.46
CCZ1B-202ENST00000411858 ADAMTS12P58397 1594 aa42.9■■■■■ 4.46
CCZ1B-202ENST00000411858 GRIN2AQ12879 1464 aa42.81■■■■■ 4.44
CCZ1B-202ENST00000411858 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.76■■■■■ 4.44
CCZ1B-202ENST00000411858 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.69■■■■■ 4.42
CCZ1B-202ENST00000411858 CEP170Q5SW79 1584 aa42.69■■■■■ 4.42
CCZ1B-202ENST00000411858 NUP160Q12769 1436 aa42.66■■■■■ 4.42
CCZ1B-202ENST00000411858 KIF27Q86VH2 1401 aa42.53■■■■■ 4.4
CCZ1B-202ENST00000411858 ERCC6L2Q5T890 1561 aa42.51■■■■■ 4.4
CCZ1B-202ENST00000411858 IGF1RP08069 1367 aa42.5■■■■■ 4.39
CCZ1B-202ENST00000411858 SHROOM2Q13796 1616 aa42.49■■■■■ 4.39
CCZ1B-202ENST00000411858 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.3■■■■■ 4.36
CCZ1B-202ENST00000411858 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42.28■■■■■ 4.36
CCZ1B-202ENST00000411858 CUL7Q14999 1698 aa42.24■■■■■ 4.35
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