RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398804.7

KDM4A-AS1-201, KDM4A antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene KDM4A-AS1, Length 592 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4A-AS1-201ENST00000398804 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.89■■■■□ 3.82
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KDM4A-AS1-201ENST00000398804 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.17■■■□□ 2.9
KDM4A-AS1-201ENST00000398804 NACADO15069 1562 aa32.99■■■□□ 2.87
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KDM4A-AS1-201ENST00000398804 DNAJC5BQ9UF47 199 aa32.66■■■□□ 2.82
KDM4A-AS1-201ENST00000398804 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.61■■■□□ 2.81
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KDM4A-AS1-201ENST00000398804 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.23■■■□□ 2.75
KDM4A-AS1-201ENST00000398804 BICRAQ9NZM4 1560 aa32.21■■■□□ 2.75
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KDM4A-AS1-201ENST00000398804 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.84■■■□□ 2.69
KDM4A-AS1-201ENST00000398804 SCRIBQ14160 1630 aa31.71■■■□□ 2.67
KDM4A-AS1-201ENST00000398804 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.45■■■□□ 2.62
KDM4A-AS1-201ENST00000398804 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.41■■■□□ 2.62
KDM4A-AS1-201ENST00000398804 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.37■■■□□ 2.61
KDM4A-AS1-201ENST00000398804 NCAPD3P42695 1498 aa30.48■■■□□ 2.47
KDM4A-AS1-201ENST00000398804 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.36■■■□□ 2.45
KDM4A-AS1-201ENST00000398804 SMARCA4P51532 1647 aa30.29■■■□□ 2.44
KDM4A-AS1-201ENST00000398804 SMARCA2P51531 1590 aa30.27■■■□□ 2.44
KDM4A-AS1-201ENST00000398804 HMGXB3Q12766 1538 aa30.22■■■□□ 2.43
KDM4A-AS1-201ENST00000398804 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.18■■■□□ 2.42
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KDM4A-AS1-201ENST00000398804 CUX2O14529 1486 aa30.04■■■□□ 2.4
KDM4A-AS1-201ENST00000398804 ERCC6Q03468 1493 aa30.04■■■□□ 2.4
KDM4A-AS1-201ENST00000398804 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.03■■■□□ 2.4
KDM4A-AS1-201ENST00000398804 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa30.01■■■□□ 2.39
KDM4A-AS1-201ENST00000398804 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.94■■■□□ 2.38
KDM4A-AS1-201ENST00000398804 NESP48681 1621 aa29.9■■■□□ 2.38
KDM4A-AS1-201ENST00000398804 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.74■■■□□ 2.35
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KDM4A-AS1-201ENST00000398804 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
KDM4A-AS1-201ENST00000398804 WIZO95785 1651 aa29.55■■■□□ 2.32
KDM4A-AS1-201ENST00000398804 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.54■■■□□ 2.32
KDM4A-AS1-201ENST00000398804 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.49■■■□□ 2.31
KDM4A-AS1-201ENST00000398804 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.37■■■□□ 2.29
KDM4A-AS1-201ENST00000398804 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.3■■■□□ 2.28
KDM4A-AS1-201ENST00000398804 WDR62O43379 1518 aa29.23■■■□□ 2.27
KDM4A-AS1-201ENST00000398804 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
KDM4A-AS1-201ENST00000398804 CFTRP13569 1480 aa29.21■■■□□ 2.27
KDM4A-AS1-201ENST00000398804 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.18■■■□□ 2.26
KDM4A-AS1-201ENST00000398804 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.17■■■□□ 2.26
KDM4A-AS1-201ENST00000398804 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
KDM4A-AS1-201ENST00000398804 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.9■■■□□ 2.22
KDM4A-AS1-201ENST00000398804 PRDM2Q13029 1718 aa28.84■■■□□ 2.21
KDM4A-AS1-201ENST00000398804 OSCARQ8IYS5 282 aa28.69■■■□□ 2.18
KDM4A-AS1-201ENST00000398804 IFT140Q96RY7 1462 aa28.63■■■□□ 2.17
KDM4A-AS1-201ENST00000398804 TOPBP1Q92547 1522 aa28.62■■■□□ 2.17
KDM4A-AS1-201ENST00000398804 TRIM41Q8WV44 630 aa28.61■■■□□ 2.17
KDM4A-AS1-201ENST00000398804 ABCC8Q09428 1581 aa28.61■■■□□ 2.17
KDM4A-AS1-201ENST00000398804 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
KDM4A-AS1-201ENST00000398804 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.51■■■□□ 2.15
KDM4A-AS1-201ENST00000398804 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
KDM4A-AS1-201ENST00000398804 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
KDM4A-AS1-201ENST00000398804 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
KDM4A-AS1-201ENST00000398804 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.3■■■□□ 2.12
KDM4A-AS1-201ENST00000398804 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa28.24■■■□□ 2.11
KDM4A-AS1-201ENST00000398804 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa28.24■■■□□ 2.11
KDM4A-AS1-201ENST00000398804 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa28.24■■■□□ 2.11
KDM4A-AS1-201ENST00000398804 SOGA1O94964 1423 aa28.21■■■□□ 2.11
KDM4A-AS1-201ENST00000398804 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.2■■■□□ 2.1
KDM4A-AS1-201ENST00000398804 ARHGEF11O15085 1522 aa28.18■■■□□ 2.1
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KDM4A-AS1-201ENST00000398804 CUX1P39880 1505 aa28.13■■■□□ 2.09
KDM4A-AS1-201ENST00000398804 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
KDM4A-AS1-201ENST00000398804 CHD1O14646 1710 aa28.13■■■□□ 2.09
KDM4A-AS1-201ENST00000398804 WDR97A6NE52 1622 aa28.11■■■□□ 2.09
KDM4A-AS1-201ENST00000398804 FBLN2P98095 1184 aa28.08■■■□□ 2.09
KDM4A-AS1-201ENST00000398804 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
KDM4A-AS1-201ENST00000398804 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28■■■□□ 2.07
KDM4A-AS1-201ENST00000398804 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27.98■■■□□ 2.07
KDM4A-AS1-201ENST00000398804 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.97■■■□□ 2.07
KDM4A-AS1-201ENST00000398804 GRIN2BQ13224 1484 aa27.96■■■□□ 2.07
KDM4A-AS1-201ENST00000398804 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
KDM4A-AS1-201ENST00000398804 ARAP1Q96P48 1450 aa27.9■■■□□ 2.06
KDM4A-AS1-201ENST00000398804 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.87■■■□□ 2.05
KDM4A-AS1-201ENST00000398804 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.87■■■□□ 2.05
KDM4A-AS1-201ENST00000398804 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.87■■■□□ 2.05
KDM4A-AS1-201ENST00000398804 SYNJ2O15056 1496 aa27.86■■■□□ 2.05
KDM4A-AS1-201ENST00000398804 SYNJ1O43426 1573 aa27.84■■■□□ 2.05
KDM4A-AS1-201ENST00000398804 PBRM1Q86U86 1689 aa27.78■■■□□ 2.04
KDM4A-AS1-201ENST00000398804 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.78■■■□□ 2.04
KDM4A-AS1-201ENST00000398804 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.75■■■□□ 2.03
KDM4A-AS1-201ENST00000398804 TOP2BQ02880 1626 aa27.69■■■□□ 2.02
KDM4A-AS1-201ENST00000398804 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.68■■■□□ 2.02
KDM4A-AS1-201ENST00000398804 TRHP20396 242 aaPredicted RBP27.62■■■□□ 2.01
KDM4A-AS1-201ENST00000398804 GRIN2AQ12879 1464 aa27.59■■■□□ 2.01
KDM4A-AS1-201ENST00000398804 ADAMTS12P58397 1594 aa27.56■■■□□ 2
KDM4A-AS1-201ENST00000398804 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.53■■■□□ 2
KDM4A-AS1-201ENST00000398804 NUP160Q12769 1436 aa27.53■■■□□ 2
KDM4A-AS1-201ENST00000398804 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.51■■■□□ 2
KDM4A-AS1-201ENST00000398804 CEP170Q5SW79 1584 aa27.46■■□□□ 1.99
KDM4A-AS1-201ENST00000398804 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.39■■□□□ 1.98
KDM4A-AS1-201ENST00000398804 SHROOM2Q13796 1616 aa27.38■■□□□ 1.97
KDM4A-AS1-201ENST00000398804 JPH4Q96JJ6 628 aa27.26■■□□□ 1.95
KDM4A-AS1-201ENST00000398804 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27.23■■□□□ 1.95
KDM4A-AS1-201ENST00000398804 IGF1RP08069 1367 aa27.2■■□□□ 1.94
KDM4A-AS1-201ENST00000398804 KIF27Q86VH2 1401 aa27.17■■□□□ 1.94
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