RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409958.6

VSX1-204, Transcript of visual system homeobox 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene VSX1, Length 1,305 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX1-204ENST00000409958 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.51■■■■■ 5.68
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VSX1-204ENST00000409958 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.36■■■■□ 3.57
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VSX1-204ENST00000409958 TOPBP1Q92547 1522 aa36.81■■■■□ 3.48
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VSX1-204ENST00000409958 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.7■■■■□ 3.47
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VSX1-204ENST00000409958 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa34.97■■■■□ 3.19
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