RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393503.2

CNGA3-202, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

TSL 4

Gene CNGA3, Length 569 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-202ENST00000393503 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.73■■■□□ 2.99
CNGA3-202ENST00000393503 ABCC9O60706 1549 aa30.36■■■□□ 2.45
CNGA3-202ENST00000393503 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa30.2■■■□□ 2.43
CNGA3-202ENST00000393503 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.77■■■□□ 2.2
CNGA3-202ENST00000393503 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.66■■■□□ 2.18
CNGA3-202ENST00000393503 NACADO15069 1562 aa28.58■■■□□ 2.17
CNGA3-202ENST00000393503 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.41■■■□□ 2.14
CNGA3-202ENST00000393503 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.28■■■□□ 2.12
CNGA3-202ENST00000393503 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.21■■■□□ 2.11
CNGA3-202ENST00000393503 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.18■■■□□ 2.1
CNGA3-202ENST00000393503 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.09■■■□□ 2.09
CNGA3-202ENST00000393503 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.95■■■□□ 2.07
CNGA3-202ENST00000393503 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.81■■■□□ 2.04
CNGA3-202ENST00000393503 SCRIBQ14160 1630 aa27.59■■■□□ 2.01
CNGA3-202ENST00000393503 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.53■■■□□ 2
CNGA3-202ENST00000393503 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.41■■□□□ 1.98
CNGA3-202ENST00000393503 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
CNGA3-202ENST00000393503 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.32■■□□□ 1.96
CNGA3-202ENST00000393503 NCAPD3P42695 1498 aa26.44■■□□□ 1.82
CNGA3-202ENST00000393503 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.38■■□□□ 1.81
CNGA3-202ENST00000393503 SMARCA4P51532 1647 aa26.31■■□□□ 1.8
CNGA3-202ENST00000393503 HMGXB3Q12766 1538 aa26.21■■□□□ 1.79
CNGA3-202ENST00000393503 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.21■■□□□ 1.79
CNGA3-202ENST00000393503 SMARCA2P51531 1590 aa26.2■■□□□ 1.79
CNGA3-202ENST00000393503 NESP48681 1621 aa26.12■■□□□ 1.77
CNGA3-202ENST00000393503 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
CNGA3-202ENST00000393503 CUX2O14529 1486 aa26.11■■□□□ 1.77
CNGA3-202ENST00000393503 ERCC6Q03468 1493 aa26.11■■□□□ 1.77
CNGA3-202ENST00000393503 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.06■■□□□ 1.76
CNGA3-202ENST00000393503 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
CNGA3-202ENST00000393503 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.04■■□□□ 1.76
CNGA3-202ENST00000393503 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
CNGA3-202ENST00000393503 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.78■■□□□ 1.72
CNGA3-202ENST00000393503 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.71■■□□□ 1.71
CNGA3-202ENST00000393503 WIZO95785 1651 aa25.69■■□□□ 1.7
CNGA3-202ENST00000393503 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.63■■□□□ 1.69
CNGA3-202ENST00000393503 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.62■■□□□ 1.69
CNGA3-202ENST00000393503 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.47■■□□□ 1.67
CNGA3-202ENST00000393503 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
CNGA3-202ENST00000393503 WDR62O43379 1518 aa25.43■■□□□ 1.66
CNGA3-202ENST00000393503 CFTRP13569 1480 aa25.34■■□□□ 1.65
CNGA3-202ENST00000393503 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.34■■□□□ 1.65
CNGA3-202ENST00000393503 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.33■■□□□ 1.65
CNGA3-202ENST00000393503 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
CNGA3-202ENST00000393503 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
CNGA3-202ENST00000393503 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.09■■□□□ 1.61
CNGA3-202ENST00000393503 TRIM41Q8WV44 630 aa25.01■■□□□ 1.59
CNGA3-202ENST00000393503 PRDM2Q13029 1718 aa24.98■■□□□ 1.59
CNGA3-202ENST00000393503 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
CNGA3-202ENST00000393503 OSCARQ8IYS5 282 aa24.88■■□□□ 1.57
CNGA3-202ENST00000393503 TOPBP1Q92547 1522 aa24.86■■□□□ 1.57
CNGA3-202ENST00000393503 IFT140Q96RY7 1462 aa24.82■■□□□ 1.56
CNGA3-202ENST00000393503 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.73■■□□□ 1.55
CNGA3-202ENST00000393503 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
CNGA3-202ENST00000393503 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
CNGA3-202ENST00000393503 ABCC8Q09428 1581 aa24.67■■□□□ 1.54
CNGA3-202ENST00000393503 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.64■■□□□ 1.54
CNGA3-202ENST00000393503 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.64■■□□□ 1.54
CNGA3-202ENST00000393503 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.64■■□□□ 1.54
CNGA3-202ENST00000393503 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.64■■□□□ 1.54
CNGA3-202ENST00000393503 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
CNGA3-202ENST00000393503 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.57■■□□□ 1.52
CNGA3-202ENST00000393503 ARHGEF11O15085 1522 aa24.56■■□□□ 1.52
CNGA3-202ENST00000393503 CHD1O14646 1710 aa24.5■■□□□ 1.51
CNGA3-202ENST00000393503 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
CNGA3-202ENST00000393503 CUX1P39880 1505 aa24.46■■□□□ 1.51
CNGA3-202ENST00000393503 SOGA1O94964 1423 aa24.45■■□□□ 1.51
CNGA3-202ENST00000393503 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.45■■□□□ 1.5
CNGA3-202ENST00000393503 FBLN2P98095 1184 aa24.38■■□□□ 1.49
CNGA3-202ENST00000393503 ARAP1Q96P48 1450 aa24.37■■□□□ 1.49
CNGA3-202ENST00000393503 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.36■■□□□ 1.49
CNGA3-202ENST00000393503 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.35■■□□□ 1.49
CNGA3-202ENST00000393503 WDR97A6NE52 1622 aa24.28■■□□□ 1.48
CNGA3-202ENST00000393503 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.27■■□□□ 1.48
CNGA3-202ENST00000393503 GRIN2BQ13224 1484 aa24.24■■□□□ 1.47
CNGA3-202ENST00000393503 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
CNGA3-202ENST00000393503 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
CNGA3-202ENST00000393503 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
CNGA3-202ENST00000393503 SYNJ2O15056 1496 aa24.17■■□□□ 1.46
CNGA3-202ENST00000393503 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.16■■□□□ 1.46
CNGA3-202ENST00000393503 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.15■■□□□ 1.46
CNGA3-202ENST00000393503 PBRM1Q86U86 1689 aa24.14■■□□□ 1.45
CNGA3-202ENST00000393503 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.13■■□□□ 1.45
CNGA3-202ENST00000393503 SYNJ1O43426 1573 aa24.13■■□□□ 1.45
CNGA3-202ENST00000393503 TRHP20396 242 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
CNGA3-202ENST00000393503 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.99■■□□□ 1.43
CNGA3-202ENST00000393503 TOP2BQ02880 1626 aa23.99■■□□□ 1.43
CNGA3-202ENST00000393503 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.99■■□□□ 1.43
CNGA3-202ENST00000393503 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.97■■□□□ 1.43
CNGA3-202ENST00000393503 GRIN2AQ12879 1464 aa23.96■■□□□ 1.43
CNGA3-202ENST00000393503 ADAMTS12P58397 1594 aa23.95■■□□□ 1.43
CNGA3-202ENST00000393503 CEP170Q5SW79 1584 aa23.92■■□□□ 1.42
CNGA3-202ENST00000393503 NUP160Q12769 1436 aa23.91■■□□□ 1.42
CNGA3-202ENST00000393503 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.84■■□□□ 1.41
CNGA3-202ENST00000393503 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.81■■□□□ 1.4
CNGA3-202ENST00000393503 SHROOM2Q13796 1616 aa23.8■■□□□ 1.4
CNGA3-202ENST00000393503 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
CNGA3-202ENST00000393503 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.62■■□□□ 1.37
CNGA3-202ENST00000393503 JPH4Q96JJ6 628 aa23.61■■□□□ 1.37
CNGA3-202ENST00000393503 IGF1RP08069 1367 aa23.57■■□□□ 1.36
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